RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460589.5

RPL3-208, Transcript of ribosomal protein L3, human

TSL 2

Gene RPL3, Length 630 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPL3-208	ENST00000460589	FMN1	Q68DA7	1419 aa		28.43	■■■□□ 2.14
RPL3-208	ENST00000460589	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		28.43	■■■□□ 2.14
RPL3-208	ENST00000460589	HSPA2	P54652	639 aa		28.41	■■■□□ 2.14
RPL3-208	ENST00000460589	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		28.4	■■■□□ 2.14
RPL3-208	ENST00000460589	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		28.39	■■■□□ 2.13
RPL3-208	ENST00000460589	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		28.38	■■■□□ 2.13
RPL3-208	ENST00000460589	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		28.38	■■■□□ 2.13
RPL3-208	ENST00000460589	MLEC	Q14165	292 aa		28.37	■■■□□ 2.13
RPL3-208	ENST00000460589	ATP10A	O60312	1499 aa		28.36	■■■□□ 2.13
RPL3-208	ENST00000460589	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		28.36	■■■□□ 2.13
RPL3-208	ENST00000460589	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	28.36	■■■□□ 2.13
RPL3-208	ENST00000460589	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		28.35	■■■□□ 2.13
RPL3-208	ENST00000460589	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	28.34	■■■□□ 2.13
RPL3-208	ENST00000460589	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	28.34	■■■□□ 2.13
RPL3-208	ENST00000460589	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		28.32	■■■□□ 2.12
RPL3-208	ENST00000460589	KDM5C	P41229	1560 aa		28.32	■■■□□ 2.12
RPL3-208	ENST00000460589	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		28.29	■■■□□ 2.12
RPL3-208	ENST00000460589	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		28.28	■■■□□ 2.12
RPL3-208	ENST00000460589	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		28.26	■■■□□ 2.11
RPL3-208	ENST00000460589	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	28.26	■■■□□ 2.11
RPL3-208	ENST00000460589	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		28.24	■■■□□ 2.11
RPL3-208	ENST00000460589	AFAP1	Q8N556	730 aa		28.24	■■■□□ 2.11
RPL3-208	ENST00000460589	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		28.22	■■■□□ 2.11
RPL3-208	ENST00000460589	CLIP1	P30622	1438 aa		28.21	■■■□□ 2.11
RPL3-208	ENST00000460589	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		28.21	■■■□□ 2.11
RPL3-208	ENST00000460589	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	28.2	■■■□□ 2.1
RPL3-208	ENST00000460589	ABCA6	Q8N139	1617 aa		28.2	■■■□□ 2.1
RPL3-208	ENST00000460589	RERE	Q9P2R6	1566 aa		28.19	■■■□□ 2.1
RPL3-208	ENST00000460589	PREX2	Q70Z35	1606 aa		28.18	■■■□□ 2.1
RPL3-208	ENST00000460589	ABCC1	P33527	1531 aa		28.17	■■■□□ 2.1
RPL3-208	ENST00000460589	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		28.15	■■■□□ 2.1
RPL3-208	ENST00000460589	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		28.15	■■■□□ 2.1
RPL3-208	ENST00000460589	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		28.15	■■■□□ 2.1
RPL3-208	ENST00000460589	CERK	Q8TCT0	537 aa		28.12	■■■□□ 2.09
RPL3-208	ENST00000460589	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		28.11	■■■□□ 2.09
RPL3-208	ENST00000460589	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		28.11	■■■□□ 2.09
RPL3-208	ENST00000460589	STRC	Q7RTU9	1775 aa		28.11	■■■□□ 2.09
RPL3-208	ENST00000460589	AGL	P35573	1532 aa		28.08	■■■□□ 2.09
RPL3-208	ENST00000460589	C3	P01024	1663 aa		28.07	■■■□□ 2.08
RPL3-208	ENST00000460589	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		28.06	■■■□□ 2.08
RPL3-208	ENST00000460589	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		28.06	■■■□□ 2.08
RPL3-208	ENST00000460589	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		28.05	■■■□□ 2.08
RPL3-208	ENST00000460589	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		28.03	■■■□□ 2.08
RPL3-208	ENST00000460589	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		28.02	■■■□□ 2.08
RPL3-208	ENST00000460589	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		27.99	■■■□□ 2.07
RPL3-208	ENST00000460589	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		27.94	■■■□□ 2.06
RPL3-208	ENST00000460589	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	27.94	■■■□□ 2.06
RPL3-208	ENST00000460589	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	27.91	■■■□□ 2.06
RPL3-208	ENST00000460589	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		27.9	■■■□□ 2.06
RPL3-208	ENST00000460589	PTPRT	O14522	1441 aa		27.9	■■■□□ 2.06
RPL3-208	ENST00000460589	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		27.89	■■■□□ 2.06
RPL3-208	ENST00000460589	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	27.86	■■■□□ 2.05
RPL3-208	ENST00000460589	PLXNC1	O60486	1568 aa		27.86	■■■□□ 2.05
RPL3-208	ENST00000460589	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	27.86	■■■□□ 2.05
RPL3-208	ENST00000460589	NCOA1	Q15788	1441 aa		27.85	■■■□□ 2.05
RPL3-208	ENST00000460589	MROH2A	A6NES4	1674 aa		27.85	■■■□□ 2.05
RPL3-208	ENST00000460589	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	27.84	■■■□□ 2.05
RPL3-208	ENST00000460589	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	27.84	■■■□□ 2.05
RPL3-208	ENST00000460589	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		27.84	■■■□□ 2.05
RPL3-208	ENST00000460589	ATP7A	Q04656	1500 aa		27.83	■■■□□ 2.05
RPL3-208	ENST00000460589	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	27.82	■■■□□ 2.04
RPL3-208	ENST00000460589	NPAT	Q14207	1427 aa		27.82	■■■□□ 2.04
RPL3-208	ENST00000460589	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		27.82	■■■□□ 2.04
RPL3-208	ENST00000460589	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	27.81	■■■□□ 2.04
RPL3-208	ENST00000460589	ZMYM3	Q14202	1370 aa		27.78	■■■□□ 2.04
RPL3-208	ENST00000460589	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		27.78	■■■□□ 2.04
RPL3-208	ENST00000460589	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	27.76	■■■□□ 2.03
RPL3-208	ENST00000460589	A2M	P01023	1474 aa		27.76	■■■□□ 2.03
RPL3-208	ENST00000460589	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		27.76	■■■□□ 2.03
RPL3-208	ENST00000460589	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		27.74	■■■□□ 2.03
RPL3-208	ENST00000460589	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	27.74	■■■□□ 2.03
RPL3-208	ENST00000460589	TIAM1	Q13009	1591 aa		27.73	■■■□□ 2.03
RPL3-208	ENST00000460589	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		27.72	■■■□□ 2.03
RPL3-208	ENST00000460589	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	27.71	■■■□□ 2.03
RPL3-208	ENST00000460589	PTPRK	Q15262	1439 aa		27.7	■■■□□ 2.03
RPL3-208	ENST00000460589	MBD5	Q9P267	1494 aa		27.7	■■■□□ 2.02
RPL3-208	ENST00000460589	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	27.69	■■■□□ 2.02
RPL3-208	ENST00000460589	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		27.69	■■■□□ 2.02
RPL3-208	ENST00000460589	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		27.68	■■■□□ 2.02
RPL3-208	ENST00000460589	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		27.66	■■■□□ 2.02
RPL3-208	ENST00000460589	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		27.65	■■■□□ 2.02
RPL3-208	ENST00000460589	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	27.65	■■■□□ 2.02
RPL3-208	ENST00000460589	ILDR2	Q71H61	639 aa		27.65	■■■□□ 2.02
RPL3-208	ENST00000460589	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		27.65	■■■□□ 2.02
RPL3-208	ENST00000460589	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		27.64	■■■□□ 2.02
RPL3-208	ENST00000460589	PLA2R1	Q13018	1463 aa		27.64	■■■□□ 2.01
RPL3-208	ENST00000460589	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	27.63	■■■□□ 2.01
RPL3-208	ENST00000460589	GGT6	Q6P531	493 aa		27.62	■■■□□ 2.01
RPL3-208	ENST00000460589	CEP162	Q5TB80	1403 aa		27.6	■■■□□ 2.01
RPL3-208	ENST00000460589	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	27.6	■■■□□ 2.01
RPL3-208	ENST00000460589	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		27.58	■■■□□ 2
RPL3-208	ENST00000460589	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		27.56	■■■□□ 2
RPL3-208	ENST00000460589	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		27.54	■■■□□ 2
RPL3-208	ENST00000460589	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	27.53	■■■□□ 2
RPL3-208	ENST00000460589	PKD2	Q13563	968 aa		27.53	■■■□□ 2
RPL3-208	ENST00000460589	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	27.52	■■■□□ 2
RPL3-208	ENST00000460589	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		27.51	■■■□□ 2
RPL3-208	ENST00000460589	NCOA2	Q15596	1464 aa		27.5	■■□□□ 1.99
RPL3-208	ENST00000460589	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		27.49	■■□□□ 1.99
RPL3-208	ENST00000460589	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		27.49	■■□□□ 1.99

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