RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000454619.5

NME4-208, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 4, humanhuman

TSL 5

Gene NME4, Length 719 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4-208ENST00000454619 SCAPERQ9BY12 1400 aa23.79■■□□□ 1.4
NME4-208ENST00000454619 FMN1Q68DA7 1419 aa23.77■■□□□ 1.4
NME4-208ENST00000454619 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa23.77■■□□□ 1.4
NME4-208ENST00000454619 PLPPR3Q6T4P5 718 aa23.76■■□□□ 1.39
NME4-208ENST00000454619 MYO5CQ9NQX4 1742 aa23.75■■□□□ 1.39
NME4-208ENST00000454619 HSPA2P54652 639 aa23.74■■□□□ 1.39
NME4-208ENST00000454619 MLECQ14165 292 aa23.73■■□□□ 1.39
NME4-208ENST00000454619 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa23.72■■□□□ 1.39
NME4-208ENST00000454619 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
NME4-208ENST00000454619 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
NME4-208ENST00000454619 C9orf84Q5VXU9 1444 aa23.72■■□□□ 1.39
NME4-208ENST00000454619 ATP10AO60312 1499 aa23.72■■□□□ 1.39
NME4-208ENST00000454619 UBTFP17480 764 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
NME4-208ENST00000454619 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa23.7■■□□□ 1.38
NME4-208ENST00000454619 KIF14Q15058 1648 aa23.7■■□□□ 1.38
NME4-208ENST00000454619 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa23.68■■□□□ 1.38
NME4-208ENST00000454619 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa23.67■■□□□ 1.38
NME4-208ENST00000454619 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
NME4-208ENST00000454619 EHMT2Q96KQ7 1210 aa23.64■■□□□ 1.37
NME4-208ENST00000454619 CLIP1P30622 1438 aa23.64■■□□□ 1.37
NME4-208ENST00000454619 ARHGAP5Q13017 1502 aa23.64■■□□□ 1.37
NME4-208ENST00000454619 PREX1Q8TCU6 1659 aa23.64■■□□□ 1.37
NME4-208ENST00000454619 KDM5CP41229 1560 aa23.62■■□□□ 1.37
NME4-208ENST00000454619 FOXD1Q16676 465 aa23.61■■□□□ 1.37
NME4-208ENST00000454619 CERKQ8TCT0 537 aa23.59■■□□□ 1.37
NME4-208ENST00000454619 AFAP1Q8N556 730 aa23.56■■□□□ 1.36
NME4-208ENST00000454619 REREQ9P2R6 1566 aa23.56■■□□□ 1.36
NME4-208ENST00000454619 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa23.56■■□□□ 1.36
NME4-208ENST00000454619 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa23.56■■□□□ 1.36
NME4-208ENST00000454619 MYT1LQ9UL68 1186 aa23.55■■□□□ 1.36
NME4-208ENST00000454619 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
NME4-208ENST00000454619 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa23.53■■□□□ 1.36
NME4-208ENST00000454619 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa23.52■■□□□ 1.36
NME4-208ENST00000454619 MLH3Q9UHC1 1453 aa23.51■■□□□ 1.35
NME4-208ENST00000454619 PREX2Q70Z35 1606 aa23.51■■□□□ 1.35
NME4-208ENST00000454619 CCDC18Q5T9S5 1454 aa23.5■■□□□ 1.35
NME4-208ENST00000454619 DMRT2Q9Y5R5 561 aa23.5■■□□□ 1.35
NME4-208ENST00000454619 ABCA6Q8N139 1617 aa23.5■■□□□ 1.35
NME4-208ENST00000454619 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
NME4-208ENST00000454619 ABCC1P33527 1531 aa23.49■■□□□ 1.35
NME4-208ENST00000454619 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa23.47■■□□□ 1.35
NME4-208ENST00000454619 AGLP35573 1532 aa23.47■■□□□ 1.35
NME4-208ENST00000454619 ITSN2Q9NZM3 1697 aa23.47■■□□□ 1.35
NME4-208ENST00000454619 STRCQ7RTU9 1775 aa23.47■■□□□ 1.35
NME4-208ENST00000454619 C3P01024 1663 aa23.44■■□□□ 1.34
NME4-208ENST00000454619 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa23.44■■□□□ 1.34
NME4-208ENST00000454619 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
NME4-208ENST00000454619 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa23.4■■□□□ 1.34
NME4-208ENST00000454619 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa23.4■■□□□ 1.34
NME4-208ENST00000454619 CNTLNQ9NXG0 1405 aa23.39■■□□□ 1.33
NME4-208ENST00000454619 PTPRTO14522 1441 aa23.38■■□□□ 1.33
NME4-208ENST00000454619 FYCO1Q9BQS8 1478 aa23.37■■□□□ 1.33
NME4-208ENST00000454619 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa23.34■■□□□ 1.33
NME4-208ENST00000454619 MROH2AA6NES4 1674 aa23.31■■□□□ 1.32
NME4-208ENST00000454619 SYCP2Q9BX26 1530 aa23.3■■□□□ 1.32
NME4-208ENST00000454619 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
NME4-208ENST00000454619 NPATQ14207 1427 aa23.28■■□□□ 1.32
NME4-208ENST00000454619 NCOA1Q15788 1441 aa23.28■■□□□ 1.32
NME4-208ENST00000454619 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
NME4-208ENST00000454619 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
NME4-208ENST00000454619 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa23.25■■□□□ 1.31
NME4-208ENST00000454619 ATP7AQ04656 1500 aa23.24■■□□□ 1.31
NME4-208ENST00000454619 LTBP4Q8N2S1 1624 aa23.24■■□□□ 1.31
NME4-208ENST00000454619 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
NME4-208ENST00000454619 DISP3Q9P2K9 1392 aa23.24■■□□□ 1.31
NME4-208ENST00000454619 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa23.24■■□□□ 1.31
NME4-208ENST00000454619 IQSEC2Q5JU85 1478 aa23.24■■□□□ 1.31
NME4-208ENST00000454619 ZMYM3Q14202 1370 aa23.23■■□□□ 1.31
NME4-208ENST00000454619 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP23.22■■□□□ 1.31
NME4-208ENST00000454619 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
NME4-208ENST00000454619 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa23.22■■□□□ 1.31
NME4-208ENST00000454619 PLXNC1O60486 1568 aa23.21■■□□□ 1.31
NME4-208ENST00000454619 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
NME4-208ENST00000454619 A2MP01023 1474 aa23.19■■□□□ 1.3
NME4-208ENST00000454619 CCNB3Q8WWL7 1395 aa23.19■■□□□ 1.3
NME4-208ENST00000454619 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
NME4-208ENST00000454619 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
NME4-208ENST00000454619 MTUS2Q5JR59 1369 aa23.15■■□□□ 1.3
NME4-208ENST00000454619 MYO3AQ8NEV4 1616 aa23.15■■□□□ 1.3
NME4-208ENST00000454619 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa23.14■■□□□ 1.29
NME4-208ENST00000454619 ADGBQ8N7X0 1667 aa23.13■■□□□ 1.29
NME4-208ENST00000454619 PLA2R1Q13018 1463 aa23.13■■□□□ 1.29
NME4-208ENST00000454619 PTPRKQ15262 1439 aa23.12■■□□□ 1.29
NME4-208ENST00000454619 ILDR2Q71H61 639 aa23.12■■□□□ 1.29
NME4-208ENST00000454619 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
NME4-208ENST00000454619 PKD2Q13563 968 aa23.11■■□□□ 1.29
NME4-208ENST00000454619 GGT6Q6P531 493 aa23.11■■□□□ 1.29
NME4-208ENST00000454619 PPP6R1Q9UPN7 881 aa23.11■■□□□ 1.29
NME4-208ENST00000454619 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa23.1■■□□□ 1.29
NME4-208ENST00000454619 TIAM1Q13009 1591 aa23.09■■□□□ 1.29
NME4-208ENST00000454619 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa23.08■■□□□ 1.28
NME4-208ENST00000454619 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
NME4-208ENST00000454619 SOCS7O14512 581 aa23.07■■□□□ 1.28
NME4-208ENST00000454619 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
NME4-208ENST00000454619 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa23.05■■□□□ 1.28
NME4-208ENST00000454619 MBD5Q9P267 1494 aa23.05■■□□□ 1.28
NME4-208ENST00000454619 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
NME4-208ENST00000454619 A2ML1A8K2U0 1454 aa23.02■■□□□ 1.28
NME4-208ENST00000454619 CEP162Q5TB80 1403 aa23.01■■□□□ 1.27
NME4-208ENST00000454619 UBAP1LF5GYI3 381 aa23■■□□□ 1.27
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