RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423170.1

RNF25-202, Transcript of ring finger protein 25, humanhuman

TSL 5

Gene RNF25, Length 624 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF25-202ENST00000423170 MYO5CQ9NQX4 1742 aa21.42■■□□□ 1.02
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RNF25-202ENST00000423170 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
RNF25-202ENST00000423170 ILDR2Q71H61 639 aa21.37■■□□□ 1.01
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RNF25-202ENST00000423170 CSRNP3Q8WYN3 585 aa21.35■■□□□ 1.01
RNF25-202ENST00000423170 C9orf84Q5VXU9 1444 aa21.35■■□□□ 1.01
RNF25-202ENST00000423170 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa21.35■■□□□ 1.01
RNF25-202ENST00000423170 ATP10AO60312 1499 aa21.34■■□□□ 1.01
RNF25-202ENST00000423170 SCAPERQ9BY12 1400 aa21.34■■□□□ 1.01
RNF25-202ENST00000423170 KDM5CP41229 1560 aa21.34■■□□□ 1.01
RNF25-202ENST00000423170 C3P01024 1663 aa21.34■■□□□ 1.01
RNF25-202ENST00000423170 PLCH2O75038 1416 aa21.33■■□□□ 1.01
RNF25-202ENST00000423170 KIF14Q15058 1648 aa21.33■■□□□ 1
RNF25-202ENST00000423170 MLECQ14165 292 aa21.32■■□□□ 1
RNF25-202ENST00000423170 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa21.31■■□□□ 1
RNF25-202ENST00000423170 EEA1Q15075 1411 aa21.3■■□□□ 1
RNF25-202ENST00000423170 DISP3Q9P2K9 1392 aa21.3■■□□□ 1
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RNF25-202ENST00000423170 SOCS7O14512 581 aa21.26■□□□□ 0.99
RNF25-202ENST00000423170 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa21.24■□□□□ 0.99
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RNF25-202ENST00000423170 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP21.24■□□□□ 0.99
RNF25-202ENST00000423170 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa21.23■□□□□ 0.99
RNF25-202ENST00000423170 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa21.23■□□□□ 0.99
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RNF25-202ENST00000423170 AGLP35573 1532 aa21.16■□□□□ 0.98
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RNF25-202ENST00000423170 MLH3Q9UHC1 1453 aa21.13■□□□□ 0.97
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RNF25-202ENST00000423170 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa21.12■□□□□ 0.97
RNF25-202ENST00000423170 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
RNF25-202ENST00000423170 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa21.1■□□□□ 0.97
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RNF25-202ENST00000423170 AFAP1Q8N556 730 aa21.09■□□□□ 0.97
RNF25-202ENST00000423170 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP21.09■□□□□ 0.97
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RNF25-202ENST00000423170 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP20.93■□□□□ 0.94
RNF25-202ENST00000423170 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
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RNF25-202ENST00000423170 SYCP2Q9BX26 1530 aa20.92■□□□□ 0.94
RNF25-202ENST00000423170 EHMT2Q96KQ7 1210 aa20.91■□□□□ 0.94
RNF25-202ENST00000423170 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
RNF25-202ENST00000423170 MYT1LQ9UL68 1186 aa20.9■□□□□ 0.94
RNF25-202ENST00000423170 CCDC18Q5T9S5 1454 aa20.89■□□□□ 0.94
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RNF25-202ENST00000423170 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa20.7■□□□□ 0.9
RNF25-202ENST00000423170 STRCP1A6NGW2 1772 aa20.69■□□□□ 0.9
RNF25-202ENST00000423170 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP20.69■□□□□ 0.9
RNF25-202ENST00000423170 PPP6R1Q9UPN7 881 aa20.69■□□□□ 0.9
RNF25-202ENST00000423170 HSPA1LP34931 641 aa20.68■□□□□ 0.9
RNF25-202ENST00000423170 TIAM1Q13009 1591 aa20.68■□□□□ 0.9
RNF25-202ENST00000423170 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP20.67■□□□□ 0.9
RNF25-202ENST00000423170 SHANK2Q9UPX8 1470 aa20.66■□□□□ 0.9
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