RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508242.1

MRPS35P2-201, Transcript of mitochondrial ribosomal protein S35 pseudogene 2, humanhuman

BASIC

Gene MRPS35P2, Length 191 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS35P2-201ENST00000508242 SOX12O15370 315 aa9.17□□□□□ -0.94
MRPS35P2-201ENST00000508242 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP9.17□□□□□ -0.94
MRPS35P2-201ENST00000508242 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP9.16□□□□□ -0.94
MRPS35P2-201ENST00000508242 FBXO22Q8NEZ5 403 aa9.15□□□□□ -0.94
MRPS35P2-201ENST00000508242 ARSIQ5FYB1 569 aa9.14□□□□□ -0.95
MRPS35P2-201ENST00000508242 RIMBP2O15034 1052 aa9.12□□□□□ -0.95
MRPS35P2-201ENST00000508242 MYT1LQ9UL68 1186 aa9.12□□□□□ -0.95
MRPS35P2-201ENST00000508242 VGFO15240 615 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
MRPS35P2-201ENST00000508242 POTEEQ6S8J3 1075 aa9.1□□□□□ -0.95
MRPS35P2-201ENST00000508242 KIF3CO14782 793 aa9.09□□□□□ -0.95
MRPS35P2-201ENST00000508242 MFRPQ9BY79 579 aa9.08□□□□□ -0.96
MRPS35P2-201ENST00000508242 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP9.07□□□□□ -0.96
MRPS35P2-201ENST00000508242 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP9.03□□□□□ -0.96
MRPS35P2-201ENST00000508242 C2orf72A6NCS6 295 aa9.02□□□□□ -0.97
MRPS35P2-201ENST00000508242 NLRP6P59044 892 aa9.02□□□□□ -0.97
MRPS35P2-201ENST00000508242 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP9.02□□□□□ -0.97
MRPS35P2-201ENST00000508242 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa9.02□□□□□ -0.97
MRPS35P2-201ENST00000508242 PTGER2P43116 358 aa8.99□□□□□ -0.97
MRPS35P2-201ENST00000508242 NUDT7P0C024 238 aa8.98□□□□□ -0.97
MRPS35P2-201ENST00000508242 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa8.97□□□□□ -0.97
MRPS35P2-201ENST00000508242 LHX6Q9UPM6 363 aa8.97□□□□□ -0.97
MRPS35P2-201ENST00000508242 AXIN2Q9Y2T1 843 aa8.96□□□□□ -0.98
MRPS35P2-201ENST00000508242 STK24Q9Y6E0 443 aa8.96□□□□□ -0.98
MRPS35P2-201ENST00000508242 SLC34A2O95436 690 aa8.95□□□□□ -0.98
MRPS35P2-201ENST00000508242 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa8.95□□□□□ -0.98
MRPS35P2-201ENST00000508242 PPP1R37O75864 691 aa8.93□□□□□ -0.98
MRPS35P2-201ENST00000508242 PBX2P40425 430 aa8.9□□□□□ -0.98
MRPS35P2-201ENST00000508242 STK25O00506 426 aa8.89□□□□□ -0.99
MRPS35P2-201ENST00000508242 RGL2O15211 777 aa8.89□□□□□ -0.99
MRPS35P2-201ENST00000508242 PKD2Q13563 968 aa8.88□□□□□ -0.99
MRPS35P2-201ENST00000508242 HRO43593 1189 aa8.85□□□□□ -0.99
MRPS35P2-201ENST00000508242 DMRTA1Q5VZB9 504 aa8.85□□□□□ -0.99
MRPS35P2-201ENST00000508242 ADGRD1Q6QNK2 874 aa8.85□□□□□ -0.99
MRPS35P2-201ENST00000508242 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
MRPS35P2-201ENST00000508242 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
MRPS35P2-201ENST00000508242 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa8.82□□□□□ -1
MRPS35P2-201ENST00000508242 ARHGAP33O14559 1287 aa8.81□□□□□ -1
MRPS35P2-201ENST00000508242 PSEN2P49810 448 aa8.81□□□□□ -1
MRPS35P2-201ENST00000508242 TMC2Q8TDI7 906 aa8.81□□□□□ -1
MRPS35P2-201ENST00000508242 TAOK2Q9UL54 1235 aa8.81□□□□□ -1
MRPS35P2-201ENST00000508242 HCSTQ9UBK5 93 aa8.79□□□□□ -1
MRPS35P2-201ENST00000508242 TK2O00142 265 aa8.76□□□□□ -1.01
MRPS35P2-201ENST00000508242 FOXK1P85037 733 aa8.76□□□□□ -1.01
MRPS35P2-201ENST00000508242 PLPP6Q8IY26 295 aa8.75□□□□□ -1.01
MRPS35P2-201ENST00000508242 DSG2Q14126 1118 aa8.74□□□□□ -1.01
MRPS35P2-201ENST00000508242 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
MRPS35P2-201ENST00000508242 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
MRPS35P2-201ENST00000508242 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
MRPS35P2-201ENST00000508242 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa8.68□□□□□ -1.02
MRPS35P2-201ENST00000508242 OXER1Q8TDS5 423 aa8.67□□□□□ -1.02
MRPS35P2-201ENST00000508242 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
MRPS35P2-201ENST00000508242 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa8.66□□□□□ -1.02
MRPS35P2-201ENST00000508242 KCNK17Q96T54 332 aa8.66□□□□□ -1.02
MRPS35P2-201ENST00000508242 HS6ST3Q8IZP7 471 aa8.65□□□□□ -1.02
MRPS35P2-201ENST00000508242 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
MRPS35P2-201ENST00000508242 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa8.62□□□□□ -1.03
MRPS35P2-201ENST00000508242 SLC4A5Q9BY07 1137 aa8.61□□□□□ -1.03
MRPS35P2-201ENST00000508242 BCL2L12Q9HB09 334 aa8.6□□□□□ -1.03
MRPS35P2-201ENST00000508242 FOSBP53539 338 aa8.59□□□□□ -1.03
MRPS35P2-201ENST00000508242 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP8.59□□□□□ -1.03
MRPS35P2-201ENST00000508242 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa8.58□□□□□ -1.04
MRPS35P2-201ENST00000508242 IFFO2Q5TF58 517 aa8.58□□□□□ -1.04
MRPS35P2-201ENST00000508242 TBC1D12O60347 775 aa8.57□□□□□ -1.04
MRPS35P2-201ENST00000508242 PTPN5P54829 565 aa8.57□□□□□ -1.04
MRPS35P2-201ENST00000508242 THSD4Q6ZMP0 1018 aa8.57□□□□□ -1.04
MRPS35P2-201ENST00000508242 ZNF454Q8N9F8 522 aa8.57□□□□□ -1.04
MRPS35P2-201ENST00000508242 ZBED2Q9BTP6 218 aa8.57□□□□□ -1.04
MRPS35P2-201ENST00000508242 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa8.57□□□□□ -1.04
MRPS35P2-201ENST00000508242 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
MRPS35P2-201ENST00000508242 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa8.53□□□□□ -1.04
MRPS35P2-201ENST00000508242 ADAM33Q9BZ11 813 aa8.53□□□□□ -1.04
MRPS35P2-201ENST00000508242 A0A0G2JS52 829 aa8.52□□□□□ -1.05
MRPS35P2-201ENST00000508242 CHGAP10645 457 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
MRPS35P2-201ENST00000508242 RGS20O76081 388 aa8.49□□□□□ -1.05
MRPS35P2-201ENST00000508242 PTPREP23469 700 aa8.49□□□□□ -1.05
MRPS35P2-201ENST00000508242 JPH4Q96JJ6 628 aa8.49□□□□□ -1.05
MRPS35P2-201ENST00000508242 STAC3Q96MF2 364 aa8.49□□□□□ -1.05
MRPS35P2-201ENST00000508242 WNT2BQ93097 391 aa8.48□□□□□ -1.05
MRPS35P2-201ENST00000508242 EVI5O60447 810 aa8.47□□□□□ -1.05
MRPS35P2-201ENST00000508242 KCNH8Q96L42 1107 aa8.46□□□□□ -1.06
MRPS35P2-201ENST00000508242 EMILIN3Q9NT22 766 aa8.46□□□□□ -1.06
MRPS35P2-201ENST00000508242 COL9A1P20849 921 aa8.45□□□□□ -1.06
MRPS35P2-201ENST00000508242 ZDHHC16Q969W1 377 aa8.45□□□□□ -1.06
MRPS35P2-201ENST00000508242 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
MRPS35P2-201ENST00000508242 MFSD10Q14728 455 aa8.44□□□□□ -1.06
MRPS35P2-201ENST00000508242 PROX2Q3B8N5 592 aa8.44□□□□□ -1.06
MRPS35P2-201ENST00000508242 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
MRPS35P2-201ENST00000508242 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
MRPS35P2-201ENST00000508242 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa8.43□□□□□ -1.06
MRPS35P2-201ENST00000508242 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
MRPS35P2-201ENST00000508242 PDE4AP27815 886 aa8.4□□□□□ -1.06
MRPS35P2-201ENST00000508242 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
MRPS35P2-201ENST00000508242 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa8.39□□□□□ -1.07
MRPS35P2-201ENST00000508242 RABGEF1Q9UJ41 708 aa8.39□□□□□ -1.07
MRPS35P2-201ENST00000508242 LCE2BO14633 110 aa8.38□□□□□ -1.07
MRPS35P2-201ENST00000508242 BCAMP50895 628 aa8.38□□□□□ -1.07
MRPS35P2-201ENST00000508242 CADPS2Q86UW7 1296 aa8.38□□□□□ -1.07
MRPS35P2-201ENST00000508242 NBPF3Q9H094 633 aa8.38□□□□□ -1.07
MRPS35P2-201ENST00000508242 GOLGA8CPA6NN73 597 aa8.37□□□□□ -1.07
MRPS35P2-201ENST00000508242 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.5 ms