RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525861.5

ACER3-204, Transcript of alkaline ceramidase 3, humanhuman

TSL 2

Gene ACER3, Length 2,058 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER3-204ENST00000525861 ABCC5O15440 1437 aa34.31■■■■□ 3.08
ACER3-204ENST00000525861 GCC2Q8IWJ2 1684 aa34.28■■■■□ 3.08
ACER3-204ENST00000525861 CHIC2Q9UKJ5 165 aa34.27■■■■□ 3.08
ACER3-204ENST00000525861 PREX2Q70Z35 1606 aa34.25■■■■□ 3.07
ACER3-204ENST00000525861 ROCK1Q13464 1354 aa34.24■■■■□ 3.07
ACER3-204ENST00000525861 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP34.24■■■■□ 3.07
ACER3-204ENST00000525861 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP34.24■■■■□ 3.07
ACER3-204ENST00000525861 TTC37Q6PGP7 1564 aa34.23■■■■□ 3.07
ACER3-204ENST00000525861 MAPKBP1O60336 1514 aa34.21■■■■□ 3.07
ACER3-204ENST00000525861 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa34.21■■■■□ 3.07
ACER3-204ENST00000525861 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa34.2■■■■□ 3.07
ACER3-204ENST00000525861 CROCC2H7BZ55 1655 aa34.17■■■■□ 3.06
ACER3-204ENST00000525861 MYO5CQ9NQX4 1742 aa34.14■■■■□ 3.05
ACER3-204ENST00000525861 KCNH8Q96L42 1107 aa34.12■■■■□ 3.05
ACER3-204ENST00000525861 ADGBQ8N7X0 1667 aa34.11■■■■□ 3.05
ACER3-204ENST00000525861 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa34.1■■■■□ 3.05
ACER3-204ENST00000525861 ADGRL2O95490 1459 aa34.09■■■■□ 3.05
ACER3-204ENST00000525861 WDR7Q9Y4E6 1490 aa34.09■■■■□ 3.05
ACER3-204ENST00000525861 ARHGEF5Q12774 1597 aa34.08■■■■□ 3.05
ACER3-204ENST00000525861 ARHGAP5Q13017 1502 aa34.08■■■■□ 3.05
ACER3-204ENST00000525861 SHANK2Q9UPX8 1470 aa34.08■■■■□ 3.05
ACER3-204ENST00000525861 KDM6BO15054 1643 aa34.07■■■■□ 3.04
ACER3-204ENST00000525861 NCOA1Q15788 1441 aa34.04■■■■□ 3.04
ACER3-204ENST00000525861 MBD5Q9P267 1494 aa34.04■■■■□ 3.04
ACER3-204ENST00000525861 PLCH2O75038 1416 aa34.02■■■■□ 3.04
ACER3-204ENST00000525861 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP34■■■■□ 3.03
ACER3-204ENST00000525861 C9orf84Q5VXU9 1444 aa33.99■■■■□ 3.03
ACER3-204ENST00000525861 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa33.99■■■■□ 3.03
ACER3-204ENST00000525861 CCDC141Q6ZP82 1450 aa33.98■■■■□ 3.03
ACER3-204ENST00000525861 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP33.97■■■■□ 3.031e-6■■■■■ 27.5
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ACER3-204ENST00000525861 ASXL2Q76L83 1435 aa33.97■■■■□ 3.03
ACER3-204ENST00000525861 RSPH4AQ5TD94 716 aa33.97■■■■□ 3.03
ACER3-204ENST00000525861 ARAP3Q8WWN8 1544 aa33.95■■■■□ 3.02
ACER3-204ENST00000525861 SYCP2Q9BX26 1530 aa33.95■■■■□ 3.02
ACER3-204ENST00000525861 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa33.94■■■■□ 3.02
ACER3-204ENST00000525861 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP33.94■■■■□ 3.02
ACER3-204ENST00000525861 TSPY4P0CV99 314 aa33.94■■■■□ 3.02
ACER3-204ENST00000525861 TSPY10P0CW01 314 aa33.94■■■■□ 3.02
ACER3-204ENST00000525861 ABCA9Q8IUA7 1624 aa33.91■■■■□ 3.02
ACER3-204ENST00000525861 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa33.89■■■■□ 3.02
ACER3-204ENST00000525861 TRIM52Q96A61 297 aa33.89■■■■□ 3.02
ACER3-204ENST00000525861 MAST1Q9Y2H9 1570 aa33.84■■■■□ 3.01
ACER3-204ENST00000525861 ABCC1P33527 1531 aa33.83■■■■□ 3.01
ACER3-204ENST00000525861 SIN3AQ96ST3 1273 aa33.83■■■■□ 3.01
ACER3-204ENST00000525861 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP33.82■■■■□ 3.01
ACER3-204ENST00000525861 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa33.82■■■■□ 3
ACER3-204ENST00000525861 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa33.81■■■■□ 3
ACER3-204ENST00000525861 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa33.81■■■■□ 3
ACER3-204ENST00000525861 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa33.81■■■■□ 3
ACER3-204ENST00000525861 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa33.81■■■■□ 3
ACER3-204ENST00000525861 MPHOSPH9Q99550 1183 aa33.78■■■■□ 3
ACER3-204ENST00000525861 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa33.78■■■■□ 3
ACER3-204ENST00000525861 KIF15Q9NS87 1388 aa33.78■■■■□ 3
ACER3-204ENST00000525861 NEUROD1Q13562 356 aa33.76■■■■□ 3
ACER3-204ENST00000525861 FANCAO15360 1455 aa33.73■■■□□ 2.99
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ACER3-204ENST00000525861 PZPP20742 1482 aa33.68■■■□□ 2.98
ACER3-204ENST00000525861 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP33.68■■■□□ 2.98
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ACER3-204ENST00000525861 KDM5DQ9BY66 1539 aa33.61■■■□□ 2.97
ACER3-204ENST00000525861 TONSLQ96HA7 1378 aa33.59■■■□□ 2.97
ACER3-204ENST00000525861 ADGRL1O94910 1474 aa33.59■■■□□ 2.97
ACER3-204ENST00000525861 CD109Q6YHK3 1445 aa33.59■■■□□ 2.97
ACER3-204ENST00000525861 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa33.57■■■□□ 2.96
ACER3-204ENST00000525861 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa33.57■■■□□ 2.96
ACER3-204ENST00000525861 DUOX2Q9NRD8 1548 aa33.57■■■□□ 2.96
ACER3-204ENST00000525861 FOXD1Q16676 465 aa33.55■■■□□ 2.96
ACER3-204ENST00000525861 NUP155O75694 1391 aa33.55■■■□□ 2.96
ACER3-204ENST00000525861 CFAP74Q9C0B2 1584 aa33.54■■■□□ 2.96
ACER3-204ENST00000525861 SCAPERQ9BY12 1400 aa33.54■■■□□ 2.96
ACER3-204ENST00000525861 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP33.53■■■□□ 2.96
ACER3-204ENST00000525861 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa33.53■■■□□ 2.96
ACER3-204ENST00000525861 AFAP1Q8N556 730 aa33.52■■■□□ 2.96
ACER3-204ENST00000525861 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP33.51■■■□□ 2.96
ACER3-204ENST00000525861 ERBINQ96RT1 1412 aa33.5■■■□□ 2.95
ACER3-204ENST00000525861 UNC13BO14795 1591 aa33.49■■■□□ 2.95
ACER3-204ENST00000525861 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP33.48■■■□□ 2.95
ACER3-204ENST00000525861 PKD2Q13563 968 aa33.45■■■□□ 2.95
ACER3-204ENST00000525861 ATP7AQ04656 1500 aa33.45■■■□□ 2.95
ACER3-204ENST00000525861 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP33.45■■■□□ 2.94
ACER3-204ENST00000525861 GLI2P10070 1586 aa33.42■■■□□ 2.94
ACER3-204ENST00000525861 FAM135AQ9P2D6 1515 aa33.41■■■□□ 2.94
ACER3-204ENST00000525861 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa33.4■■■□□ 2.94
ACER3-204ENST00000525861 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa33.4■■■□□ 2.94
ACER3-204ENST00000525861 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP33.39■■■□□ 2.94
ACER3-204ENST00000525861 NEO1Q92859 1461 aa33.39■■■□□ 2.94
ACER3-204ENST00000525861 MAGI2Q86UL8 1455 aa33.38■■■□□ 2.93
ACER3-204ENST00000525861 IQGAP3Q86VI3 1631 aa33.35■■■□□ 2.93
ACER3-204ENST00000525861 POGZQ7Z3K3 1410 aa33.34■■■□□ 2.93
ACER3-204ENST00000525861 KDM5CP41229 1560 aa33.32■■■□□ 2.92
ACER3-204ENST00000525861 DIP2BQ9P265 1576 aa33.31■■■□□ 2.92
ACER3-204ENST00000525861 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa33.3■■■□□ 2.92
ACER3-204ENST00000525861 TEX14Q8IWB6 1497 aa33.29■■■□□ 2.92
ACER3-204ENST00000525861 L3MBTL2Q969R5 705 aa33.27■■■□□ 2.92
ACER3-204ENST00000525861 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP33.27■■■□□ 2.92
ACER3-204ENST00000525861 MYT1LQ9UL68 1186 aa33.26■■■□□ 2.92
ACER3-204ENST00000525861 MLH3Q9UHC1 1453 aa33.24■■■□□ 2.91
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