RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520462.5

TSNARE1-206, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

TSL 4

Gene TSNARE1, Length 589 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-206ENST00000520462 MADDQ8WXG6 1647 aa24.6■■□□□ 1.53
TSNARE1-206ENST00000520462 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
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TSNARE1-206ENST00000520462 PLCH2O75038 1416 aa24.54■■□□□ 1.52
TSNARE1-206ENST00000520462 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa24.54■■□□□ 1.52
TSNARE1-206ENST00000520462 SCAPERQ9BY12 1400 aa24.53■■□□□ 1.52
TSNARE1-206ENST00000520462 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa24.53■■□□□ 1.52
TSNARE1-206ENST00000520462 PLPPR3Q6T4P5 718 aa24.53■■□□□ 1.52
TSNARE1-206ENST00000520462 YEATS2Q9ULM3 1422 aa24.52■■□□□ 1.52
TSNARE1-206ENST00000520462 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
TSNARE1-206ENST00000520462 FBXO41Q8TF61 875 aa24.51■■□□□ 1.51
TSNARE1-206ENST00000520462 POGZQ7Z3K3 1410 aa24.51■■□□□ 1.51
TSNARE1-206ENST00000520462 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa24.5■■□□□ 1.51
TSNARE1-206ENST00000520462 MYO5CQ9NQX4 1742 aa24.49■■□□□ 1.51
TSNARE1-206ENST00000520462 MLECQ14165 292 aa24.49■■□□□ 1.51
TSNARE1-206ENST00000520462 VPS8Q8N3P4 1428 aa24.49■■□□□ 1.51
TSNARE1-206ENST00000520462 MAGI2Q86UL8 1455 aa24.49■■□□□ 1.51
TSNARE1-206ENST00000520462 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa24.44■■□□□ 1.5
TSNARE1-206ENST00000520462 MTUS2Q5JR59 1369 aa24.43■■□□□ 1.5
TSNARE1-206ENST00000520462 ARHGAP5Q13017 1502 aa24.42■■□□□ 1.5
TSNARE1-206ENST00000520462 LMTK3Q96Q04 1460 aa24.42■■□□□ 1.5
TSNARE1-206ENST00000520462 MYT1LQ9UL68 1186 aa24.4■■□□□ 1.5
TSNARE1-206ENST00000520462 ATP10AO60312 1499 aa24.38■■□□□ 1.49
TSNARE1-206ENST00000520462 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa24.37■■□□□ 1.49
TSNARE1-206ENST00000520462 HSPA2P54652 639 aa24.36■■□□□ 1.49
TSNARE1-206ENST00000520462 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa24.36■■□□□ 1.49
TSNARE1-206ENST00000520462 C9orf84Q5VXU9 1444 aa24.35■■□□□ 1.49
TSNARE1-206ENST00000520462 TIAM1Q13009 1591 aa24.35■■□□□ 1.49
TSNARE1-206ENST00000520462 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa24.35■■□□□ 1.49
TSNARE1-206ENST00000520462 AFAP1Q8N556 730 aa24.35■■□□□ 1.49
TSNARE1-206ENST00000520462 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa24.35■■□□□ 1.49
TSNARE1-206ENST00000520462 PREX2Q70Z35 1606 aa24.35■■□□□ 1.49
TSNARE1-206ENST00000520462 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa24.34■■□□□ 1.49
TSNARE1-206ENST00000520462 APLP2Q06481 763 aa24.31■■□□□ 1.48
TSNARE1-206ENST00000520462 CCNB3Q8WWL7 1395 aa24.29■■□□□ 1.48
TSNARE1-206ENST00000520462 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
TSNARE1-206ENST00000520462 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa24.28■■□□□ 1.48
TSNARE1-206ENST00000520462 KDM5CP41229 1560 aa24.28■■□□□ 1.48
TSNARE1-206ENST00000520462 MAP3K1Q13233 1512 aa24.27■■□□□ 1.48
TSNARE1-206ENST00000520462 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
TSNARE1-206ENST00000520462 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
TSNARE1-206ENST00000520462 ITSN2Q9NZM3 1697 aa24.24■■□□□ 1.47
TSNARE1-206ENST00000520462 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa24.23■■□□□ 1.47
TSNARE1-206ENST00000520462 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa24.23■■□□□ 1.47
TSNARE1-206ENST00000520462 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
TSNARE1-206ENST00000520462 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
TSNARE1-206ENST00000520462 ABCC1P33527 1531 aa24.21■■□□□ 1.47
TSNARE1-206ENST00000520462 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa24.21■■□□□ 1.47
TSNARE1-206ENST00000520462 NCOA2Q15596 1464 aa24.19■■□□□ 1.46
TSNARE1-206ENST00000520462 MLH3Q9UHC1 1453 aa24.19■■□□□ 1.46
TSNARE1-206ENST00000520462 ABCA6Q8N139 1617 aa24.19■■□□□ 1.46
TSNARE1-206ENST00000520462 PREX1Q8TCU6 1659 aa24.16■■□□□ 1.46
TSNARE1-206ENST00000520462 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
TSNARE1-206ENST00000520462 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa24.16■■□□□ 1.46
TSNARE1-206ENST00000520462 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
TSNARE1-206ENST00000520462 REREQ9P2R6 1566 aa24.15■■□□□ 1.46
TSNARE1-206ENST00000520462 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa24.13■■□□□ 1.45
TSNARE1-206ENST00000520462 SYCP2Q9BX26 1530 aa24.1■■□□□ 1.45
TSNARE1-206ENST00000520462 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa24.1■■□□□ 1.45
TSNARE1-206ENST00000520462 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa24.09■■□□□ 1.45
TSNARE1-206ENST00000520462 AGLP35573 1532 aa24.09■■□□□ 1.45
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TSNARE1-206ENST00000520462 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa24.07■■□□□ 1.44
TSNARE1-206ENST00000520462 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
TSNARE1-206ENST00000520462 CERKQ8TCT0 537 aa24.06■■□□□ 1.44
TSNARE1-206ENST00000520462 C3P01024 1663 aa24.05■■□□□ 1.44
TSNARE1-206ENST00000520462 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
TSNARE1-206ENST00000520462 DMRT2Q9Y5R5 561 aa24.02■■□□□ 1.44
TSNARE1-206ENST00000520462 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa24.01■■□□□ 1.43
TSNARE1-206ENST00000520462 MYOM3Q5VTT5 1437 aa24.01■■□□□ 1.43
TSNARE1-206ENST00000520462 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
TSNARE1-206ENST00000520462 CNTLNQ9NXG0 1405 aa24■■□□□ 1.43
TSNARE1-206ENST00000520462 ATP7AQ04656 1500 aa23.98■■□□□ 1.43
TSNARE1-206ENST00000520462 STRCQ7RTU9 1775 aa23.98■■□□□ 1.43
TSNARE1-206ENST00000520462 MIA2Q96PC5 1412 aa23.96■■□□□ 1.43
TSNARE1-206ENST00000520462 RSPH4AQ5TD94 716 aa23.94■■□□□ 1.42
TSNARE1-206ENST00000520462 MBD5Q9P267 1494 aa23.94■■□□□ 1.42
TSNARE1-206ENST00000520462 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP23.93■■□□□ 1.42
TSNARE1-206ENST00000520462 CCDC141Q6ZP82 1450 aa23.93■■□□□ 1.42
TSNARE1-206ENST00000520462 A2MP01023 1474 aa23.92■■□□□ 1.42
TSNARE1-206ENST00000520462 ZMYM3Q14202 1370 aa23.91■■□□□ 1.42
TSNARE1-206ENST00000520462 GGT6Q6P531 493 aa23.9■■□□□ 1.42
TSNARE1-206ENST00000520462 ARHGEF5Q12774 1597 aa23.9■■□□□ 1.42
TSNARE1-206ENST00000520462 MROH2AA6NES4 1674 aa23.89■■□□□ 1.42
TSNARE1-206ENST00000520462 PTPN23Q9H3S7 1636 aa23.88■■□□□ 1.41
TSNARE1-206ENST00000520462 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
TSNARE1-206ENST00000520462 PLXNC1O60486 1568 aa23.87■■□□□ 1.41
TSNARE1-206ENST00000520462 TSPY4P0CV99 314 aa23.87■■□□□ 1.41
TSNARE1-206ENST00000520462 TSPY10P0CW01 314 aa23.87■■□□□ 1.41
TSNARE1-206ENST00000520462 PTPRTO14522 1441 aa23.86■■□□□ 1.41
TSNARE1-206ENST00000520462 NPATQ14207 1427 aa23.86■■□□□ 1.41
TSNARE1-206ENST00000520462 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa23.85■■□□□ 1.41
TSNARE1-206ENST00000520462 FGD6Q6ZV73 1430 aa23.85■■□□□ 1.41
TSNARE1-206ENST00000520462 ADGBQ8N7X0 1667 aa23.85■■□□□ 1.41
TSNARE1-206ENST00000520462 SOCS7O14512 581 aa23.84■■□□□ 1.41
TSNARE1-206ENST00000520462 NCOA1Q15788 1441 aa23.83■■□□□ 1.4
TSNARE1-206ENST00000520462 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa23.81■■□□□ 1.4
TSNARE1-206ENST00000520462 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP23.8■■□□□ 1.4
TSNARE1-206ENST00000520462 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
TSNARE1-206ENST00000520462 DISP3Q9P2K9 1392 aa23.78■■□□□ 1.4
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