RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470201.5

RABGGTB-207, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 848 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-207ENST00000470201 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa9.68□□□□□ -0.86
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RABGGTB-207ENST00000470201 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
RABGGTB-207ENST00000470201 IER5LQ5T953 404 aa9.67□□□□□ -0.86
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RABGGTB-207ENST00000470201 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
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RABGGTB-207ENST00000470201 SMYD5Q6GMV2 418 aa9.6□□□□□ -0.87
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RABGGTB-207ENST00000470201 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa9.53□□□□□ -0.88
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RABGGTB-207ENST00000470201 SLAIN1Q8ND83 568 aa9.45□□□□□ -0.9
RABGGTB-207ENST00000470201 TMC2Q8TDI7 906 aa9.45□□□□□ -0.9
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RABGGTB-207ENST00000470201 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
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RABGGTB-207ENST00000470201 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
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RABGGTB-207ENST00000470201 GPR37O15354 613 aa9.3□□□□□ -0.92
RABGGTB-207ENST00000470201 ST18O60284 1047 aa9.29□□□□□ -0.92
RABGGTB-207ENST00000470201 PLSCR2Q9NRY7 297 aa9.29□□□□□ -0.92
RABGGTB-207ENST00000470201 TRIM66O15016 1216 aa9.28□□□□□ -0.92
RABGGTB-207ENST00000470201 SNPHO15079 494 aa9.28□□□□□ -0.92
RABGGTB-207ENST00000470201 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
RABGGTB-207ENST00000470201 PCDH10Q9P2E7 1040 aa9.28□□□□□ -0.92
RABGGTB-207ENST00000470201 GRXCR2A6NFK2 248 aa9.27□□□□□ -0.93
RABGGTB-207ENST00000470201 OXER1Q8TDS5 423 aa9.27□□□□□ -0.93
RABGGTB-207ENST00000470201 PDE4DQ08499 809 aa9.26□□□□□ -0.93
RABGGTB-207ENST00000470201 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP9.26□□□□□ -0.93
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RABGGTB-207ENST00000470201 MAP2K5Q13163 448 aa9.24□□□□□ -0.93
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RABGGTB-207ENST00000470201 CCDC102AQ96A19 550 aa9.2□□□□□ -0.94
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RABGGTB-207ENST00000470201 MARVELD3Q96A59 401 aa9.17□□□□□ -0.94
RABGGTB-207ENST00000470201 ARXQ96QS3 562 aa9.16□□□□□ -0.94
RABGGTB-207ENST00000470201 SLC34A2O95436 690 aa9.14□□□□□ -0.95
RABGGTB-207ENST00000470201 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
RABGGTB-207ENST00000470201 PTGDRQ13258 359 aa9.13□□□□□ -0.95
RABGGTB-207ENST00000470201 DDRGK1Q96HY6 314 aa9.13□□□□□ -0.95
RABGGTB-207ENST00000470201 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
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