RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515760.1

PEX10-208, Transcript of peroxisomal biogenesis factor 10, human

TSL 4

Gene PEX10, Length 603 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PEX10-208	ENST00000515760	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		34.65	■■■■□ 3.14
PEX10-208	ENST00000515760	KIF14	Q15058	1648 aa		34.65	■■■■□ 3.14
PEX10-208	ENST00000515760	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		34.63	■■■■□ 3.13
PEX10-208	ENST00000515760	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		34.63	■■■■□ 3.13
PEX10-208	ENST00000515760	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		34.62	■■■■□ 3.13
PEX10-208	ENST00000515760	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		34.6	■■■■□ 3.13
PEX10-208	ENST00000515760	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		34.57	■■■■□ 3.12
PEX10-208	ENST00000515760	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	34.55	■■■■□ 3.12
PEX10-208	ENST00000515760	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	34.54	■■■■□ 3.12
PEX10-208	ENST00000515760	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		34.5	■■■■□ 3.11
PEX10-208	ENST00000515760	CLIP1	P30622	1438 aa		34.5	■■■■□ 3.11
PEX10-208	ENST00000515760	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		34.5	■■■■□ 3.11
PEX10-208	ENST00000515760	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		34.48	■■■■□ 3.11
PEX10-208	ENST00000515760	MLEC	Q14165	292 aa		34.47	■■■■□ 3.11
PEX10-208	ENST00000515760	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		34.47	■■■■□ 3.11
PEX10-208	ENST00000515760	ATP10A	O60312	1499 aa		34.46	■■■■□ 3.11
PEX10-208	ENST00000515760	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		34.45	■■■■□ 3.1
PEX10-208	ENST00000515760	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		34.43	■■■■□ 3.1
PEX10-208	ENST00000515760	KDM5C	P41229	1560 aa		34.43	■■■■□ 3.1
PEX10-208	ENST00000515760	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		34.41	■■■■□ 3.1
PEX10-208	ENST00000515760	FBXO41	Q8TF61	875 aa		34.39	■■■■□ 3.1
PEX10-208	ENST00000515760	PREX2	Q70Z35	1606 aa		34.38	■■■■□ 3.09
PEX10-208	ENST00000515760	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		34.38	■■■■□ 3.09
PEX10-208	ENST00000515760	HSPA2	P54652	639 aa		34.37	■■■■□ 3.09
PEX10-208	ENST00000515760	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		34.36	■■■■□ 3.09
PEX10-208	ENST00000515760	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		34.33	■■■■□ 3.09
PEX10-208	ENST00000515760	ABCC1	P33527	1531 aa		34.3	■■■■□ 3.08
PEX10-208	ENST00000515760	AFAP1	Q8N556	730 aa		34.3	■■■■□ 3.08
PEX10-208	ENST00000515760	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		34.3	■■■■□ 3.08
PEX10-208	ENST00000515760	ABCA6	Q8N139	1617 aa		34.3	■■■■□ 3.08
PEX10-208	ENST00000515760	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		34.29	■■■■□ 3.08
PEX10-208	ENST00000515760	RERE	Q9P2R6	1566 aa		34.28	■■■■□ 3.08
PEX10-208	ENST00000515760	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		34.26	■■■■□ 3.07
PEX10-208	ENST00000515760	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		34.25	■■■■□ 3.07
PEX10-208	ENST00000515760	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		34.25	■■■■□ 3.07
PEX10-208	ENST00000515760	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		34.23	■■■■□ 3.07
PEX10-208	ENST00000515760	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		34.21	■■■■□ 3.07
PEX10-208	ENST00000515760	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	34.17	■■■■□ 3.06
PEX10-208	ENST00000515760	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		34.15	■■■■□ 3.06
PEX10-208	ENST00000515760	AGL	P35573	1532 aa		34.13	■■■■□ 3.05
PEX10-208	ENST00000515760	C3	P01024	1663 aa		34.12	■■■■□ 3.05
PEX10-208	ENST00000515760	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		34.1	■■■■□ 3.05
PEX10-208	ENST00000515760	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		34.08	■■■■□ 3.05
PEX10-208	ENST00000515760	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		34.07	■■■■□ 3.04
PEX10-208	ENST00000515760	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	34.05	■■■■□ 3.04
PEX10-208	ENST00000515760	STRC	Q7RTU9	1775 aa		34.04	■■■■□ 3.04
PEX10-208	ENST00000515760	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	34.03	■■■■□ 3.04
PEX10-208	ENST00000515760	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	34.01	■■■■□ 3.03
PEX10-208	ENST00000515760	CERK	Q8TCT0	537 aa		33.98	■■■■□ 3.03
PEX10-208	ENST00000515760	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	33.98	■■■■□ 3.03
PEX10-208	ENST00000515760	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		33.94	■■■■□ 3.02
PEX10-208	ENST00000515760	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	33.93	■■■■□ 3.02
PEX10-208	ENST00000515760	ATP7A	Q04656	1500 aa		33.93	■■■■□ 3.02
PEX10-208	ENST00000515760	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	33.93	■■■■□ 3.02
PEX10-208	ENST00000515760	MROH2A	A6NES4	1674 aa		33.91	■■■■□ 3.02
PEX10-208	ENST00000515760	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		33.9	■■■■□ 3.02
PEX10-208	ENST00000515760	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	33.9	■■■■□ 3.02
PEX10-208	ENST00000515760	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		33.89	■■■■□ 3.02
PEX10-208	ENST00000515760	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	33.89	■■■■□ 3.02
PEX10-208	ENST00000515760	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		33.88	■■■■□ 3.01
PEX10-208	ENST00000515760	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		33.88	■■■■□ 3.01
PEX10-208	ENST00000515760	PLXNC1	O60486	1568 aa		33.87	■■■■□ 3.01
PEX10-208	ENST00000515760	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	33.87	■■■■□ 3.01
PEX10-208	ENST00000515760	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		33.87	■■■■□ 3.01
PEX10-208	ENST00000515760	TIAM1	Q13009	1591 aa		33.84	■■■■□ 3.01
PEX10-208	ENST00000515760	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		33.84	■■■■□ 3.01
PEX10-208	ENST00000515760	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	33.81	■■■■□ 3
PEX10-208	ENST00000515760	A2M	P01023	1474 aa		33.8	■■■■□ 3
PEX10-208	ENST00000515760	PTPRT	O14522	1441 aa		33.79	■■■■□ 3
PEX10-208	ENST00000515760	NPAT	Q14207	1427 aa		33.79	■■■■□ 3
PEX10-208	ENST00000515760	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		33.77	■■■■□ 3
PEX10-208	ENST00000515760	NCOA1	Q15788	1441 aa		33.75	■■■□□ 2.99
PEX10-208	ENST00000515760	ZMYM3	Q14202	1370 aa		33.74	■■■□□ 2.99
PEX10-208	ENST00000515760	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		33.71	■■■□□ 2.99
PEX10-208	ENST00000515760	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		33.71	■■■□□ 2.99
PEX10-208	ENST00000515760	CEP162	Q5TB80	1403 aa		33.71	■■■□□ 2.99
PEX10-208	ENST00000515760	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	33.7	■■■□□ 2.99
PEX10-208	ENST00000515760	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	33.69	■■■□□ 2.98
PEX10-208	ENST00000515760	MBD5	Q9P267	1494 aa		33.67	■■■□□ 2.98
PEX10-208	ENST00000515760	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		33.65	■■■□□ 2.98
PEX10-208	ENST00000515760	GGT6	Q6P531	493 aa		33.63	■■■□□ 2.97
PEX10-208	ENST00000515760	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	33.62	■■■□□ 2.97
PEX10-208	ENST00000515760	PTPRK	Q15262	1439 aa		33.62	■■■□□ 2.97
PEX10-208	ENST00000515760	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		33.59	■■■□□ 2.97
PEX10-208	ENST00000515760	NCOA2	Q15596	1464 aa		33.58	■■■□□ 2.97
PEX10-208	ENST00000515760	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		33.56	■■■□□ 2.96
PEX10-208	ENST00000515760	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		33.56	■■■□□ 2.96
PEX10-208	ENST00000515760	PLA2R1	Q13018	1463 aa		33.54	■■■□□ 2.96
PEX10-208	ENST00000515760	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		33.53	■■■□□ 2.96
PEX10-208	ENST00000515760	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		33.52	■■■□□ 2.96
PEX10-208	ENST00000515760	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		33.51	■■■□□ 2.95
PEX10-208	ENST00000515760	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	33.5	■■■□□ 2.95
PEX10-208	ENST00000515760	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	33.48	■■■□□ 2.95
PEX10-208	ENST00000515760	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		33.45	■■■□□ 2.95
PEX10-208	ENST00000515760	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		33.44	■■■□□ 2.94
PEX10-208	ENST00000515760	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		33.44	■■■□□ 2.94
PEX10-208	ENST00000515760	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		33.43	■■■□□ 2.94
PEX10-208	ENST00000515760	PKD2	Q13563	968 aa		33.43	■■■□□ 2.94
PEX10-208	ENST00000515760	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	33.42	■■■□□ 2.94
PEX10-208	ENST00000515760	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	33.41	■■■□□ 2.94

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