RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516122.1

RNU6-871P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 871, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-871P, Length 100 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-871P-201ENST00000516122 TK2O00142 265 aa4.16□□□□□ -1.74
RNU6-871P-201ENST00000516122 PTPN5P54829 565 aa4.16□□□□□ -1.74
RNU6-871P-201ENST00000516122 TREML4Q6UXN2 200 aa4.16□□□□□ -1.74
RNU6-871P-201ENST00000516122 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa4.16□□□□□ -1.74
RNU6-871P-201ENST00000516122 STK17AQ9UEE5 414 aa4.16□□□□□ -1.74
RNU6-871P-201ENST00000516122 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa4.14□□□□□ -1.75
RNU6-871P-201ENST00000516122 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP4.14□□□□□ -1.75
RNU6-871P-201ENST00000516122 DMRTA1Q5VZB9 504 aa4.14□□□□□ -1.75
RNU6-871P-201ENST00000516122 POTECB2RU33 542 aa4.11□□□□□ -1.75
RNU6-871P-201ENST00000516122 ARHGAP33O14559 1287 aa4.11□□□□□ -1.75
RNU6-871P-201ENST00000516122 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP4.11□□□□□ -1.75
RNU6-871P-201ENST00000516122 PROM2Q8N271 834 aa4.11□□□□□ -1.75
RNU6-871P-201ENST00000516122 THSD4Q6ZMP0 1018 aa4.1□□□□□ -1.75
RNU6-871P-201ENST00000516122 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa4.1□□□□□ -1.75
RNU6-871P-201ENST00000516122 LHX6Q9UPM6 363 aa4.1□□□□□ -1.75
RNU6-871P-201ENST00000516122 PYGBP11216 843 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-871P-201ENST00000516122 EHMT2Q96KQ7 1210 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-871P-201ENST00000516122 GOLGA2Q08379 1002 aa4.07□□□□□ -1.76
RNU6-871P-201ENST00000516122 FAM212AQ96EL1 285 aa4.07□□□□□ -1.76
RNU6-871P-201ENST00000516122 G3V3G9 751 aa4.06□□□□□ -1.76
RNU6-871P-201ENST00000516122 NUDT7P0C024 238 aa4.06□□□□□ -1.76
RNU6-871P-201ENST00000516122 PSEN2P49810 448 aa4.06□□□□□ -1.76
RNU6-871P-201ENST00000516122 DCAF8Q5TAQ9 597 aa4.06□□□□□ -1.76
RNU6-871P-201ENST00000516122 WIPF1O43516 503 aa4.05□□□□□ -1.76
RNU6-871P-201ENST00000516122 MIER1Q8N108 512 aa4.04□□□□□ -1.76
RNU6-871P-201ENST00000516122 LCE2CQ5TA81 110 aa4.03□□□□□ -1.76
RNU6-871P-201ENST00000516122 MICALL2Q8IY33 904 aa4.03□□□□□ -1.76
RNU6-871P-201ENST00000516122 XP32Q5T750 250 aa4.02□□□□□ -1.77
RNU6-871P-201ENST00000516122 PSEN1P49768 467 aa4.01□□□□□ -1.77
RNU6-871P-201ENST00000516122 PLEKHG5O94827 1062 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-871P-201ENST00000516122 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa3.98□□□□□ -1.77
RNU6-871P-201ENST00000516122 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
RNU6-871P-201ENST00000516122 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
RNU6-871P-201ENST00000516122 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa3.98□□□□□ -1.77
RNU6-871P-201ENST00000516122 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP3.97□□□□□ -1.77
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP3.97□□□□□ -1.77
RNU6-871P-201ENST00000516122 WFS1O76024 890 aa3.96□□□□□ -1.78
RNU6-871P-201ENST00000516122 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa3.96□□□□□ -1.78
RNU6-871P-201ENST00000516122 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa3.96□□□□□ -1.78
RNU6-871P-201ENST00000516122 MYT1Q01538 1121 aa3.95□□□□□ -1.78
RNU6-871P-201ENST00000516122 PRKD2Q9BZL6 878 aa3.95□□□□□ -1.78
RNU6-871P-201ENST00000516122 CABP2Q9NPB3 220 aa3.95□□□□□ -1.78
RNU6-871P-201ENST00000516122 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa3.95□□□□□ -1.78
RNU6-871P-201ENST00000516122 LORP23490 312 aaPredicted RBP3.94□□□□□ -1.78
RNU6-871P-201ENST00000516122 WNT2BQ93097 391 aa3.94□□□□□ -1.78
RNU6-871P-201ENST00000516122 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa3.93□□□□□ -1.78
RNU6-871P-201ENST00000516122 STAC3Q96MF2 364 aa3.93□□□□□ -1.78
RNU6-871P-201ENST00000516122 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa3.93□□□□□ -1.78
RNU6-871P-201ENST00000516122 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa3.92□□□□□ -1.78
RNU6-871P-201ENST00000516122 KCNC4Q03721 635 aa3.91□□□□□ -1.78
RNU6-871P-201ENST00000516122 LCE3BQ5TA77 95 aa3.91□□□□□ -1.78
RNU6-871P-201ENST00000516122 V9GY48 417 aaPredicted RBP3.91□□□□□ -1.78
RNU6-871P-201ENST00000516122 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP3.9□□□□□ -1.79
RNU6-871P-201ENST00000516122 KIF3CO14782 793 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-871P-201ENST00000516122 SLC34A2O95436 690 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-871P-201ENST00000516122 TRIM67Q6ZTA4 783 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-871P-201ENST00000516122 SLC4A5Q9BY07 1137 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
RNU6-871P-201ENST00000516122 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
RNU6-871P-201ENST00000516122 PLCD3Q8N3E9 789 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-871P-201ENST00000516122 MS4A4AQ96JQ5 239 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-871P-201ENST00000516122 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-871P-201ENST00000516122 KCNK17Q96T54 332 aa3.87□□□□□ -1.79
RNU6-871P-201ENST00000516122 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa3.87□□□□□ -1.79
RNU6-871P-201ENST00000516122 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP3.86□□□□□ -1.79
RNU6-871P-201ENST00000516122 GSK3AP49840 483 aa3.86□□□□□ -1.79
RNU6-871P-201ENST00000516122 EFCAB3Q8N7B9 438 aa3.84□□□□□ -1.79
RNU6-871P-201ENST00000516122 KCTD17Q8N5Z5 321 aa3.83□□□□□ -1.8
RNU6-871P-201ENST00000516122 ST8SIA5O15466 376 aa3.82□□□□□ -1.8
RNU6-871P-201ENST00000516122 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
RNU6-871P-201ENST00000516122 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa3.82□□□□□ -1.8
RNU6-871P-201ENST00000516122 C2orf72A6NCS6 295 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-871P-201ENST00000516122 DGAT1O75907 488 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-871P-201ENST00000516122 BCAMP50895 628 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-871P-201ENST00000516122 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZBED2Q9BTP6 218 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-871P-201ENST00000516122 AAASQ9NRG9 546 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-871P-201ENST00000516122 GOLGA8CPA6NN73 597 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-871P-201ENST00000516122 NYAP1Q6ZVC0 841 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-871P-201ENST00000516122 FAM181BA6NEQ2 426 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-871P-201ENST00000516122 PKDCCQ504Y2 493 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-871P-201ENST00000516122 PPP1R18Q6NYC8 613 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-871P-201ENST00000516122 WBP1LQ9NX94 342 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-871P-201ENST00000516122 DACH1Q9UI36 760 aa3.78□□□□□ -1.8
RNU6-871P-201ENST00000516122 SOWAHBA6NEL2 793 aa3.77□□□□□ -1.81
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa3.75□□□□□ -1.81
RNU6-871P-201ENST00000516122 ANKK1Q8NFD2 765 aa3.75□□□□□ -1.81
RNU6-871P-201ENST00000516122 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
RNU6-871P-201ENST00000516122 TERTO14746 1132 aaKnown RBP3.74□□□□□ -1.81
RNU6-871P-201ENST00000516122 KCNMA1Q12791 1236 aa3.74□□□□□ -1.81
RNU6-871P-201ENST00000516122 TJAP1Q5JTD0 557 aa3.74□□□□□ -1.81
RNU6-871P-201ENST00000516122 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP3.74□□□□□ -1.81
RNU6-871P-201ENST00000516122 BCL2L12Q9HB09 334 aa3.74□□□□□ -1.81
RNU6-871P-201ENST00000516122 PRR20EP86478 221 aa3.73□□□□□ -1.81
RNU6-871P-201ENST00000516122 PRR20CP86479 221 aa3.73□□□□□ -1.81
RNU6-871P-201ENST00000516122 PRR20DP86480 221 aa3.73□□□□□ -1.81
RNU6-871P-201ENST00000516122 PRR20BP86481 221 aa3.73□□□□□ -1.81
RNU6-871P-201ENST00000516122 PRR20AP86496 221 aa3.73□□□□□ -1.81
RNU6-871P-201ENST00000516122 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP3.73□□□□□ -1.81
RNU6-871P-201ENST00000516122 NBPF3Q9H094 633 aa3.73□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.4 ms