RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473257.1

ACTB-209, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 3

Gene ACTB, Length 556 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-209ENST00000473257 PLCH2O75038 1416 aa18.57■□□□□ 0.56
ACTB-209ENST00000473257 KIF14Q15058 1648 aa18.57■□□□□ 0.56
ACTB-209ENST00000473257 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP18.57■□□□□ 0.56
ACTB-209ENST00000473257 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa18.57■□□□□ 0.56
ACTB-209ENST00000473257 POGZQ7Z3K3 1410 aa18.56■□□□□ 0.56
ACTB-209ENST00000473257 FMN1Q68DA7 1419 aa18.54■□□□□ 0.56
ACTB-209ENST00000473257 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa18.52■□□□□ 0.56
ACTB-209ENST00000473257 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa18.51■□□□□ 0.55
ACTB-209ENST00000473257 MYO5CQ9NQX4 1742 aa18.5■□□□□ 0.55
ACTB-209ENST00000473257 AFAP1Q8N556 730 aa18.49■□□□□ 0.55
ACTB-209ENST00000473257 FBXO41Q8TF61 875 aa18.49■□□□□ 0.55
ACTB-209ENST00000473257 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
ACTB-209ENST00000473257 MAGI2Q86UL8 1455 aa18.48■□□□□ 0.55
ACTB-209ENST00000473257 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
ACTB-209ENST00000473257 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
ACTB-209ENST00000473257 ARHGAP5Q13017 1502 aa18.47■□□□□ 0.55
ACTB-209ENST00000473257 ATP10AO60312 1499 aa18.46■□□□□ 0.55
ACTB-209ENST00000473257 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa18.46■□□□□ 0.55
ACTB-209ENST00000473257 C9orf84Q5VXU9 1444 aa18.44■□□□□ 0.54
ACTB-209ENST00000473257 MYT1LQ9UL68 1186 aa18.44■□□□□ 0.54
ACTB-209ENST00000473257 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa18.42■□□□□ 0.54
ACTB-209ENST00000473257 CLIP1P30622 1438 aa18.41■□□□□ 0.54
ACTB-209ENST00000473257 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa18.4■□□□□ 0.54
ACTB-209ENST00000473257 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa18.4■□□□□ 0.54
ACTB-209ENST00000473257 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa18.39■□□□□ 0.54
ACTB-209ENST00000473257 KDM5CP41229 1560 aa18.38■□□□□ 0.53
ACTB-209ENST00000473257 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa18.38■□□□□ 0.53
ACTB-209ENST00000473257 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa18.38■□□□□ 0.53
ACTB-209ENST00000473257 ABCA6Q8N139 1617 aa18.36■□□□□ 0.53
ACTB-209ENST00000473257 PREX2Q70Z35 1606 aa18.34■□□□□ 0.53
ACTB-209ENST00000473257 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
ACTB-209ENST00000473257 ABCC1P33527 1531 aa18.33■□□□□ 0.53
ACTB-209ENST00000473257 CCDC18Q5T9S5 1454 aa18.32■□□□□ 0.52
ACTB-209ENST00000473257 ITSN2Q9NZM3 1697 aa18.31■□□□□ 0.52
ACTB-209ENST00000473257 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa18.3■□□□□ 0.52
ACTB-209ENST00000473257 CERKQ8TCT0 537 aa18.3■□□□□ 0.52
ACTB-209ENST00000473257 MLH3Q9UHC1 1453 aa18.3■□□□□ 0.52
ACTB-209ENST00000473257 PREX1Q8TCU6 1659 aa18.3■□□□□ 0.52
ACTB-209ENST00000473257 FYCO1Q9BQS8 1478 aa18.28■□□□□ 0.52
ACTB-209ENST00000473257 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP18.27■□□□□ 0.523e-29■□□□□ 9.6
ACTB-209ENST00000473257 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa18.27■□□□□ 0.51
ACTB-209ENST00000473257 STRCQ7RTU9 1775 aa18.26■□□□□ 0.51
ACTB-209ENST00000473257 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa18.25■□□□□ 0.51
ACTB-209ENST00000473257 C3P01024 1663 aa18.25■□□□□ 0.51
ACTB-209ENST00000473257 SYCP2Q9BX26 1530 aa18.25■□□□□ 0.51
ACTB-209ENST00000473257 REREQ9P2R6 1566 aa18.25■□□□□ 0.51
ACTB-209ENST00000473257 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa18.24■□□□□ 0.51
ACTB-209ENST00000473257 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
ACTB-209ENST00000473257 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
ACTB-209ENST00000473257 AGLP35573 1532 aa18.22■□□□□ 0.51
ACTB-209ENST00000473257 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
ACTB-209ENST00000473257 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
ACTB-209ENST00000473257 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
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ACTB-209ENST00000473257 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
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ACTB-209ENST00000473257 MTUS2Q5JR59 1369 aa18.16■□□□□ 0.5
ACTB-209ENST00000473257 ATP7AQ04656 1500 aa18.14■□□□□ 0.49
ACTB-209ENST00000473257 DMRT2Q9Y5R5 561 aa18.13■□□□□ 0.49
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ACTB-209ENST00000473257 ZMYM3Q14202 1370 aa18.12■□□□□ 0.49
ACTB-209ENST00000473257 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
ACTB-209ENST00000473257 CNTLNQ9NXG0 1405 aa18.11■□□□□ 0.49
ACTB-209ENST00000473257 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
ACTB-209ENST00000473257 TIAM1Q13009 1591 aa18.1■□□□□ 0.49
ACTB-209ENST00000473257 A2MP01023 1474 aa18.1■□□□□ 0.49
ACTB-209ENST00000473257 NCOA1Q15788 1441 aa18.1■□□□□ 0.49
ACTB-209ENST00000473257 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa18.1■□□□□ 0.49
ACTB-209ENST00000473257 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa18.1■□□□□ 0.49
ACTB-209ENST00000473257 PLXNC1O60486 1568 aa18.08■□□□□ 0.49
ACTB-209ENST00000473257 PTPRTO14522 1441 aa18.08■□□□□ 0.49
ACTB-209ENST00000473257 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa18.08■□□□□ 0.48
ACTB-209ENST00000473257 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa18.07■□□□□ 0.48
ACTB-209ENST00000473257 CEP162Q5TB80 1403 aa18.06■□□□□ 0.48
ACTB-209ENST00000473257 MROH2AA6NES4 1674 aa18.06■□□□□ 0.48
ACTB-209ENST00000473257 LTBP4Q8N2S1 1624 aa18.05■□□□□ 0.48
ACTB-209ENST00000473257 MBD5Q9P267 1494 aa18.05■□□□□ 0.48
ACTB-209ENST00000473257 NPATQ14207 1427 aa18.05■□□□□ 0.48
ACTB-209ENST00000473257 PTPRKQ15262 1439 aa18.04■□□□□ 0.48
ACTB-209ENST00000473257 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa18.03■□□□□ 0.48
ACTB-209ENST00000473257 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.48
ACTB-209ENST00000473257 MYO3AQ8NEV4 1616 aa18.01■□□□□ 0.47
ACTB-209ENST00000473257 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa17.99■□□□□ 0.47
ACTB-209ENST00000473257 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP17.99■□□□□ 0.47
ACTB-209ENST00000473257 ILDR2Q71H61 639 aa17.99■□□□□ 0.47
ACTB-209ENST00000473257 DISP3Q9P2K9 1392 aa17.99■□□□□ 0.47
ACTB-209ENST00000473257 NCOA2Q15596 1464 aa17.99■□□□□ 0.47
ACTB-209ENST00000473257 ADGBQ8N7X0 1667 aa17.99■□□□□ 0.47
ACTB-209ENST00000473257 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP17.97■□□□□ 0.47
ACTB-209ENST00000473257 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa17.97■□□□□ 0.47
ACTB-209ENST00000473257 KIF3BO15066 747 aa17.97■□□□□ 0.47
ACTB-209ENST00000473257 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP17.96■□□□□ 0.47
ACTB-209ENST00000473257 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP17.95■□□□□ 0.46
ACTB-209ENST00000473257 CCDC141Q6ZP82 1450 aa17.94■□□□□ 0.46
ACTB-209ENST00000473257 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa17.93■□□□□ 0.46
ACTB-209ENST00000473257 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP17.92■□□□□ 0.46
ACTB-209ENST00000473257 PLA2R1Q13018 1463 aa17.9■□□□□ 0.46
ACTB-209ENST00000473257 UBAP1LF5GYI3 381 aa17.9■□□□□ 0.46
ACTB-209ENST00000473257 PKD2Q13563 968 aa17.9■□□□□ 0.46
ACTB-209ENST00000473257 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP17.9■□□□□ 0.46
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