RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489450.1

RABGGTB-211, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 586 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-211ENST00000489450 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP7.94□□□□□ -1.141e-7■□□□□ 10.5
RABGGTB-211ENST00000489450 ST18O60284 1047 aa7.93□□□□□ -1.14
RABGGTB-211ENST00000489450 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
RABGGTB-211ENST00000489450 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
RABGGTB-211ENST00000489450 DPY19L2Q6NUT2 758 aa7.9□□□□□ -1.14
RABGGTB-211ENST00000489450 CDAN1Q8IWY9 1227 aa7.9□□□□□ -1.14
RABGGTB-211ENST00000489450 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
RABGGTB-211ENST00000489450 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa7.83□□□□□ -1.16
RABGGTB-211ENST00000489450 SNPHO15079 494 aa7.83□□□□□ -1.16
RABGGTB-211ENST00000489450 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
RABGGTB-211ENST00000489450 MICALL2Q8IY33 904 aa7.82□□□□□ -1.16
RABGGTB-211ENST00000489450 BCANQ96GW7 911 aa7.82□□□□□ -1.16
RABGGTB-211ENST00000489450 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP7.82□□□□□ -1.16
RABGGTB-211ENST00000489450 WDR70Q9NW82 654 aa7.82□□□□□ -1.16
RABGGTB-211ENST00000489450 C3orf67Q6ZVT6 689 aa7.81□□□□□ -1.16
RABGGTB-211ENST00000489450 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa7.8□□□□□ -1.16
RABGGTB-211ENST00000489450 BOLA1Q9Y3E2 137 aa7.8□□□□□ -1.16
RABGGTB-211ENST00000489450 PDE4AP27815 886 aa7.79□□□□□ -1.16
RABGGTB-211ENST00000489450 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP7.79□□□□□ -1.16
RABGGTB-211ENST00000489450 MARVELD3Q96A59 401 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGGTB-211ENST00000489450 G3V3G9 751 aa7.77□□□□□ -1.17
RABGGTB-211ENST00000489450 KCNV2Q8TDN2 545 aa7.77□□□□□ -1.17
RABGGTB-211ENST00000489450 MFSD10Q14728 455 aa7.76□□□□□ -1.17
RABGGTB-211ENST00000489450 P3H3Q8IVL6 736 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGGTB-211ENST00000489450 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP7.75□□□□□ -1.17
RABGGTB-211ENST00000489450 NBR1Q14596 966 aa7.74□□□□□ -1.17
RABGGTB-211ENST00000489450 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP7.74□□□□□ -1.17
RABGGTB-211ENST00000489450 E2F4Q16254 413 aa7.73□□□□□ -1.17
RABGGTB-211ENST00000489450 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa7.72□□□□□ -1.17
RABGGTB-211ENST00000489450 SPNS2Q8IVW8 549 aa7.72□□□□□ -1.17
RABGGTB-211ENST00000489450 TMC2Q8TDI7 906 aa7.72□□□□□ -1.17
RABGGTB-211ENST00000489450 EMP3P54852 163 aa7.71□□□□□ -1.18
RABGGTB-211ENST00000489450 TMEM92Q6UXU6 159 aa7.71□□□□□ -1.18
RABGGTB-211ENST00000489450 POTEB3A0JP26 581 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGGTB-211ENST00000489450 C2orf72A6NCS6 295 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGGTB-211ENST00000489450 MMRN1Q13201 1228 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGGTB-211ENST00000489450 DSG2Q14126 1118 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGGTB-211ENST00000489450 POTEBQ6S5H4 581 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGGTB-211ENST00000489450 KIF3CO14782 793 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGGTB-211ENST00000489450 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP7.68□□□□□ -1.18
RABGGTB-211ENST00000489450 HS3ST6Q96QI5 342 aa7.68□□□□□ -1.18
RABGGTB-211ENST00000489450 FAM205CA6NFA0 338 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGGTB-211ENST00000489450 FOXK1P85037 733 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGGTB-211ENST00000489450 CAMK2BQ13554 666 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGGTB-211ENST00000489450 PLPP6Q8IY26 295 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGGTB-211ENST00000489450 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP7.66□□□□□ -1.18
RABGGTB-211ENST00000489450 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGGTB-211ENST00000489450 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGGTB-211ENST00000489450 EMILIN3Q9NT22 766 aa7.64□□□□□ -1.19
RABGGTB-211ENST00000489450 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP7.62□□□□□ -1.19
RABGGTB-211ENST00000489450 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP7.61□□□□□ -1.19
RABGGTB-211ENST00000489450 DPYSL4O14531 572 aa7.6□□□□□ -1.19
RABGGTB-211ENST00000489450 SEMA3EO15041 775 aa7.6□□□□□ -1.19
RABGGTB-211ENST00000489450 DOK7Q18PE1 504 aa7.6□□□□□ -1.19
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF710Q8N1W2 664 aa7.6□□□□□ -1.19
RABGGTB-211ENST00000489450 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
RABGGTB-211ENST00000489450 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP7.59□□□□□ -1.19
RABGGTB-211ENST00000489450 TPRNQ4KMQ1 711 aa7.58□□□□□ -1.2
RABGGTB-211ENST00000489450 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
RABGGTB-211ENST00000489450 ERBB3P21860 1342 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGGTB-211ENST00000489450 OXER1Q8TDS5 423 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGGTB-211ENST00000489450 RIMBP2O15034 1052 aa7.54□□□□□ -1.2
RABGGTB-211ENST00000489450 MAP3K9P80192 1104 aa7.54□□□□□ -1.2
RABGGTB-211ENST00000489450 PDIA6Q15084 440 aa7.54□□□□□ -1.2
RABGGTB-211ENST00000489450 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
RABGGTB-211ENST00000489450 LMOD2Q6P5Q4 547 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGGTB-211ENST00000489450 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP7.53□□□□□ -1.2
RABGGTB-211ENST00000489450 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
RABGGTB-211ENST00000489450 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa7.52□□□□□ -1.21
RABGGTB-211ENST00000489450 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
RABGGTB-211ENST00000489450 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
RABGGTB-211ENST00000489450 GPR153Q6NV75 609 aa7.51□□□□□ -1.21
RABGGTB-211ENST00000489450 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
RABGGTB-211ENST00000489450 SLC34A2O95436 690 aa7.5□□□□□ -1.21
RABGGTB-211ENST00000489450 SMYD5Q6GMV2 418 aa7.49□□□□□ -1.21
RABGGTB-211ENST00000489450 TBC1D12O60347 775 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGGTB-211ENST00000489450 EVI5O60447 810 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGGTB-211ENST00000489450 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF687Q8N1G0 1237 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGGTB-211ENST00000489450 GRXCR2A6NFK2 248 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGGTB-211ENST00000489450 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
RABGGTB-211ENST00000489450 ARSIQ5FYB1 569 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGGTB-211ENST00000489450 DDX12PQ92771 950 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
RABGGTB-211ENST00000489450 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP7.44□□□□□ -1.221e-9■■■□□ 15.1
RABGGTB-211ENST00000489450 PTGER2P43116 358 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGGTB-211ENST00000489450 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
RABGGTB-211ENST00000489450 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
RABGGTB-211ENST00000489450 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
RABGGTB-211ENST00000489450 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa7.41□□□□□ -1.22
RABGGTB-211ENST00000489450 NUDT7P0C024 238 aa7.41□□□□□ -1.22
RABGGTB-211ENST00000489450 OSBPP22059 807 aa7.41□□□□□ -1.22
RABGGTB-211ENST00000489450 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
RABGGTB-211ENST00000489450 GPIHBP1Q8IV16 184 aa7.4□□□□□ -1.22
RABGGTB-211ENST00000489450 MYT1LQ9UL68 1186 aa7.4□□□□□ -1.22
RABGGTB-211ENST00000489450 PHF14O94880 888 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGGTB-211ENST00000489450 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGGTB-211ENST00000489450 NUTM2FA1L443 756 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGGTB-211ENST00000489450 GPR37O15354 613 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGGTB-211ENST00000489450 ZMYND10O75800 440 aa7.35□□□□□ -1.23
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