RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489616.1

THUMPD3-AS1-206, THUMPD3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene THUMPD3-AS1, Length 583 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 SCAPERQ9BY12 1400 aa26.73■■□□□ 1.87
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THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa26.72■■□□□ 1.87
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 PLCH2O75038 1416 aa26.72■■□□□ 1.87
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 C9orf84Q5VXU9 1444 aa26.71■■□□□ 1.87
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 ATP10AO60312 1499 aa26.7■■□□□ 1.87
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
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THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 STRCQ7RTU9 1775 aa26.56■■□□□ 1.84
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THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
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THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 REREQ9P2R6 1566 aa26.5■■□□□ 1.83
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 MYT1LQ9UL68 1186 aa26.49■■□□□ 1.83
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 ILDR2Q71H61 639 aa26.48■■□□□ 1.83
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa26.48■■□□□ 1.83
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 PTPRTO14522 1441 aa26.48■■□□□ 1.83
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 CLIP1P30622 1438 aa26.48■■□□□ 1.83
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
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THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 MLH3Q9UHC1 1453 aa26.42■■□□□ 1.82
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 ABCA6Q8N139 1617 aa26.41■■□□□ 1.82
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 AGLP35573 1532 aa26.4■■□□□ 1.82
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa26.38■■□□□ 1.81
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa26.38■■□□□ 1.81
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THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 ABCC1P33527 1531 aa26.34■■□□□ 1.81
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 NCOA1Q15788 1441 aa26.33■■□□□ 1.81
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 PREX2Q70Z35 1606 aa26.33■■□□□ 1.81
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 ITSN2Q9NZM3 1697 aa26.3■■□□□ 1.8
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THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa26.16■■□□□ 1.78
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa26.16■■□□□ 1.78
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 ZMYM3Q14202 1370 aa26.15■■□□□ 1.78
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 PLA2R1Q13018 1463 aa26.12■■□□□ 1.77
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THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 UBAP1LF5GYI3 381 aa26.11■■□□□ 1.77
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THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 SYCP2Q9BX26 1530 aa26.1■■□□□ 1.77
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 PKD2Q13563 968 aa26.1■■□□□ 1.77
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THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa26.1■■□□□ 1.77
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THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 ATP7AQ04656 1500 aa26.07■■□□□ 1.76
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THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 PLXNC1O60486 1568 aa26.06■■□□□ 1.76
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa26.04■■□□□ 1.76
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 A2MP01023 1474 aa26.04■■□□□ 1.76
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THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP26.03■■□□□ 1.76
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa26.02■■□□□ 1.76
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP26■■□□□ 1.75
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 PPP6R1Q9UPN7 881 aa25.99■■□□□ 1.75
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 GGT6Q6P531 493 aa25.96■■□□□ 1.75
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 ADGBQ8N7X0 1667 aa25.93■■□□□ 1.74
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 A2ML1A8K2U0 1454 aa25.93■■□□□ 1.74
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 CCNB3Q8WWL7 1395 aa25.93■■□□□ 1.74
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 CPS1P31327 1500 aa25.88■■□□□ 1.73
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 TOM1O60784 492 aa25.86■■□□□ 1.73
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 HSPA1LP34931 641 aa25.84■■□□□ 1.73
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 MTUS2Q5JR59 1369 aa25.83■■□□□ 1.73
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 PIP4K2BP78356 416 aa25.83■■□□□ 1.73
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 CHIC1Q5VXU3 224 aa25.83■■□□□ 1.73
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 SHANK2Q9UPX8 1470 aa25.81■■□□□ 1.72
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