RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479353.5

PTGER3-210, Transcript of prostaglandin E receptor 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTGER3, Length 1,895 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER3-210ENST00000479353 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP30.69■■■□□ 2.5
PTGER3-210ENST00000479353 CROCC2H7BZ55 1655 aa30.68■■■□□ 2.5
PTGER3-210ENST00000479353 KDM6BO15054 1643 aa30.67■■■□□ 2.5
PTGER3-210ENST00000479353 CHIC2Q9UKJ5 165 aa30.67■■■□□ 2.5
PTGER3-210ENST00000479353 KDM5BQ9UGL1 1544 aa30.65■■■□□ 2.5
PTGER3-210ENST00000479353 PREX2Q70Z35 1606 aa30.64■■■□□ 2.5
PTGER3-210ENST00000479353 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa30.64■■■□□ 2.5
PTGER3-210ENST00000479353 ROCK1Q13464 1354 aa30.64■■■□□ 2.5
PTGER3-210ENST00000479353 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa30.63■■■□□ 2.49
PTGER3-210ENST00000479353 TTC37Q6PGP7 1564 aa30.62■■■□□ 2.49
PTGER3-210ENST00000479353 ADGBQ8N7X0 1667 aa30.62■■■□□ 2.49
PTGER3-210ENST00000479353 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP30.59■■■□□ 2.49
PTGER3-210ENST00000479353 OSCARQ8IYS5 282 aa30.56■■■□□ 2.48
PTGER3-210ENST00000479353 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP30.54■■■□□ 2.48
PTGER3-210ENST00000479353 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa30.53■■■□□ 2.48
PTGER3-210ENST00000479353 ADGRL2O95490 1459 aa30.52■■■□□ 2.48
PTGER3-210ENST00000479353 MYO5CQ9NQX4 1742 aa30.52■■■□□ 2.48
PTGER3-210ENST00000479353 ARHGEF5Q12774 1597 aa30.49■■■□□ 2.47
PTGER3-210ENST00000479353 SHANK2Q9UPX8 1470 aa30.48■■■□□ 2.47
PTGER3-210ENST00000479353 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP30.47■■■□□ 2.47
PTGER3-210ENST00000479353 NCOA1Q15788 1441 aa30.46■■■□□ 2.47
PTGER3-210ENST00000479353 MBD5Q9P267 1494 aa30.45■■■□□ 2.46
PTGER3-210ENST00000479353 SIN3AQ96ST3 1273 aa30.44■■■□□ 2.46
PTGER3-210ENST00000479353 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP30.42■■■□□ 2.46
PTGER3-210ENST00000479353 ARHGAP5Q13017 1502 aa30.4■■■□□ 2.46
PTGER3-210ENST00000479353 C9orf84Q5VXU9 1444 aa30.38■■■□□ 2.45
PTGER3-210ENST00000479353 KCNH8Q96L42 1107 aa30.36■■■□□ 2.45
PTGER3-210ENST00000479353 SYCP2Q9BX26 1530 aa30.35■■■□□ 2.45
PTGER3-210ENST00000479353 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa30.35■■■□□ 2.45
PTGER3-210ENST00000479353 CCDC141Q6ZP82 1450 aa30.35■■■□□ 2.45
PTGER3-210ENST00000479353 WDR7Q9Y4E6 1490 aa30.34■■■□□ 2.45
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PTGER3-210ENST00000479353 PLCH2O75038 1416 aa30.32■■■□□ 2.44
PTGER3-210ENST00000479353 NEUROD1Q13562 356 aa30.32■■■□□ 2.44
PTGER3-210ENST00000479353 TRIM52Q96A61 297 aa30.31■■■□□ 2.44
PTGER3-210ENST00000479353 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP30.3■■■□□ 2.44
PTGER3-210ENST00000479353 MAST1Q9Y2H9 1570 aa30.29■■■□□ 2.44
PTGER3-210ENST00000479353 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa30.28■■■□□ 2.44
PTGER3-210ENST00000479353 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa30.27■■■□□ 2.44
PTGER3-210ENST00000479353 MPHOSPH9Q99550 1183 aa30.27■■■□□ 2.44
PTGER3-210ENST00000479353 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa30.27■■■□□ 2.44
PTGER3-210ENST00000479353 ARAP3Q8WWN8 1544 aa30.26■■■□□ 2.44
PTGER3-210ENST00000479353 ABCA9Q8IUA7 1624 aa30.25■■■□□ 2.43
PTGER3-210ENST00000479353 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa30.25■■■□□ 2.43
PTGER3-210ENST00000479353 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa30.24■■■□□ 2.43
PTGER3-210ENST00000479353 PZPP20742 1482 aa30.24■■■□□ 2.43
PTGER3-210ENST00000479353 ABCC1P33527 1531 aa30.23■■■□□ 2.43
PTGER3-210ENST00000479353 TSPY4P0CV99 314 aa30.23■■■□□ 2.43
PTGER3-210ENST00000479353 TSPY10P0CW01 314 aa30.23■■■□□ 2.43
PTGER3-210ENST00000479353 ASXL2Q76L83 1435 aa30.22■■■□□ 2.43
PTGER3-210ENST00000479353 RSPH4AQ5TD94 716 aa30.22■■■□□ 2.43
PTGER3-210ENST00000479353 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP30.2■■■□□ 2.42
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PTGER3-210ENST00000479353 PLXNC1O60486 1568 aa30.17■■■□□ 2.42
PTGER3-210ENST00000479353 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa30.15■■■□□ 2.42
PTGER3-210ENST00000479353 TONSLQ96HA7 1378 aa30.13■■■□□ 2.41
PTGER3-210ENST00000479353 KDM5DQ9BY66 1539 aa30.13■■■□□ 2.41
PTGER3-210ENST00000479353 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP30.12■■■□□ 2.41
PTGER3-210ENST00000479353 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa30.12■■■□□ 2.41
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PTGER3-210ENST00000479353 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa30.07■■■□□ 2.4
PTGER3-210ENST00000479353 FANCAO15360 1455 aa30.04■■■□□ 2.4
PTGER3-210ENST00000479353 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP30.02■■■□□ 2.4
PTGER3-210ENST00000479353 UNC13BO14795 1591 aa30.02■■■□□ 2.4
PTGER3-210ENST00000479353 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP30.02■■■□□ 2.4
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PTGER3-210ENST00000479353 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa30.01■■■□□ 2.39
PTGER3-210ENST00000479353 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa30.01■■■□□ 2.39
PTGER3-210ENST00000479353 DUOX2Q9NRD8 1548 aa29.99■■■□□ 2.39
PTGER3-210ENST00000479353 NUP155O75694 1391 aa29.99■■■□□ 2.39
PTGER3-210ENST00000479353 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa29.98■■■□□ 2.39
PTGER3-210ENST00000479353 TEX14Q8IWB6 1497 aa29.95■■■□□ 2.38
PTGER3-210ENST00000479353 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP29.93■■■□□ 2.38
PTGER3-210ENST00000479353 PKD2Q13563 968 aa29.93■■■□□ 2.38
PTGER3-210ENST00000479353 FAM135AQ9P2D6 1515 aa29.93■■■□□ 2.38
PTGER3-210ENST00000479353 ADGRL1O94910 1474 aa29.92■■■□□ 2.38
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PTGER3-210ENST00000479353 MAGI2Q86UL8 1455 aa29.9■■■□□ 2.38
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PTGER3-210ENST00000479353 CD109Q6YHK3 1445 aa29.85■■■□□ 2.37
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PTGER3-210ENST00000479353 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa29.78■■■□□ 2.36
PTGER3-210ENST00000479353 DEPDC5O75140 1603 aa29.77■■■□□ 2.36
PTGER3-210ENST00000479353 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa29.76■■■□□ 2.35
PTGER3-210ENST00000479353 KDM5CP41229 1560 aa29.74■■■□□ 2.35
PTGER3-210ENST00000479353 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa29.74■■■□□ 2.35
PTGER3-210ENST00000479353 MIER1Q8N108 512 aa29.72■■■□□ 2.35
PTGER3-210ENST00000479353 GLI2P10070 1586 aa29.71■■■□□ 2.35
PTGER3-210ENST00000479353 POGZQ7Z3K3 1410 aa29.71■■■□□ 2.35
PTGER3-210ENST00000479353 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP29.7■■■□□ 2.35
PTGER3-210ENST00000479353 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP29.7■■■□□ 2.34
PTGER3-210ENST00000479353 NEO1Q92859 1461 aa29.69■■■□□ 2.34
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