RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436066.3

PLEKHF1-201, Transcript of pleckstrin homology and FYVE domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PLEKHF1, Length 2,084 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLEKHF1-201ENST00000436066 TRIM52Q96A61 297 aa36.28■■■■□ 3.4
PLEKHF1-201ENST00000436066 ITSN2Q9NZM3 1697 aa36.26■■■■□ 3.4
PLEKHF1-201ENST00000436066 ROCK1Q13464 1354 aa36.26■■■■□ 3.4
PLEKHF1-201ENST00000436066 CHD1O14646 1710 aa36.24■■■■□ 3.39
PLEKHF1-201ENST00000436066 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP36.23■■■■□ 3.39
PLEKHF1-201ENST00000436066 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP36.23■■■■□ 3.39
PLEKHF1-201ENST00000436066 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa36.21■■■■□ 3.39
PLEKHF1-201ENST00000436066 ATP10BO94823 1461 aa36.2■■■■□ 3.39
PLEKHF1-201ENST00000436066 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP36.19■■■■□ 3.38
PLEKHF1-201ENST00000436066 PLEKHD1A6NEE1 506 aa36.19■■■■□ 3.38
PLEKHF1-201ENST00000436066 PTPRGP23470 1445 aa36.15■■■■□ 3.38
PLEKHF1-201ENST00000436066 MPHOSPH9Q99550 1183 aa36.13■■■■□ 3.37
PLEKHF1-201ENST00000436066 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP36.12■■■■□ 3.37
PLEKHF1-201ENST00000436066 ABCC10Q5T3U5 1492 aa36.05■■■■□ 3.36
PLEKHF1-201ENST00000436066 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa36.03■■■■□ 3.36
PLEKHF1-201ENST00000436066 KDM5BQ9UGL1 1544 aa36.03■■■■□ 3.36
PLEKHF1-201ENST00000436066 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa36.02■■■■□ 3.36
PLEKHF1-201ENST00000436066 SHROOM2Q13796 1616 aa36.02■■■■□ 3.36
PLEKHF1-201ENST00000436066 ADGBQ8N7X0 1667 aa36.01■■■■□ 3.36
PLEKHF1-201ENST00000436066 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP36.01■■■■□ 3.35
PLEKHF1-201ENST00000436066 CROCC2H7BZ55 1655 aa36■■■■□ 3.35
PLEKHF1-201ENST00000436066 NCOA1Q15788 1441 aa35.99■■■■□ 3.35
PLEKHF1-201ENST00000436066 FOXD1Q16676 465 aa35.98■■■■□ 3.35
PLEKHF1-201ENST00000436066 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP35.96■■■■□ 3.35
PLEKHF1-201ENST00000436066 ADGRL2O95490 1459 aa35.95■■■■□ 3.35
PLEKHF1-201ENST00000436066 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP35.9■■■■□ 3.34
PLEKHF1-201ENST00000436066 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa35.89■■■■□ 3.34
PLEKHF1-201ENST00000436066 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa35.88■■■■□ 3.33
PLEKHF1-201ENST00000436066 ERCC6L2Q5T890 1561 aa35.86■■■■□ 3.33
PLEKHF1-201ENST00000436066 SHANK2Q9UPX8 1470 aa35.81■■■■□ 3.32
PLEKHF1-201ENST00000436066 PZPP20742 1482 aa35.81■■■■□ 3.32
PLEKHF1-201ENST00000436066 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP35.8■■■■□ 3.32
PLEKHF1-201ENST00000436066 L3MBTL2Q969R5 705 aa35.79■■■■□ 3.32
PLEKHF1-201ENST00000436066 C9orf84Q5VXU9 1444 aa35.79■■■■□ 3.32
PLEKHF1-201ENST00000436066 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa35.76■■■■□ 3.32
PLEKHF1-201ENST00000436066 ABCC2Q92887 1545 aa35.76■■■■□ 3.31
PLEKHF1-201ENST00000436066 TSPY4P0CV99 314 aa35.75■■■■□ 3.31
PLEKHF1-201ENST00000436066 TSPY10P0CW01 314 aa35.75■■■■□ 3.31
PLEKHF1-201ENST00000436066 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP35.74■■■■□ 3.31
PLEKHF1-201ENST00000436066 PREX2Q70Z35 1606 aa35.74■■■■□ 3.31
PLEKHF1-201ENST00000436066 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa35.73■■■■□ 3.31
PLEKHF1-201ENST00000436066 CLASP1Q7Z460 1538 aa35.73■■■■□ 3.31
PLEKHF1-201ENST00000436066 ARHGEF5Q12774 1597 aa35.72■■■■□ 3.31
PLEKHF1-201ENST00000436066 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa35.69■■■■□ 3.3
PLEKHF1-201ENST00000436066 MBD5Q9P267 1494 aa35.69■■■■□ 3.3
PLEKHF1-201ENST00000436066 TEX14Q8IWB6 1497 aa35.67■■■■□ 3.3
PLEKHF1-201ENST00000436066 KCNH8Q96L42 1107 aa35.66■■■■□ 3.3
PLEKHF1-201ENST00000436066 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa35.65■■■■□ 3.3
PLEKHF1-201ENST00000436066 TTC37Q6PGP7 1564 aa35.65■■■■□ 3.3
PLEKHF1-201ENST00000436066 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP35.64■■■■□ 3.3
PLEKHF1-201ENST00000436066 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP35.63■■■■□ 3.29
PLEKHF1-201ENST00000436066 CCDC141Q6ZP82 1450 aa35.62■■■■□ 3.29
PLEKHF1-201ENST00000436066 PKD2Q13563 968 aa35.61■■■■□ 3.29
PLEKHF1-201ENST00000436066 KIF15Q9NS87 1388 aa35.6■■■■□ 3.29
PLEKHF1-201ENST00000436066 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP35.6■■■■□ 3.29
PLEKHF1-201ENST00000436066 ARHGAP5Q13017 1502 aa35.59■■■■□ 3.29
PLEKHF1-201ENST00000436066 RSPH4AQ5TD94 716 aa35.58■■■■□ 3.29
PLEKHF1-201ENST00000436066 NUP155O75694 1391 aa35.58■■■■□ 3.29
PLEKHF1-201ENST00000436066 ANP32CO43423 234 aa35.57■■■■□ 3.28
PLEKHF1-201ENST00000436066 NBPF8Q3BBV2 869 aa35.55■■■■□ 3.28
PLEKHF1-201ENST00000436066 SYCP2Q9BX26 1530 aa35.53■■■■□ 3.28
PLEKHF1-201ENST00000436066 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP35.53■■■■□ 3.28
PLEKHF1-201ENST00000436066 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa35.52■■■■□ 3.28
PLEKHF1-201ENST00000436066 MYO5CQ9NQX4 1742 aa35.52■■■■□ 3.28
PLEKHF1-201ENST00000436066 KDM5DQ9BY66 1539 aa35.51■■■■□ 3.27
PLEKHF1-201ENST00000436066 WASHC2AQ641Q2 1341 aa35.48■■■■□ 3.27
PLEKHF1-201ENST00000436066 CCER2I3L3R5 266 aa35.46■■■■□ 3.27
PLEKHF1-201ENST00000436066 MAST1Q9Y2H9 1570 aa35.43■■■■□ 3.26
PLEKHF1-201ENST00000436066 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa35.42■■■■□ 3.26
PLEKHF1-201ENST00000436066 PLCH2O75038 1416 aa35.37■■■■□ 3.25
PLEKHF1-201ENST00000436066 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa35.32■■■■□ 3.25
PLEKHF1-201ENST00000436066 FAM135AQ9P2D6 1515 aa35.32■■■■□ 3.24
PLEKHF1-201ENST00000436066 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa35.31■■■■□ 3.24
PLEKHF1-201ENST00000436066 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP35.31■■■■□ 3.24
PLEKHF1-201ENST00000436066 PLXNC1O60486 1568 aa35.3■■■■□ 3.24
PLEKHF1-201ENST00000436066 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa35.29■■■■□ 3.24
PLEKHF1-201ENST00000436066 CCDC7Q96M83 1385 aa35.28■■■■□ 3.24
PLEKHF1-201ENST00000436066 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP35.28■■■■□ 3.24
PLEKHF1-201ENST00000436066 CNTLNQ9NXG0 1405 aa35.25■■■■□ 3.23
PLEKHF1-201ENST00000436066 UNC13BO14795 1591 aa35.24■■■■□ 3.23
PLEKHF1-201ENST00000436066 ABCC1P33527 1531 aa35.22■■■■□ 3.23
PLEKHF1-201ENST00000436066 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa35.2■■■■□ 3.22
PLEKHF1-201ENST00000436066 DUOX2Q9NRD8 1548 aa35.2■■■■□ 3.22
PLEKHF1-201ENST00000436066 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP35.18■■■■□ 3.22
PLEKHF1-201ENST00000436066 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP35.17■■■■□ 3.22
PLEKHF1-201ENST00000436066 KIF7Q2M1P5 1343 aa35.16■■■■□ 3.22
PLEKHF1-201ENST00000436066 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa35.15■■■■□ 3.22
PLEKHF1-201ENST00000436066 WDR7Q9Y4E6 1490 aa35.15■■■■□ 3.22
PLEKHF1-201ENST00000436066 USP47Q96K76 1375 aa35.14■■■■□ 3.22
PLEKHF1-201ENST00000436066 ERBINQ96RT1 1412 aa35.13■■■■□ 3.21
PLEKHF1-201ENST00000436066 ARAP3Q8WWN8 1544 aa35.12■■■■□ 3.21
PLEKHF1-201ENST00000436066 RALGAPBQ86X10 1494 aa35.11■■■■□ 3.21
PLEKHF1-201ENST00000436066 IQGAP3Q86VI3 1631 aa35.11■■■■□ 3.21
PLEKHF1-201ENST00000436066 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP35.11■■■■□ 3.21
PLEKHF1-201ENST00000436066 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa35.1■■■■□ 3.21
PLEKHF1-201ENST00000436066 CCDC144AA2RUR9 1427 aa35.09■■■■□ 3.21
PLEKHF1-201ENST00000436066 DCAF11Q8TEB1 546 aa35.09■■■■□ 3.21
PLEKHF1-201ENST00000436066 KDM5CP41229 1560 aa35.09■■■■□ 3.21
PLEKHF1-201ENST00000436066 MAGI2Q86UL8 1455 aa35.05■■■■□ 3.2
PLEKHF1-201ENST00000436066 PLA2R1Q13018 1463 aa35.03■■■■□ 3.2
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