RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491867.5

ATG4B-222, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 5

Gene ATG4B, Length 435 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-222ENST00000491867 DMRT2Q9Y5R5 561 aa23.63■■□□□ 1.37
ATG4B-222ENST00000491867 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
ATG4B-222ENST00000491867 HECW1Q76N89 1606 aa23.61■■□□□ 1.37
ATG4B-222ENST00000491867 PREX1Q8TCU6 1659 aa23.58■■□□□ 1.37
ATG4B-222ENST00000491867 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa23.58■■□□□ 1.36
ATG4B-222ENST00000491867 SCAPERQ9BY12 1400 aa23.58■■□□□ 1.36
ATG4B-222ENST00000491867 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa23.57■■□□□ 1.36
ATG4B-222ENST00000491867 ATP10AO60312 1499 aa23.56■■□□□ 1.36
ATG4B-222ENST00000491867 STRCQ7RTU9 1775 aa23.55■■□□□ 1.36
ATG4B-222ENST00000491867 CSRNP3Q8WYN3 585 aa23.54■■□□□ 1.36
ATG4B-222ENST00000491867 C9orf84Q5VXU9 1444 aa23.52■■□□□ 1.36
ATG4B-222ENST00000491867 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa23.51■■□□□ 1.35
ATG4B-222ENST00000491867 PLCH2O75038 1416 aa23.5■■□□□ 1.35
ATG4B-222ENST00000491867 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
ATG4B-222ENST00000491867 PTPRTO14522 1441 aa23.45■■□□□ 1.34
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ATG4B-222ENST00000491867 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa23.44■■□□□ 1.34
ATG4B-222ENST00000491867 LTBP4Q8N2S1 1624 aa23.39■■□□□ 1.33
ATG4B-222ENST00000491867 AFAP1Q8N556 730 aa23.38■■□□□ 1.33
ATG4B-222ENST00000491867 MYT1LQ9UL68 1186 aa23.38■■□□□ 1.33
ATG4B-222ENST00000491867 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa23.36■■□□□ 1.33
ATG4B-222ENST00000491867 IQSEC2Q5JU85 1478 aa23.36■■□□□ 1.33
ATG4B-222ENST00000491867 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
ATG4B-222ENST00000491867 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
ATG4B-222ENST00000491867 MYO5CQ9NQX4 1742 aa23.32■■□□□ 1.32
ATG4B-222ENST00000491867 NCOA1Q15788 1441 aa23.31■■□□□ 1.32
ATG4B-222ENST00000491867 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa23.31■■□□□ 1.32
ATG4B-222ENST00000491867 C3P01024 1663 aa23.31■■□□□ 1.32
ATG4B-222ENST00000491867 KDM5CP41229 1560 aa23.31■■□□□ 1.32
ATG4B-222ENST00000491867 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa23.29■■□□□ 1.32
ATG4B-222ENST00000491867 ARHGAP5Q13017 1502 aa23.28■■□□□ 1.32
ATG4B-222ENST00000491867 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
ATG4B-222ENST00000491867 REREQ9P2R6 1566 aa23.26■■□□□ 1.31
ATG4B-222ENST00000491867 KIF14Q15058 1648 aa23.26■■□□□ 1.31
ATG4B-222ENST00000491867 UBAP1LF5GYI3 381 aa23.25■■□□□ 1.31
ATG4B-222ENST00000491867 EEA1Q15075 1411 aa23.25■■□□□ 1.31
ATG4B-222ENST00000491867 ABCA6Q8N139 1617 aa23.23■■□□□ 1.31
ATG4B-222ENST00000491867 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
ATG4B-222ENST00000491867 MLH3Q9UHC1 1453 aa23.22■■□□□ 1.31
ATG4B-222ENST00000491867 AGLP35573 1532 aa23.22■■□□□ 1.31
ATG4B-222ENST00000491867 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa23.19■■□□□ 1.3
ATG4B-222ENST00000491867 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
ATG4B-222ENST00000491867 CNTLNQ9NXG0 1405 aa23.19■■□□□ 1.3
ATG4B-222ENST00000491867 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa23.19■■□□□ 1.3
ATG4B-222ENST00000491867 FMN1Q68DA7 1419 aa23.17■■□□□ 1.3
ATG4B-222ENST00000491867 CLIP1P30622 1438 aa23.16■■□□□ 1.3
ATG4B-222ENST00000491867 NPATQ14207 1427 aa23.14■■□□□ 1.29
ATG4B-222ENST00000491867 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa23.11■■□□□ 1.29
ATG4B-222ENST00000491867 ZMYM3Q14202 1370 aa23.1■■□□□ 1.29
ATG4B-222ENST00000491867 ABCC1P33527 1531 aa23.09■■□□□ 1.29
ATG4B-222ENST00000491867 PKD2Q13563 968 aa23.09■■□□□ 1.29
ATG4B-222ENST00000491867 EHMT2Q96KQ7 1210 aa23.09■■□□□ 1.29
ATG4B-222ENST00000491867 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa23.08■■□□□ 1.29
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ATG4B-222ENST00000491867 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa23.06■■□□□ 1.28
ATG4B-222ENST00000491867 HSPA1LP34931 641 aa23.05■■□□□ 1.28
ATG4B-222ENST00000491867 MROH2AA6NES4 1674 aa23.05■■□□□ 1.28
ATG4B-222ENST00000491867 ITSN2Q9NZM3 1697 aa23.05■■□□□ 1.28
ATG4B-222ENST00000491867 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
ATG4B-222ENST00000491867 PLA2R1Q13018 1463 aa23.04■■□□□ 1.28
ATG4B-222ENST00000491867 PREX2Q70Z35 1606 aa23.04■■□□□ 1.28
ATG4B-222ENST00000491867 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
ATG4B-222ENST00000491867 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
ATG4B-222ENST00000491867 PIP4K2BP78356 416 aa23.01■■□□□ 1.27
ATG4B-222ENST00000491867 PPP6R1Q9UPN7 881 aa23.01■■□□□ 1.27
ATG4B-222ENST00000491867 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa22.99■■□□□ 1.27
ATG4B-222ENST00000491867 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa22.98■■□□□ 1.27
ATG4B-222ENST00000491867 MYO3AQ8NEV4 1616 aa22.98■■□□□ 1.27
ATG4B-222ENST00000491867 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
ATG4B-222ENST00000491867 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
ATG4B-222ENST00000491867 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
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ATG4B-222ENST00000491867 PTPRKQ15262 1439 aa22.97■■□□□ 1.27
ATG4B-222ENST00000491867 TOM1O60784 492 aa22.95■■□□□ 1.26
ATG4B-222ENST00000491867 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
ATG4B-222ENST00000491867 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
ATG4B-222ENST00000491867 GGT6Q6P531 493 aa22.93■■□□□ 1.26
ATG4B-222ENST00000491867 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP22.92■■□□□ 1.26
ATG4B-222ENST00000491867 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa22.91■■□□□ 1.26
ATG4B-222ENST00000491867 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
ATG4B-222ENST00000491867 SYCP2Q9BX26 1530 aa22.9■■□□□ 1.26
ATG4B-222ENST00000491867 A2MP01023 1474 aa22.88■■□□□ 1.25
ATG4B-222ENST00000491867 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.88■■□□□ 1.25
ATG4B-222ENST00000491867 ATP7AQ04656 1500 aa22.87■■□□□ 1.25
ATG4B-222ENST00000491867 A2ML1A8K2U0 1454 aa22.86■■□□□ 1.25
ATG4B-222ENST00000491867 PLXNC1O60486 1568 aa22.86■■□□□ 1.25
ATG4B-222ENST00000491867 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.86■■□□□ 1.25
ATG4B-222ENST00000491867 CPS1P31327 1500 aa22.86■■□□□ 1.25
ATG4B-222ENST00000491867 SHANK2Q9UPX8 1470 aa22.85■■□□□ 1.25
ATG4B-222ENST00000491867 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
ATG4B-222ENST00000491867 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
ATG4B-222ENST00000491867 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa22.81■■□□□ 1.24
ATG4B-222ENST00000491867 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
ATG4B-222ENST00000491867 NEURL4Q96JN8 1562 aa22.79■■□□□ 1.24
ATG4B-222ENST00000491867 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
ATG4B-222ENST00000491867 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa22.78■■□□□ 1.24
ATG4B-222ENST00000491867 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
ATG4B-222ENST00000491867 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
ATG4B-222ENST00000491867 TNRQ92752 1358 aa22.76■■□□□ 1.23
ATG4B-222ENST00000491867 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
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