RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442161.1

AC004893.1-201, humanhuman

BASIC

Gene AC004893.1, Length 1,393 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC004893.1-201ENST00000442161 ADGRL2O95490 1459 aa14.91□□□□□ -0.02
AC004893.1-201ENST00000442161 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
AC004893.1-201ENST00000442161 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
AC004893.1-201ENST00000442161 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
AC004893.1-201ENST00000442161 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
AC004893.1-201ENST00000442161 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
AC004893.1-201ENST00000442161 NUP160Q12769 1436 aa14.88□□□□□ -0.03
AC004893.1-201ENST00000442161 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
AC004893.1-201ENST00000442161 CROCC2H7BZ55 1655 aa14.87□□□□□ -0.03
AC004893.1-201ENST00000442161 ABCC5O15440 1437 aa14.87□□□□□ -0.03
AC004893.1-201ENST00000442161 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa14.87□□□□□ -0.03
AC004893.1-201ENST00000442161 SHANK2Q9UPX8 1470 aa14.84□□□□□ -0.03
AC004893.1-201ENST00000442161 KDM6BO15054 1643 aa14.84□□□□□ -0.03
AC004893.1-201ENST00000442161 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa14.84□□□□□ -0.03
AC004893.1-201ENST00000442161 MPHOSPH9Q99550 1183 aa14.84□□□□□ -0.03
AC004893.1-201ENST00000442161 DNAJC5BQ9UF47 199 aa14.84□□□□□ -0.03
AC004893.1-201ENST00000442161 CEP170Q5SW79 1584 aa14.83□□□□□ -0.03
AC004893.1-201ENST00000442161 TEX14Q8IWB6 1497 aa14.81□□□□□ -0.04
AC004893.1-201ENST00000442161 ABCA8O94911 1581 aa14.8□□□□□ -0.04
AC004893.1-201ENST00000442161 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
AC004893.1-201ENST00000442161 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa14.8□□□□□ -0.04
AC004893.1-201ENST00000442161 NCOA1Q15788 1441 aa14.79□□□□□ -0.04
AC004893.1-201ENST00000442161 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP14.79□□□□□ -0.04
AC004893.1-201ENST00000442161 KDM5DQ9BY66 1539 aa14.78□□□□□ -0.04
AC004893.1-201ENST00000442161 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa14.78□□□□□ -0.04
AC004893.1-201ENST00000442161 CNTLNQ9NXG0 1405 aa14.78□□□□□ -0.04
AC004893.1-201ENST00000442161 KIF14Q15058 1648 aa14.77□□□□□ -0.05
AC004893.1-201ENST00000442161 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
AC004893.1-201ENST00000442161 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
AC004893.1-201ENST00000442161 ARHGEF5Q12774 1597 aa14.76□□□□□ -0.05
AC004893.1-201ENST00000442161 ERCC6Q03468 1493 aa14.76□□□□□ -0.05
AC004893.1-201ENST00000442161 DMRT2Q9Y5R5 561 aa14.75□□□□□ -0.05
AC004893.1-201ENST00000442161 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa14.75□□□□□ -0.05
AC004893.1-201ENST00000442161 PZPP20742 1482 aa14.75□□□□□ -0.05
AC004893.1-201ENST00000442161 MBD5Q9P267 1494 aa14.75□□□□□ -0.05
AC004893.1-201ENST00000442161 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa14.75□□□□□ -0.05
AC004893.1-201ENST00000442161 ERICH6BQ5W0A0 696 aa14.74□□□□□ -0.05
AC004893.1-201ENST00000442161 TRIM52Q96A61 297 aa14.74□□□□□ -0.05
AC004893.1-201ENST00000442161 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa14.74□□□□□ -0.05
AC004893.1-201ENST00000442161 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa14.74□□□□□ -0.05
AC004893.1-201ENST00000442161 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa14.73□□□□□ -0.05
AC004893.1-201ENST00000442161 ABCC10Q5T3U5 1492 aa14.73□□□□□ -0.05
AC004893.1-201ENST00000442161 NEFLP07196 543 aa14.72□□□□□ -0.05
AC004893.1-201ENST00000442161 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
AC004893.1-201ENST00000442161 WASHC2AQ641Q2 1341 aa14.71□□□□□ -0.05
AC004893.1-201ENST00000442161 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
AC004893.1-201ENST00000442161 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.06
AC004893.1-201ENST00000442161 L3MBTL2Q969R5 705 aa14.71□□□□□ -0.06
AC004893.1-201ENST00000442161 KCNH8Q96L42 1107 aa14.71□□□□□ -0.06
AC004893.1-201ENST00000442161 CHIC2Q9UKJ5 165 aa14.71□□□□□ -0.06
AC004893.1-201ENST00000442161 CCDC7Q96M83 1385 aa14.7□□□□□ -0.06
AC004893.1-201ENST00000442161 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa14.7□□□□□ -0.06
AC004893.1-201ENST00000442161 PLB1Q6P1J6 1458 aa14.7□□□□□ -0.06
AC004893.1-201ENST00000442161 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
AC004893.1-201ENST00000442161 JPH4Q96JJ6 628 aa14.69□□□□□ -0.06
AC004893.1-201ENST00000442161 RSPH4AQ5TD94 716 aa14.68□□□□□ -0.06
AC004893.1-201ENST00000442161 PTPRGP23470 1445 aa14.68□□□□□ -0.06
AC004893.1-201ENST00000442161 ATP10BO94823 1461 aa14.66□□□□□ -0.06
AC004893.1-201ENST00000442161 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
AC004893.1-201ENST00000442161 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa14.66□□□□□ -0.06
AC004893.1-201ENST00000442161 MAST1Q9Y2H9 1570 aa14.66□□□□□ -0.06
AC004893.1-201ENST00000442161 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
AC004893.1-201ENST00000442161 PLEKHD1A6NEE1 506 aa14.64□□□□□ -0.07
AC004893.1-201ENST00000442161 PREX2Q70Z35 1606 aa14.64□□□□□ -0.07
AC004893.1-201ENST00000442161 RALGAPBQ86X10 1494 aa14.64□□□□□ -0.07
AC004893.1-201ENST00000442161 SHROOM2Q13796 1616 aa14.63□□□□□ -0.07
AC004893.1-201ENST00000442161 C9orf84Q5VXU9 1444 aa14.63□□□□□ -0.07
AC004893.1-201ENST00000442161 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
AC004893.1-201ENST00000442161 KDM5CP41229 1560 aa14.62□□□□□ -0.07
AC004893.1-201ENST00000442161 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
AC004893.1-201ENST00000442161 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
AC004893.1-201ENST00000442161 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa14.6□□□□□ -0.07
AC004893.1-201ENST00000442161 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
AC004893.1-201ENST00000442161 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa14.6□□□□□ -0.07
AC004893.1-201ENST00000442161 CCDC141Q6ZP82 1450 aa14.59□□□□□ -0.07
AC004893.1-201ENST00000442161 FKBP8Q14318 412 aa14.59□□□□□ -0.07
AC004893.1-201ENST00000442161 NBPF8Q3BBV2 869 aa14.59□□□□□ -0.07
AC004893.1-201ENST00000442161 PLXNC1O60486 1568 aa14.58□□□□□ -0.08
AC004893.1-201ENST00000442161 LAMC1P11047 1609 aa14.57□□□□□ -0.08
AC004893.1-201ENST00000442161 UNC13BO14795 1591 aa14.57□□□□□ -0.08
AC004893.1-201ENST00000442161 KIF7Q2M1P5 1343 aa14.56□□□□□ -0.08
AC004893.1-201ENST00000442161 ZBED9Q6R2W3 1325 aa14.56□□□□□ -0.08
AC004893.1-201ENST00000442161 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa14.56□□□□□ -0.08
AC004893.1-201ENST00000442161 TSPY4P0CV99 314 aa14.55□□□□□ -0.08
AC004893.1-201ENST00000442161 TSPY10P0CW01 314 aa14.55□□□□□ -0.08
AC004893.1-201ENST00000442161 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa14.54□□□□□ -0.08
AC004893.1-201ENST00000442161 USP47Q96K76 1375 aa14.53□□□□□ -0.08
AC004893.1-201ENST00000442161 ATP10AO60312 1499 aa14.52□□□□□ -0.08
AC004893.1-201ENST00000442161 KIF15Q9NS87 1388 aa14.52□□□□□ -0.08
AC004893.1-201ENST00000442161 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP14.52□□□□□ -0.08
AC004893.1-201ENST00000442161 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
AC004893.1-201ENST00000442161 PKD2Q13563 968 aa14.52□□□□□ -0.08
AC004893.1-201ENST00000442161 BCORL1Q5H9F3 1711 aa14.51□□□□□ -0.09
AC004893.1-201ENST00000442161 IQGAP3Q86VI3 1631 aa14.51□□□□□ -0.09
AC004893.1-201ENST00000442161 NUP155O75694 1391 aa14.51□□□□□ -0.09
AC004893.1-201ENST00000442161 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
AC004893.1-201ENST00000442161 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
AC004893.1-201ENST00000442161 MYO5CQ9NQX4 1742 aa14.5□□□□□ -0.09
AC004893.1-201ENST00000442161 MAGI2Q86UL8 1455 aa14.5□□□□□ -0.09
AC004893.1-201ENST00000442161 E9PCH4 1651 aa14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.1 ms