RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513398.1

ACTN3-203, Transcript of actinin alpha 3 (gene/pseudogene), humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTN3, Length 2,939 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN3-203ENST00000513398 PTPN23Q9H3S7 1636 aa25.36■■□□□ 1.65
ACTN3-203ENST00000513398 ABCC2Q92887 1545 aa25.35■■□□□ 1.65
ACTN3-203ENST00000513398 BCANQ96GW7 911 aa25.33■■□□□ 1.65
ACTN3-203ENST00000513398 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
ACTN3-203ENST00000513398 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP25.33■■□□□ 1.65
ACTN3-203ENST00000513398 SETD5Q9C0A6 1442 aa25.32■■□□□ 1.64
ACTN3-203ENST00000513398 TRIM52Q96A61 297 aa25.32■■□□□ 1.64
ACTN3-203ENST00000513398 MAPKBP1O60336 1514 aa25.3■■□□□ 1.64
ACTN3-203ENST00000513398 FKBP8Q14318 412 aa25.26■■□□□ 1.63
ACTN3-203ENST00000513398 SIN3AQ96ST3 1273 aa25.26■■□□□ 1.63
ACTN3-203ENST00000513398 ADCY10Q96PN6 1610 aa25.24■■□□□ 1.63
ACTN3-203ENST00000513398 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
ACTN3-203ENST00000513398 FOXD1Q16676 465 aa25.23■■□□□ 1.63
ACTN3-203ENST00000513398 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
ACTN3-203ENST00000513398 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa25.22■■□□□ 1.63
ACTN3-203ENST00000513398 MIA2Q96PC5 1412 aa25.21■■□□□ 1.63
ACTN3-203ENST00000513398 ABCC5O15440 1437 aa25.2■■□□□ 1.62
ACTN3-203ENST00000513398 ABCC10Q5T3U5 1492 aa25.2■■□□□ 1.62
ACTN3-203ENST00000513398 MYT1LQ9UL68 1186 aa25.19■■□□□ 1.62
ACTN3-203ENST00000513398 DAPK1P53355 1430 aa25.18■■□□□ 1.62
ACTN3-203ENST00000513398 TTC37Q6PGP7 1564 aa25.17■■□□□ 1.62
ACTN3-203ENST00000513398 KDM5BQ9UGL1 1544 aa25.17■■□□□ 1.62
ACTN3-203ENST00000513398 NAIPQ13075 1403 aa25.16■■□□□ 1.62
ACTN3-203ENST00000513398 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP25.15■■□□□ 1.62
ACTN3-203ENST00000513398 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP25.15■■□□□ 1.62
ACTN3-203ENST00000513398 ASXL2Q76L83 1435 aa25.15■■□□□ 1.62
ACTN3-203ENST00000513398 TSPY4P0CV99 314 aa25.15■■□□□ 1.62
ACTN3-203ENST00000513398 TSPY10P0CW01 314 aa25.15■■□□□ 1.62
ACTN3-203ENST00000513398 ARHGAP5Q13017 1502 aa25.14■■□□□ 1.62
ACTN3-203ENST00000513398 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.61
ACTN3-203ENST00000513398 NEFLP07196 543 aa25.13■■□□□ 1.61
ACTN3-203ENST00000513398 AFAP1Q8N556 730 aa25.12■■□□□ 1.61
ACTN3-203ENST00000513398 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa25.11■■□□□ 1.61
ACTN3-203ENST00000513398 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa25.1■■□□□ 1.61
ACTN3-203ENST00000513398 KDM6BO15054 1643 aa25.09■■□□□ 1.61
ACTN3-203ENST00000513398 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
ACTN3-203ENST00000513398 HFM1A2PYH4 1435 aa25.09■■□□□ 1.61
ACTN3-203ENST00000513398 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa25.06■■□□□ 1.6
ACTN3-203ENST00000513398 WDR7Q9Y4E6 1490 aa25.06■■□□□ 1.6
ACTN3-203ENST00000513398 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP25.05■■□□□ 1.6
ACTN3-203ENST00000513398 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
ACTN3-203ENST00000513398 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa25.02■■□□□ 1.6
ACTN3-203ENST00000513398 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa25.02■■□□□ 1.6
ACTN3-203ENST00000513398 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa25.02■■□□□ 1.6
ACTN3-203ENST00000513398 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa25.01■■□□□ 1.59
ACTN3-203ENST00000513398 ITSN2Q9NZM3 1697 aa25.01■■□□□ 1.59
ACTN3-203ENST00000513398 SYCP2Q9BX26 1530 aa25.01■■□□□ 1.59
ACTN3-203ENST00000513398 ANP32CO43423 234 aa25.01■■□□□ 1.59
ACTN3-203ENST00000513398 CCER2I3L3R5 266 aa25■■□□□ 1.59
ACTN3-203ENST00000513398 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
ACTN3-203ENST00000513398 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa24.99■■□□□ 1.59
ACTN3-203ENST00000513398 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa24.99■■□□□ 1.59
ACTN3-203ENST00000513398 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
ACTN3-203ENST00000513398 C9orf84Q5VXU9 1444 aa24.98■■□□□ 1.59
ACTN3-203ENST00000513398 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
ACTN3-203ENST00000513398 NCOA1Q15788 1441 aa24.97■■□□□ 1.59
ACTN3-203ENST00000513398 PLCH2O75038 1416 aa24.96■■□□□ 1.59
ACTN3-203ENST00000513398 AKNAQ7Z591 1439 aa24.96■■□□□ 1.59
ACTN3-203ENST00000513398 MPHOSPH9Q99550 1183 aa24.96■■□□□ 1.59
ACTN3-203ENST00000513398 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa24.96■■□□□ 1.59
ACTN3-203ENST00000513398 FAM69CQ0P6D2 419 aa24.96■■□□□ 1.59
ACTN3-203ENST00000513398 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa24.94■■□□□ 1.58
ACTN3-203ENST00000513398 MBD5Q9P267 1494 aa24.94■■□□□ 1.58
ACTN3-203ENST00000513398 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa24.94■■□□□ 1.58
ACTN3-203ENST00000513398 BCL11AQ9H165 835 aa24.94■■□□□ 1.58
ACTN3-203ENST00000513398 KIF15Q9NS87 1388 aa24.92■■□□□ 1.58
ACTN3-203ENST00000513398 PREX2Q70Z35 1606 aa24.91■■□□□ 1.58
ACTN3-203ENST00000513398 RAPGEF3O95398 923 aa24.91■■□□□ 1.58
ACTN3-203ENST00000513398 FANCAO15360 1455 aa24.89■■□□□ 1.58
ACTN3-203ENST00000513398 CD109Q6YHK3 1445 aa24.88■■□□□ 1.57
ACTN3-203ENST00000513398 MYO5CQ9NQX4 1742 aa24.88■■□□□ 1.57
ACTN3-203ENST00000513398 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa24.88■■□□□ 1.57
ACTN3-203ENST00000513398 CCDC141Q6ZP82 1450 aa24.86■■□□□ 1.57
ACTN3-203ENST00000513398 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
ACTN3-203ENST00000513398 SCAPERQ9BY12 1400 aa24.86■■□□□ 1.57
ACTN3-203ENST00000513398 NUP155O75694 1391 aa24.85■■□□□ 1.57
ACTN3-203ENST00000513398 ROCK1Q13464 1354 aa24.84■■□□□ 1.57
ACTN3-203ENST00000513398 PKD2Q13563 968 aa24.83■■□□□ 1.57
ACTN3-203ENST00000513398 TONSLQ96HA7 1378 aa24.82■■□□□ 1.56
ACTN3-203ENST00000513398 ADGRL1O94910 1474 aa24.79■■□□□ 1.56
ACTN3-203ENST00000513398 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
ACTN3-203ENST00000513398 RSPH4AQ5TD94 716 aa24.76■■□□□ 1.55
ACTN3-203ENST00000513398 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa24.75■■□□□ 1.55
ACTN3-203ENST00000513398 GCC2Q8IWJ2 1684 aa24.74■■□□□ 1.55
ACTN3-203ENST00000513398 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
ACTN3-203ENST00000513398 KIF3BO15066 747 aa24.72■■□□□ 1.55
ACTN3-203ENST00000513398 CROCC2H7BZ55 1655 aa24.71■■□□□ 1.55
ACTN3-203ENST00000513398 ABCA9Q8IUA7 1624 aa24.71■■□□□ 1.55
ACTN3-203ENST00000513398 ABCC1P33527 1531 aa24.71■■□□□ 1.55
ACTN3-203ENST00000513398 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa24.7■■□□□ 1.55
ACTN3-203ENST00000513398 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP24.7■■□□□ 1.54
ACTN3-203ENST00000513398 TRHP20396 242 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
ACTN3-203ENST00000513398 ADGRL2O95490 1459 aa24.7■■□□□ 1.54
ACTN3-203ENST00000513398 MSH5O43196 834 aa24.69■■□□□ 1.54
ACTN3-203ENST00000513398 TSPOAP1O95153 1857 aa24.68■■□□□ 1.54
ACTN3-203ENST00000513398 GGT6Q6P531 493 aa24.67■■□□□ 1.54
ACTN3-203ENST00000513398 ARHGEF5Q12774 1597 aa24.67■■□□□ 1.54
ACTN3-203ENST00000513398 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
ACTN3-203ENST00000513398 PZPP20742 1482 aa24.65■■□□□ 1.54
ACTN3-203ENST00000513398 ADGBQ8N7X0 1667 aa24.65■■□□□ 1.54
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