RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502484.6

PDE4D-208, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,478 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-208ENST00000502484 NAIPQ13075 1403 aa12.03□□□□□ -0.48
PDE4D-208ENST00000502484 FOXD1Q16676 465 aa12.02□□□□□ -0.48
PDE4D-208ENST00000502484 AKNAQ7Z591 1439 aa12.02□□□□□ -0.49
PDE4D-208ENST00000502484 KIF14Q15058 1648 aa12.02□□□□□ -0.49
PDE4D-208ENST00000502484 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP12.01□□□□□ -0.49
PDE4D-208ENST00000502484 ASXL2Q76L83 1435 aa12.01□□□□□ -0.49
PDE4D-208ENST00000502484 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa11.98□□□□□ -0.49
PDE4D-208ENST00000502484 TRHP20396 242 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
PDE4D-208ENST00000502484 PLEKHD1A6NEE1 506 aa11.98□□□□□ -0.49
PDE4D-208ENST00000502484 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
PDE4D-208ENST00000502484 WDR7Q9Y4E6 1490 aa11.97□□□□□ -0.49
PDE4D-208ENST00000502484 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
PDE4D-208ENST00000502484 KCNH8Q96L42 1107 aa11.97□□□□□ -0.49
PDE4D-208ENST00000502484 DAPK1P53355 1430 aa11.97□□□□□ -0.49
PDE4D-208ENST00000502484 CROCC2H7BZ55 1655 aa11.95□□□□□ -0.5
PDE4D-208ENST00000502484 ABCC10Q5T3U5 1492 aa11.95□□□□□ -0.5
PDE4D-208ENST00000502484 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa11.95□□□□□ -0.5
PDE4D-208ENST00000502484 ROCK1Q13464 1354 aa11.95□□□□□ -0.5
PDE4D-208ENST00000502484 ADGBQ8N7X0 1667 aa11.94□□□□□ -0.5
PDE4D-208ENST00000502484 ABCC5O15440 1437 aa11.94□□□□□ -0.5
PDE4D-208ENST00000502484 FAM69CQ0P6D2 419 aa11.94□□□□□ -0.5
PDE4D-208ENST00000502484 KDM6BO15054 1643 aa11.94□□□□□ -0.5
PDE4D-208ENST00000502484 KIF13AQ9H1H9 1805 aa11.93□□□□□ -0.5
PDE4D-208ENST00000502484 DIP2BQ9P265 1576 aa11.93□□□□□ -0.5
PDE4D-208ENST00000502484 CHIC2Q9UKJ5 165 aa11.93□□□□□ -0.5
PDE4D-208ENST00000502484 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa11.92□□□□□ -0.5
PDE4D-208ENST00000502484 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa11.92□□□□□ -0.5
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
PDE4D-208ENST00000502484 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
PDE4D-208ENST00000502484 SIN3AQ96ST3 1273 aa11.9□□□□□ -0.5
PDE4D-208ENST00000502484 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa11.9□□□□□ -0.51
PDE4D-208ENST00000502484 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
PDE4D-208ENST00000502484 PREX2Q70Z35 1606 aa11.89□□□□□ -0.51
PDE4D-208ENST00000502484 TSPOAP1O95153 1857 aa11.89□□□□□ -0.51
PDE4D-208ENST00000502484 ADGRL2O95490 1459 aa11.89□□□□□ -0.51
PDE4D-208ENST00000502484 GLI2P10070 1586 aa11.88□□□□□ -0.51
PDE4D-208ENST00000502484 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
PDE4D-208ENST00000502484 NEUROD1Q13562 356 aa11.86□□□□□ -0.51
PDE4D-208ENST00000502484 ABCA9Q8IUA7 1624 aa11.86□□□□□ -0.51
PDE4D-208ENST00000502484 SHANK2Q9UPX8 1470 aa11.86□□□□□ -0.51
PDE4D-208ENST00000502484 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP11.86□□□□□ -0.51
PDE4D-208ENST00000502484 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa11.86□□□□□ -0.51
PDE4D-208ENST00000502484 NCOA1Q15788 1441 aa11.86□□□□□ -0.51
PDE4D-208ENST00000502484 ARHGEF5Q12774 1597 aa11.85□□□□□ -0.51
PDE4D-208ENST00000502484 CD109Q6YHK3 1445 aa11.85□□□□□ -0.51
PDE4D-208ENST00000502484 MYO5CQ9NQX4 1742 aa11.85□□□□□ -0.51
PDE4D-208ENST00000502484 TTC37Q6PGP7 1564 aa11.84□□□□□ -0.51
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
PDE4D-208ENST00000502484 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa11.84□□□□□ -0.51
PDE4D-208ENST00000502484 TRIM52Q96A61 297 aa11.82□□□□□ -0.52
PDE4D-208ENST00000502484 TONSLQ96HA7 1378 aa11.82□□□□□ -0.52
PDE4D-208ENST00000502484 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP11.82□□□□□ -0.52
PDE4D-208ENST00000502484 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa11.81□□□□□ -0.52
PDE4D-208ENST00000502484 MPHOSPH9Q99550 1183 aa11.81□□□□□ -0.52
PDE4D-208ENST00000502484 MBD5Q9P267 1494 aa11.8□□□□□ -0.52
PDE4D-208ENST00000502484 C9orf84Q5VXU9 1444 aa11.8□□□□□ -0.52
PDE4D-208ENST00000502484 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
PDE4D-208ENST00000502484 TEX14Q8IWB6 1497 aa11.79□□□□□ -0.52
PDE4D-208ENST00000502484 ARHGAP5Q13017 1502 aa11.78□□□□□ -0.52
PDE4D-208ENST00000502484 CCDC141Q6ZP82 1450 aa11.78□□□□□ -0.52
PDE4D-208ENST00000502484 PLCH2O75038 1416 aa11.78□□□□□ -0.52
PDE4D-208ENST00000502484 MAST1Q9Y2H9 1570 aa11.77□□□□□ -0.52
PDE4D-208ENST00000502484 FANCAO15360 1455 aa11.77□□□□□ -0.53
PDE4D-208ENST00000502484 PZPP20742 1482 aa11.77□□□□□ -0.53
PDE4D-208ENST00000502484 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa11.77□□□□□ -0.53
PDE4D-208ENST00000502484 SYCP2Q9BX26 1530 aa11.76□□□□□ -0.53
PDE4D-208ENST00000502484 RSPH4AQ5TD94 716 aa11.76□□□□□ -0.53
PDE4D-208ENST00000502484 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa11.76□□□□□ -0.53
PDE4D-208ENST00000502484 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa11.76□□□□□ -0.53
PDE4D-208ENST00000502484 TSPY4P0CV99 314 aa11.76□□□□□ -0.53
PDE4D-208ENST00000502484 TSPY10P0CW01 314 aa11.76□□□□□ -0.53
PDE4D-208ENST00000502484 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa11.75□□□□□ -0.53
PDE4D-208ENST00000502484 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP11.75□□□□□ -0.531e-6■■■■□ 22.9
PDE4D-208ENST00000502484 ARAP3Q8WWN8 1544 aa11.75□□□□□ -0.53
PDE4D-208ENST00000502484 MIER1Q8N108 512 aa11.75□□□□□ -0.53
PDE4D-208ENST00000502484 KDM5DQ9BY66 1539 aa11.75□□□□□ -0.53
PDE4D-208ENST00000502484 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa11.74□□□□□ -0.53
PDE4D-208ENST00000502484 CFAP74Q9C0B2 1584 aa11.74□□□□□ -0.53
PDE4D-208ENST00000502484 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
PDE4D-208ENST00000502484 NEO1Q92859 1461 aa11.73□□□□□ -0.53
PDE4D-208ENST00000502484 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
PDE4D-208ENST00000502484 PLXNC1O60486 1568 aa11.73□□□□□ -0.53
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PDE4D-208ENST00000502484 ADGRL1O94910 1474 aa11.71□□□□□ -0.54
PDE4D-208ENST00000502484 ABCC1P33527 1531 aa11.71□□□□□ -0.54
PDE4D-208ENST00000502484 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa11.69□□□□□ -0.54
PDE4D-208ENST00000502484 SCAPERQ9BY12 1400 aa11.69□□□□□ -0.54
PDE4D-208ENST00000502484 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
PDE4D-208ENST00000502484 UNC13BO14795 1591 aa11.68□□□□□ -0.54
PDE4D-208ENST00000502484 RAPGEF3O95398 923 aa11.68□□□□□ -0.54
PDE4D-208ENST00000502484 NUP155O75694 1391 aa11.67□□□□□ -0.54
PDE4D-208ENST00000502484 L3MBTL2Q969R5 705 aa11.66□□□□□ -0.54
PDE4D-208ENST00000502484 DUOX2Q9NRD8 1548 aa11.65□□□□□ -0.54
PDE4D-208ENST00000502484 PKD2Q13563 968 aa11.65□□□□□ -0.54
PDE4D-208ENST00000502484 RICTORQ6R327 1708 aa11.65□□□□□ -0.54
PDE4D-208ENST00000502484 FAM135AQ9P2D6 1515 aa11.65□□□□□ -0.55
PDE4D-208ENST00000502484 AFAP1Q8N556 730 aa11.64□□□□□ -0.55
PDE4D-208ENST00000502484 POGZQ7Z3K3 1410 aa11.64□□□□□ -0.55
PDE4D-208ENST00000502484 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
PDE4D-208ENST00000502484 IQGAP3Q86VI3 1631 aa11.64□□□□□ -0.55
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