RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517049.1

RNU6-1271P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1271, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-1271P, Length 105 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP9.36□□□□□ -0.91
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ARSIQ5FYB1 569 aa9.36□□□□□ -0.91
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa9.36□□□□□ -0.91
RNU6-1271P-201ENST00000517049 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP9.34□□□□□ -0.91
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PHF8Q9UPP1 1060 aa9.32□□□□□ -0.92
RNU6-1271P-201ENST00000517049 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP9.3□□□□□ -0.92
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PBX2P40425 430 aa9.29□□□□□ -0.92
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
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RNU6-1271P-201ENST00000517049 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
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RNU6-1271P-201ENST00000517049 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa9.24□□□□□ -0.93
RNU6-1271P-201ENST00000517049 KIF3CO14782 793 aa9.23□□□□□ -0.93
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RNU6-1271P-201ENST00000517049 POTEEQ6S8J3 1075 aa9.23□□□□□ -0.93
RNU6-1271P-201ENST00000517049 FBXO22Q8NEZ5 403 aa9.22□□□□□ -0.93
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RNU6-1271P-201ENST00000517049 AXIN2Q9Y2T1 843 aa9.17□□□□□ -0.94
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa9.16□□□□□ -0.94
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ADGRD1Q6QNK2 874 aa9.14□□□□□ -0.95
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RNU6-1271P-201ENST00000517049 HRO43593 1189 aa9.09□□□□□ -0.95
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RNU6-1271P-201ENST00000517049 STAC3Q96MF2 364 aa8.94□□□□□ -0.98
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PPP1R37O75864 691 aa8.92□□□□□ -0.98
RNU6-1271P-201ENST00000517049 FOXK1P85037 733 aa8.92□□□□□ -0.98
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RNU6-1271P-201ENST00000517049 KCNK17Q96T54 332 aa8.89□□□□□ -0.99
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RNU6-1271P-201ENST00000517049 RGL2O15211 777 aa8.81□□□□□ -1
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RNU6-1271P-201ENST00000517049 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa8.68□□□□□ -1.02
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RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZDHHC16Q969W1 377 aa8.67□□□□□ -1.02
RNU6-1271P-201ENST00000517049 HS6ST3Q8IZP7 471 aa8.66□□□□□ -1.02
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ADAM33Q9BZ11 813 aa8.66□□□□□ -1.02
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RNU6-1271P-201ENST00000517049 ANKK1Q8NFD2 765 aa8.63□□□□□ -1.03
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RABGEF1Q9UJ41 708 aa8.63□□□□□ -1.03
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa8.62□□□□□ -1.03
RNU6-1271P-201ENST00000517049 EVI5O60447 810 aa8.62□□□□□ -1.03
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NYAP1Q6ZVC0 841 aa8.62□□□□□ -1.03
RNU6-1271P-201ENST00000517049 LAPTM4BQ86VI4 370 aa8.6□□□□□ -1.03
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SOWAHBA6NEL2 793 aa8.59□□□□□ -1.03
RNU6-1271P-201ENST00000517049 LAPTM4AQ15012 233 aa8.59□□□□□ -1.03
RNU6-1271P-201ENST00000517049 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa8.59□□□□□ -1.03
RNU6-1271P-201ENST00000517049 BCAMP50895 628 aa8.58□□□□□ -1.04
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PROX2Q3B8N5 592 aa8.58□□□□□ -1.04
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa8.57□□□□□ -1.04
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PDE4AP27815 886 aa8.57□□□□□ -1.04
RNU6-1271P-201ENST00000517049 KCNC4Q03721 635 aa8.57□□□□□ -1.04
RNU6-1271P-201ENST00000517049 LCE2BO14633 110 aa8.56□□□□□ -1.04
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
RNU6-1271P-201ENST00000517049 COL9A1P20849 921 aa8.55□□□□□ -1.04
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa8.55□□□□□ -1.04
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