RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527549.5

TSTA3-206, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 2

Gene TSTA3, Length 575 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-206ENST00000527549 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
TSTA3-206ENST00000527549 PLEKHD1A6NEE1 506 aa26.62■■□□□ 1.85
TSTA3-206ENST00000527549 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
TSTA3-206ENST00000527549 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
TSTA3-206ENST00000527549 PLPPR3Q6T4P5 718 aa26.61■■□□□ 1.85
TSTA3-206ENST00000527549 ATP10AO60312 1499 aa26.6■■□□□ 1.85
TSTA3-206ENST00000527549 PTPRTO14522 1441 aa26.57■■□□□ 1.84
TSTA3-206ENST00000527549 C9orf84Q5VXU9 1444 aa26.56■■□□□ 1.84
TSTA3-206ENST00000527549 MLECQ14165 292 aa26.56■■□□□ 1.84
TSTA3-206ENST00000527549 IQSEC2Q5JU85 1478 aa26.55■■□□□ 1.84
TSTA3-206ENST00000527549 SCAPERQ9BY12 1400 aa26.54■■□□□ 1.84
TSTA3-206ENST00000527549 LTBP4Q8N2S1 1624 aa26.54■■□□□ 1.84
TSTA3-206ENST00000527549 PLCH2O75038 1416 aa26.53■■□□□ 1.84
TSTA3-206ENST00000527549 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa26.52■■□□□ 1.84
TSTA3-206ENST00000527549 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
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TSTA3-206ENST00000527549 KDM5CP41229 1560 aa26.43■■□□□ 1.82
TSTA3-206ENST00000527549 C3P01024 1663 aa26.41■■□□□ 1.82
TSTA3-206ENST00000527549 CSRNP3Q8WYN3 585 aa26.4■■□□□ 1.82
TSTA3-206ENST00000527549 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa26.39■■□□□ 1.82
TSTA3-206ENST00000527549 MYO5CQ9NQX4 1742 aa26.38■■□□□ 1.81
TSTA3-206ENST00000527549 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
TSTA3-206ENST00000527549 NCOA1Q15788 1441 aa26.36■■□□□ 1.81
TSTA3-206ENST00000527549 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa26.35■■□□□ 1.81
TSTA3-206ENST00000527549 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa26.34■■□□□ 1.81
TSTA3-206ENST00000527549 AGLP35573 1532 aa26.33■■□□□ 1.81
TSTA3-206ENST00000527549 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa26.32■■□□□ 1.8
TSTA3-206ENST00000527549 MLH3Q9UHC1 1453 aa26.29■■□□□ 1.8
TSTA3-206ENST00000527549 ABCA6Q8N139 1617 aa26.27■■□□□ 1.8
TSTA3-206ENST00000527549 AFAP1Q8N556 730 aa26.25■■□□□ 1.79
TSTA3-206ENST00000527549 KIF14Q15058 1648 aa26.23■■□□□ 1.79
TSTA3-206ENST00000527549 EEA1Q15075 1411 aa26.22■■□□□ 1.79
TSTA3-206ENST00000527549 CNTLNQ9NXG0 1405 aa26.22■■□□□ 1.79
TSTA3-206ENST00000527549 NPATQ14207 1427 aa26.2■■□□□ 1.78
TSTA3-206ENST00000527549 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa26.19■■□□□ 1.78
TSTA3-206ENST00000527549 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP26.19■■□□□ 1.78
TSTA3-206ENST00000527549 MROH2AA6NES4 1674 aa26.18■■□□□ 1.78
TSTA3-206ENST00000527549 ARHGAP5Q13017 1502 aa26.18■■□□□ 1.78
TSTA3-206ENST00000527549 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP26.15■■□□□ 1.78
TSTA3-206ENST00000527549 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa26.15■■□□□ 1.78
TSTA3-206ENST00000527549 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa26.12■■□□□ 1.77
TSTA3-206ENST00000527549 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
TSTA3-206ENST00000527549 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
TSTA3-206ENST00000527549 PLA2R1Q13018 1463 aa26.11■■□□□ 1.77
TSTA3-206ENST00000527549 ABCC1P33527 1531 aa26.11■■□□□ 1.77
TSTA3-206ENST00000527549 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
TSTA3-206ENST00000527549 FMN1Q68DA7 1419 aa26.11■■□□□ 1.77
TSTA3-206ENST00000527549 UBAP1LF5GYI3 381 aa26.1■■□□□ 1.77
TSTA3-206ENST00000527549 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
TSTA3-206ENST00000527549 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
TSTA3-206ENST00000527549 ITSN2Q9NZM3 1697 aa26.08■■□□□ 1.77
TSTA3-206ENST00000527549 PREX2Q70Z35 1606 aa26.06■■□□□ 1.76
TSTA3-206ENST00000527549 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
TSTA3-206ENST00000527549 PKD2Q13563 968 aa26.05■■□□□ 1.76
TSTA3-206ENST00000527549 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa26.04■■□□□ 1.76
TSTA3-206ENST00000527549 ZMYM3Q14202 1370 aa26.04■■□□□ 1.76
TSTA3-206ENST00000527549 CLIP1P30622 1438 aa26.04■■□□□ 1.76
TSTA3-206ENST00000527549 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa26.02■■□□□ 1.76
TSTA3-206ENST00000527549 MYT1LQ9UL68 1186 aa26.02■■□□□ 1.76
TSTA3-206ENST00000527549 MYO3AQ8NEV4 1616 aa26.01■■□□□ 1.75
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TSTA3-206ENST00000527549 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa25.98■■□□□ 1.75
TSTA3-206ENST00000527549 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
TSTA3-206ENST00000527549 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa25.95■■□□□ 1.75
TSTA3-206ENST00000527549 PTPRKQ15262 1439 aa25.95■■□□□ 1.74
TSTA3-206ENST00000527549 HSPA1LP34931 641 aa25.93■■□□□ 1.74
TSTA3-206ENST00000527549 PLXNC1O60486 1568 aa25.93■■□□□ 1.74
TSTA3-206ENST00000527549 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa25.92■■□□□ 1.74
TSTA3-206ENST00000527549 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
TSTA3-206ENST00000527549 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
TSTA3-206ENST00000527549 CPS1P31327 1500 aa25.88■■□□□ 1.73
TSTA3-206ENST00000527549 PPP6R1Q9UPN7 881 aa25.88■■□□□ 1.73
TSTA3-206ENST00000527549 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
TSTA3-206ENST00000527549 A2ML1A8K2U0 1454 aa25.84■■□□□ 1.73
TSTA3-206ENST00000527549 TOM1O60784 492 aa25.83■■□□□ 1.73
TSTA3-206ENST00000527549 NEURL4Q96JN8 1562 aa25.82■■□□□ 1.72
TSTA3-206ENST00000527549 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP25.82■■□□□ 1.72
TSTA3-206ENST00000527549 ALKQ9UM73 1620 aa25.82■■□□□ 1.72
TSTA3-206ENST00000527549 ATP7AQ04656 1500 aa25.82■■□□□ 1.72
TSTA3-206ENST00000527549 CCDC18Q5T9S5 1454 aa25.81■■□□□ 1.72
TSTA3-206ENST00000527549 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP25.81■■□□□ 1.72
TSTA3-206ENST00000527549 SYCP2Q9BX26 1530 aa25.8■■□□□ 1.72
TSTA3-206ENST00000527549 A2MP01023 1474 aa25.79■■□□□ 1.72
TSTA3-206ENST00000527549 SHANK2Q9UPX8 1470 aa25.79■■□□□ 1.72
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TSTA3-206ENST00000527549 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa25.78■■□□□ 1.72
TSTA3-206ENST00000527549 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa25.76■■□□□ 1.71
TSTA3-206ENST00000527549 PIP4K2BP78356 416 aa25.75■■□□□ 1.71
TSTA3-206ENST00000527549 VWDEQ8N2E2 1590 aa25.74■■□□□ 1.71
TSTA3-206ENST00000527549 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
TSTA3-206ENST00000527549 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
TSTA3-206ENST00000527549 ADGBQ8N7X0 1667 aa25.71■■□□□ 1.71
TSTA3-206ENST00000527549 UBTFP17480 764 aaKnown RBP25.7■■□□□ 1.7
TSTA3-206ENST00000527549 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa25.7■■□□□ 1.7
TSTA3-206ENST00000527549 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP25.68■■□□□ 1.7
TSTA3-206ENST00000527549 MED14O60244 1454 aa25.67■■□□□ 1.7
TSTA3-206ENST00000527549 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP25.67■■□□□ 1.7
TSTA3-206ENST00000527549 GGT6Q6P531 493 aa25.66■■□□□ 1.7
TSTA3-206ENST00000527549 DEPDC5O75140 1603 aa25.66■■□□□ 1.7
TSTA3-206ENST00000527549 FAM135AQ9P2D6 1515 aa25.64■■□□□ 1.7
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