RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478849.1

OPN3-205, Transcript of opsin 3, humanhuman

TSL 3

Gene OPN3, Length 880 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN3-205ENST00000478849 UBTFP17480 764 aaKnown RBP40.51■■■■■ 4.08
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OPN3-205ENST00000478849 MLECQ14165 292 aa40.49■■■■■ 4.07
OPN3-205ENST00000478849 HSPA2P54652 639 aa40.48■■■■■ 4.07
OPN3-205ENST00000478849 FMN1Q68DA7 1419 aa40.44■■■■■ 4.06
OPN3-205ENST00000478849 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa40.4■■■■■ 4.06
OPN3-205ENST00000478849 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa40.4■■■■■ 4.06
OPN3-205ENST00000478849 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP40.37■■■■■ 4.05
OPN3-205ENST00000478849 ATP10AO60312 1499 aa40.34■■■■■ 4.05
OPN3-205ENST00000478849 MYO5CQ9NQX4 1742 aa40.33■■■■■ 4.05
OPN3-205ENST00000478849 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa40.32■■■■■ 4.04
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OPN3-205ENST00000478849 C9orf84Q5VXU9 1444 aa40.29■■■■■ 4.04
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OPN3-205ENST00000478849 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa40.25■■■■■ 4.03
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OPN3-205ENST00000478849 ARHGAP5Q13017 1502 aa40.21■■■■■ 4.03
OPN3-205ENST00000478849 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa40.2■■■■■ 4.03
OPN3-205ENST00000478849 CHIC1Q5VXU3 224 aa40.2■■■■■ 4.03
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OPN3-205ENST00000478849 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP40.18■■■■■ 4.02
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OPN3-205ENST00000478849 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa40.13■■■■■ 4.02
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OPN3-205ENST00000478849 AGLP35573 1532 aa39.86■■■■□ 3.97
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OPN3-205ENST00000478849 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa39.7■■■■□ 3.95
OPN3-205ENST00000478849 CNTLNQ9NXG0 1405 aa39.69■■■■□ 3.94
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OPN3-205ENST00000478849 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP39.66■■■■□ 3.94
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OPN3-205ENST00000478849 MROH2AA6NES4 1674 aa39.51■■■■□ 3.92
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OPN3-205ENST00000478849 LTBP4Q8N2S1 1624 aa39.49■■■■□ 3.91
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OPN3-205ENST00000478849 MYO3AQ8NEV4 1616 aa39.3■■■■□ 3.88
OPN3-205ENST00000478849 TIAM1Q13009 1591 aa39.29■■■■□ 3.88
OPN3-205ENST00000478849 PPP6R1Q9UPN7 881 aa39.28■■■■□ 3.88
OPN3-205ENST00000478849 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP39.28■■■■□ 3.88
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OPN3-205ENST00000478849 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP39.17■■■■□ 3.86
OPN3-205ENST00000478849 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa39.16■■■■□ 3.86
OPN3-205ENST00000478849 SOCS7O14512 581 aa39.13■■■■□ 3.85
OPN3-205ENST00000478849 UBAP1LF5GYI3 381 aa39.12■■■■□ 3.85
OPN3-205ENST00000478849 A2ML1A8K2U0 1454 aa39.11■■■■□ 3.85
OPN3-205ENST00000478849 KIF3BO15066 747 aa39.1■■■■□ 3.85
OPN3-205ENST00000478849 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP39.07■■■■□ 3.85
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