RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000450873.6

RABGEF1-205, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 2,281 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-205ENST00000450873 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa16.63■□□□□ 0.25
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RABGEF1-205ENST00000450873 MAP3K1Q13233 1512 aa16.63■□□□□ 0.25
RABGEF1-205ENST00000450873 MTUS2Q5JR59 1369 aa16.62■□□□□ 0.25
RABGEF1-205ENST00000450873 PLCH2O75038 1416 aa16.62■□□□□ 0.25
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RABGEF1-205ENST00000450873 KIF14Q15058 1648 aa16.6■□□□□ 0.25
RABGEF1-205ENST00000450873 MAGI2Q86UL8 1455 aa16.6■□□□□ 0.25
RABGEF1-205ENST00000450873 MADDQ8WXG6 1647 aa16.6■□□□□ 0.25
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RABGEF1-205ENST00000450873 MYO5CQ9NQX4 1742 aa16.58■□□□□ 0.25
RABGEF1-205ENST00000450873 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa16.57■□□□□ 0.24
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RABGEF1-205ENST00000450873 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa16.56■□□□□ 0.24
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RABGEF1-205ENST00000450873 YEATS2Q9ULM3 1422 aa16.54■□□□□ 0.24
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RABGEF1-205ENST00000450873 ATP10AO60312 1499 aa16.49■□□□□ 0.23
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RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa16.48■□□□□ 0.23
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RABGEF1-205ENST00000450873 C9orf84Q5VXU9 1444 aa16.47■□□□□ 0.23
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RABGEF1-205ENST00000450873 PREX2Q70Z35 1606 aa16.45■□□□□ 0.22
RABGEF1-205ENST00000450873 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
RABGEF1-205ENST00000450873 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa16.44■□□□□ 0.22
RABGEF1-205ENST00000450873 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa16.44■□□□□ 0.22
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RABGEF1-205ENST00000450873 ITSN2Q9NZM3 1697 aa16.41■□□□□ 0.22
RABGEF1-205ENST00000450873 REREQ9P2R6 1566 aa16.41■□□□□ 0.22
RABGEF1-205ENST00000450873 ABCC1P33527 1531 aa16.4■□□□□ 0.22
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RABGEF1-205ENST00000450873 MLH3Q9UHC1 1453 aa16.4■□□□□ 0.22
RABGEF1-205ENST00000450873 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa16.4■□□□□ 0.22
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP16.39■□□□□ 0.21
RABGEF1-205ENST00000450873 MYOM3Q5VTT5 1437 aa16.38■□□□□ 0.21
RABGEF1-205ENST00000450873 ABCA6Q8N139 1617 aa16.37■□□□□ 0.21
RABGEF1-205ENST00000450873 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa16.36■□□□□ 0.21
RABGEF1-205ENST00000450873 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa16.36■□□□□ 0.21
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RABGEF1-205ENST00000450873 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa16.35■□□□□ 0.21
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RABGEF1-205ENST00000450873 HSPA2P54652 639 aa16.33■□□□□ 0.2
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP16.33■□□□□ 0.2
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RABGEF1-205ENST00000450873 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa16.3■□□□□ 0.2
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RABGEF1-205ENST00000450873 SYCP2Q9BX26 1530 aa16.29■□□□□ 0.2
RABGEF1-205ENST00000450873 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP16.28■□□□□ 0.2
RABGEF1-205ENST00000450873 MBD5Q9P267 1494 aa16.27■□□□□ 0.19
RABGEF1-205ENST00000450873 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.19
RABGEF1-205ENST00000450873 C3P01024 1663 aa16.26■□□□□ 0.19
RABGEF1-205ENST00000450873 PTPN23Q9H3S7 1636 aa16.26■□□□□ 0.19
RABGEF1-205ENST00000450873 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
RABGEF1-205ENST00000450873 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa16.25■□□□□ 0.19
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RABGEF1-205ENST00000450873 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
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RABGEF1-205ENST00000450873 CCDC141Q6ZP82 1450 aa16.23■□□□□ 0.19
RABGEF1-205ENST00000450873 ARHGEF5Q12774 1597 aa16.23■□□□□ 0.19
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RABGEF1-205ENST00000450873 TSPY10P0CW01 314 aa16.21■□□□□ 0.19
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RABGEF1-205ENST00000450873 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa16.19■□□□□ 0.18
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RABGEF1-205ENST00000450873 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
RABGEF1-205ENST00000450873 A2MP01023 1474 aa16.18■□□□□ 0.18
RABGEF1-205ENST00000450873 CERKQ8TCT0 537 aa16.17■□□□□ 0.18
RABGEF1-205ENST00000450873 ABCC5O15440 1437 aa16.17■□□□□ 0.18
RABGEF1-205ENST00000450873 NPATQ14207 1427 aa16.16■□□□□ 0.18
RABGEF1-205ENST00000450873 ADGBQ8N7X0 1667 aa16.16■□□□□ 0.18
RABGEF1-205ENST00000450873 DAPK1P53355 1430 aa16.16■□□□□ 0.18
RABGEF1-205ENST00000450873 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
RABGEF1-205ENST00000450873 MAST1Q9Y2H9 1570 aa16.14■□□□□ 0.17
RABGEF1-205ENST00000450873 SHANK2Q9UPX8 1470 aa16.14■□□□□ 0.17
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