RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480643.1

C1orf159-217, Transcript of chromosome 1 open reading frame 159, humanhuman

TSL 4

Gene C1orf159, Length 579 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf159-217ENST00000480643 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
C1orf159-217ENST00000480643 ARHGAP5Q13017 1502 aa24.66■■□□□ 1.54
C1orf159-217ENST00000480643 VPS8Q8N3P4 1428 aa24.66■■□□□ 1.54
C1orf159-217ENST00000480643 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa24.63■■□□□ 1.53
C1orf159-217ENST00000480643 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa24.62■■□□□ 1.53
C1orf159-217ENST00000480643 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa24.61■■□□□ 1.53
C1orf159-217ENST00000480643 TIAM1Q13009 1591 aa24.6■■□□□ 1.53
C1orf159-217ENST00000480643 MTUS2Q5JR59 1369 aa24.6■■□□□ 1.53
C1orf159-217ENST00000480643 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa24.6■■□□□ 1.53
C1orf159-217ENST00000480643 POGZQ7Z3K3 1410 aa24.6■■□□□ 1.53
C1orf159-217ENST00000480643 SCAPERQ9BY12 1400 aa24.59■■□□□ 1.53
C1orf159-217ENST00000480643 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
C1orf159-217ENST00000480643 ITSN2Q9NZM3 1697 aa24.56■■□□□ 1.52
C1orf159-217ENST00000480643 ABCC1P33527 1531 aa24.56■■□□□ 1.52
C1orf159-217ENST00000480643 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
C1orf159-217ENST00000480643 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa24.52■■□□□ 1.52
C1orf159-217ENST00000480643 KDM5CP41229 1560 aa24.52■■□□□ 1.52
C1orf159-217ENST00000480643 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa24.52■■□□□ 1.52
C1orf159-217ENST00000480643 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
C1orf159-217ENST00000480643 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
C1orf159-217ENST00000480643 ADAMTSL3P82987 1691 aa24.51■■□□□ 1.51
C1orf159-217ENST00000480643 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa24.51■■□□□ 1.51
C1orf159-217ENST00000480643 MAGI2Q86UL8 1455 aa24.51■■□□□ 1.51
C1orf159-217ENST00000480643 PTPRMP28827 1452 aa24.49■■□□□ 1.51
C1orf159-217ENST00000480643 MAP3K1Q13233 1512 aa24.49■■□□□ 1.51
C1orf159-217ENST00000480643 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa24.49■■□□□ 1.51
C1orf159-217ENST00000480643 BCORL1Q5H9F3 1711 aa24.48■■□□□ 1.51
C1orf159-217ENST00000480643 YEATS2Q9ULM3 1422 aa24.48■■□□□ 1.51
C1orf159-217ENST00000480643 CCNB3Q8WWL7 1395 aa24.47■■□□□ 1.51
C1orf159-217ENST00000480643 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa24.47■■□□□ 1.51
C1orf159-217ENST00000480643 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa24.45■■□□□ 1.51
C1orf159-217ENST00000480643 MADDQ8WXG6 1647 aa24.45■■□□□ 1.5
C1orf159-217ENST00000480643 SYCP2Q9BX26 1530 aa24.44■■□□□ 1.5
C1orf159-217ENST00000480643 NCOA2Q15596 1464 aa24.44■■□□□ 1.5
C1orf159-217ENST00000480643 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa24.43■■□□□ 1.5
C1orf159-217ENST00000480643 PLPPR3Q6T4P5 718 aa24.42■■□□□ 1.5
C1orf159-217ENST00000480643 AFAP1Q8N556 730 aa24.4■■□□□ 1.5
C1orf159-217ENST00000480643 ABCA6Q8N139 1617 aa24.39■■□□□ 1.49
C1orf159-217ENST00000480643 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa24.38■■□□□ 1.49
C1orf159-217ENST00000480643 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa24.38■■□□□ 1.49
C1orf159-217ENST00000480643 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
C1orf159-217ENST00000480643 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
C1orf159-217ENST00000480643 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
C1orf159-217ENST00000480643 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa24.38■■□□□ 1.49
C1orf159-217ENST00000480643 MLH3Q9UHC1 1453 aa24.38■■□□□ 1.49
C1orf159-217ENST00000480643 MLECQ14165 292 aa24.37■■□□□ 1.49
C1orf159-217ENST00000480643 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa24.36■■□□□ 1.49
C1orf159-217ENST00000480643 ATP10AO60312 1499 aa24.36■■□□□ 1.49
C1orf159-217ENST00000480643 C9orf84Q5VXU9 1444 aa24.35■■□□□ 1.49
C1orf159-217ENST00000480643 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
C1orf159-217ENST00000480643 REREQ9P2R6 1566 aa24.33■■□□□ 1.48
C1orf159-217ENST00000480643 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
C1orf159-217ENST00000480643 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP24.29■■□□□ 1.482e-6■■■■□ 25.8
C1orf159-217ENST00000480643 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa24.29■■□□□ 1.48
C1orf159-217ENST00000480643 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
C1orf159-217ENST00000480643 MBD5Q9P267 1494 aa24.28■■□□□ 1.48
C1orf159-217ENST00000480643 ATP7AQ04656 1500 aa24.27■■□□□ 1.48
C1orf159-217ENST00000480643 MYT1LQ9UL68 1186 aa24.27■■□□□ 1.48
C1orf159-217ENST00000480643 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa24.26■■□□□ 1.47
C1orf159-217ENST00000480643 LMTK3Q96Q04 1460 aa24.25■■□□□ 1.47
C1orf159-217ENST00000480643 APLP2Q06481 763 aa24.24■■□□□ 1.47
C1orf159-217ENST00000480643 MYOM3Q5VTT5 1437 aa24.22■■□□□ 1.47
C1orf159-217ENST00000480643 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
C1orf159-217ENST00000480643 HSPA2P54652 639 aa24.22■■□□□ 1.47
C1orf159-217ENST00000480643 ARHGEF5Q12774 1597 aa24.21■■□□□ 1.47
C1orf159-217ENST00000480643 AGLP35573 1532 aa24.21■■□□□ 1.47
C1orf159-217ENST00000480643 CCDC141Q6ZP82 1450 aa24.19■■□□□ 1.46
C1orf159-217ENST00000480643 ADGBQ8N7X0 1667 aa24.19■■□□□ 1.46
C1orf159-217ENST00000480643 PLXNC1O60486 1568 aa24.18■■□□□ 1.46
C1orf159-217ENST00000480643 MIA2Q96PC5 1412 aa24.18■■□□□ 1.46
C1orf159-217ENST00000480643 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa24.14■■□□□ 1.45
C1orf159-217ENST00000480643 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
C1orf159-217ENST00000480643 PTPN23Q9H3S7 1636 aa24.12■■□□□ 1.45
C1orf159-217ENST00000480643 A2MP01023 1474 aa24.12■■□□□ 1.45
C1orf159-217ENST00000480643 MAST1Q9Y2H9 1570 aa24.09■■□□□ 1.45
C1orf159-217ENST00000480643 RSPH4AQ5TD94 716 aa24.09■■□□□ 1.45
C1orf159-217ENST00000480643 CROCC2H7BZ55 1655 aa24.08■■□□□ 1.45
C1orf159-217ENST00000480643 FBXO41Q8TF61 875 aa24.07■■□□□ 1.44
C1orf159-217ENST00000480643 FGD6Q6ZV73 1430 aa24.07■■□□□ 1.44
C1orf159-217ENST00000480643 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
C1orf159-217ENST00000480643 C3P01024 1663 aa24.02■■□□□ 1.44
C1orf159-217ENST00000480643 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
C1orf159-217ENST00000480643 MROH2AA6NES4 1674 aa24.01■■□□□ 1.43
C1orf159-217ENST00000480643 PREX1Q8TCU6 1659 aa23.99■■□□□ 1.43
C1orf159-217ENST00000480643 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
C1orf159-217ENST00000480643 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
C1orf159-217ENST00000480643 TSPY4P0CV99 314 aa23.98■■□□□ 1.43
C1orf159-217ENST00000480643 TSPY10P0CW01 314 aa23.98■■□□□ 1.43
C1orf159-217ENST00000480643 SHANK2Q9UPX8 1470 aa23.98■■□□□ 1.43
C1orf159-217ENST00000480643 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP23.97■■□□□ 1.43
C1orf159-217ENST00000480643 ABCC5O15440 1437 aa23.96■■□□□ 1.43
C1orf159-217ENST00000480643 CNTLNQ9NXG0 1405 aa23.96■■□□□ 1.43
C1orf159-217ENST00000480643 DAPK1P53355 1430 aa23.95■■□□□ 1.42
C1orf159-217ENST00000480643 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
C1orf159-217ENST00000480643 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa23.92■■□□□ 1.42
C1orf159-217ENST00000480643 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
C1orf159-217ENST00000480643 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
C1orf159-217ENST00000480643 GGT6Q6P531 493 aa23.88■■□□□ 1.41
C1orf159-217ENST00000480643 DUOX2Q9NRD8 1548 aa23.88■■□□□ 1.41
C1orf159-217ENST00000480643 FAM135AQ9P2D6 1515 aa23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 5.9 ms