RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491139.5

NELFE-210, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 3

Gene NELFE, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-210ENST00000491139 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa34.76■■■■□ 3.16
NELFE-210ENST00000491139 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP34.7■■■■□ 3.15
NELFE-210ENST00000491139 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa34.68■■■■□ 3.14
NELFE-210ENST00000491139 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa34.68■■■■□ 3.14
NELFE-210ENST00000491139 ATP10AO60312 1499 aa34.66■■■■□ 3.14
NELFE-210ENST00000491139 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP34.64■■■■□ 3.14
NELFE-210ENST00000491139 FMN1Q68DA7 1419 aa34.64■■■■□ 3.14
NELFE-210ENST00000491139 UBTFP17480 764 aaKnown RBP34.62■■■■□ 3.13
NELFE-210ENST00000491139 C9orf84Q5VXU9 1444 aa34.62■■■■□ 3.13
NELFE-210ENST00000491139 CERKQ8TCT0 537 aa34.61■■■■□ 3.13
NELFE-210ENST00000491139 MYO5CQ9NQX4 1742 aa34.6■■■■□ 3.13
NELFE-210ENST00000491139 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa34.6■■■■□ 3.13
NELFE-210ENST00000491139 EHMT2Q96KQ7 1210 aa34.59■■■■□ 3.13
NELFE-210ENST00000491139 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP34.52■■■■□ 3.12
NELFE-210ENST00000491139 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa34.52■■■■□ 3.12
NELFE-210ENST00000491139 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa34.52■■■■□ 3.12
NELFE-210ENST00000491139 KIF14Q15058 1648 aa34.5■■■■□ 3.11
NELFE-210ENST00000491139 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP34.49■■■■□ 3.11
NELFE-210ENST00000491139 AFAP1Q8N556 730 aa34.49■■■■□ 3.11
NELFE-210ENST00000491139 PREX1Q8TCU6 1659 aa34.49■■■■□ 3.11
NELFE-210ENST00000491139 MYT1LQ9UL68 1186 aa34.48■■■■□ 3.11
NELFE-210ENST00000491139 ARHGAP5Q13017 1502 aa34.48■■■■□ 3.11
NELFE-210ENST00000491139 CLIP1P30622 1438 aa34.46■■■■□ 3.11
NELFE-210ENST00000491139 KDM5CP41229 1560 aa34.43■■■■□ 3.1
NELFE-210ENST00000491139 DMRT2Q9Y5R5 561 aa34.42■■■■□ 3.1
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NELFE-210ENST00000491139 MLH3Q9UHC1 1453 aa34.33■■■■□ 3.09
NELFE-210ENST00000491139 REREQ9P2R6 1566 aa34.32■■■■□ 3.09
NELFE-210ENST00000491139 STRCQ7RTU9 1775 aa34.32■■■■□ 3.08
NELFE-210ENST00000491139 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa34.3■■■■□ 3.08
NELFE-210ENST00000491139 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa34.3■■■■□ 3.08
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NELFE-210ENST00000491139 ABCA6Q8N139 1617 aa34.27■■■■□ 3.08
NELFE-210ENST00000491139 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa34.25■■■■□ 3.07
NELFE-210ENST00000491139 AGLP35573 1532 aa34.25■■■■□ 3.07
NELFE-210ENST00000491139 PREX2Q70Z35 1606 aa34.23■■■■□ 3.07
NELFE-210ENST00000491139 ABCC1P33527 1531 aa34.23■■■■□ 3.07
NELFE-210ENST00000491139 C3P01024 1663 aa34.22■■■■□ 3.07
NELFE-210ENST00000491139 CCDC18Q5T9S5 1454 aa34.2■■■■□ 3.07
NELFE-210ENST00000491139 PTPRTO14522 1441 aa34.19■■■■□ 3.06
NELFE-210ENST00000491139 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa34.19■■■■□ 3.06
NELFE-210ENST00000491139 CHIC1Q5VXU3 224 aa34.18■■■■□ 3.06
NELFE-210ENST00000491139 ITSN2Q9NZM3 1697 aa34.17■■■■□ 3.06
NELFE-210ENST00000491139 CNTLNQ9NXG0 1405 aa34.13■■■■□ 3.05
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NELFE-210ENST00000491139 DISP3Q9P2K9 1392 aa34.12■■■■□ 3.05
NELFE-210ENST00000491139 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa34.09■■■■□ 3.05
NELFE-210ENST00000491139 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP34.08■■■■□ 3.05
NELFE-210ENST00000491139 NCOA1Q15788 1441 aa34.04■■■■□ 3.04
NELFE-210ENST00000491139 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa34.03■■■■□ 3.04
NELFE-210ENST00000491139 FYCO1Q9BQS8 1478 aa34.01■■■■□ 3.04
NELFE-210ENST00000491139 ILDR2Q71H61 639 aa34.01■■■■□ 3.03
NELFE-210ENST00000491139 NPATQ14207 1427 aa34.01■■■■□ 3.03
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NELFE-210ENST00000491139 ZMYM3Q14202 1370 aa33.98■■■■□ 3.03
NELFE-210ENST00000491139 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP33.98■■■■□ 3.03
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NELFE-210ENST00000491139 MROH2AA6NES4 1674 aa33.96■■■■□ 3.03
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NELFE-210ENST00000491139 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa33.94■■■■□ 3.02
NELFE-210ENST00000491139 SOCS7O14512 581 aa33.92■■■■□ 3.02
NELFE-210ENST00000491139 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP33.92■■■■□ 3.02
NELFE-210ENST00000491139 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP33.91■■■■□ 3.02
NELFE-210ENST00000491139 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa33.9■■■■□ 3.02
NELFE-210ENST00000491139 ATP7AQ04656 1500 aa33.89■■■■□ 3.02
NELFE-210ENST00000491139 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa33.88■■■■□ 3.01
NELFE-210ENST00000491139 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa33.87■■■■□ 3.01
NELFE-210ENST00000491139 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa33.85■■■■□ 3.01
NELFE-210ENST00000491139 A2MP01023 1474 aa33.85■■■■□ 3.01
NELFE-210ENST00000491139 CCNB3Q8WWL7 1395 aa33.85■■■■□ 3.01
NELFE-210ENST00000491139 GGT6Q6P531 493 aa33.83■■■■□ 3.01
NELFE-210ENST00000491139 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP33.83■■■■□ 3.01
NELFE-210ENST00000491139 PLXNC1O60486 1568 aa33.82■■■■□ 3
NELFE-210ENST00000491139 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP33.81■■■■□ 3
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NELFE-210ENST00000491139 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP33.79■■■■□ 3
NELFE-210ENST00000491139 PTPRKQ15262 1439 aa33.79■■■■□ 3
NELFE-210ENST00000491139 PLA2R1Q13018 1463 aa33.77■■■■□ 3
NELFE-210ENST00000491139 PPP6R1Q9UPN7 881 aa33.77■■■■□ 3
NELFE-210ENST00000491139 MYO3AQ8NEV4 1616 aa33.77■■■■□ 3
NELFE-210ENST00000491139 MTUS2Q5JR59 1369 aa33.76■■■■□ 3
NELFE-210ENST00000491139 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP33.76■■■□□ 2.99
NELFE-210ENST00000491139 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP33.74■■■□□ 2.99
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NELFE-210ENST00000491139 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP33.71■■■□□ 2.99
NELFE-210ENST00000491139 ADGBQ8N7X0 1667 aa33.69■■■□□ 2.98
NELFE-210ENST00000491139 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP33.68■■■□□ 2.98
NELFE-210ENST00000491139 MBD5Q9P267 1494 aa33.62■■■□□ 2.97
NELFE-210ENST00000491139 TIAM1Q13009 1591 aa33.61■■■□□ 2.97
NELFE-210ENST00000491139 A2ML1A8K2U0 1454 aa33.61■■■□□ 2.97
NELFE-210ENST00000491139 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa33.61■■■□□ 2.97
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NELFE-210ENST00000491139 KIF3BO15066 747 aa33.53■■■□□ 2.96
NELFE-210ENST00000491139 CEP162Q5TB80 1403 aa33.53■■■□□ 2.96
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