RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423112.2

RFX3-AS1-201, RFX3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene RFX3-AS1, Length 552 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CSRNP3Q8WYN3 585 aa28.09■■■□□ 2.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HECW1Q76N89 1606 aa28.09■■■□□ 2.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PREX1Q8TCU6 1659 aa28.07■■■□□ 2.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa28.06■■■□□ 2.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SCAPERQ9BY12 1400 aa28.05■■■□□ 2.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ATP10AO60312 1499 aa28.04■■■□□ 2.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 C9orf84Q5VXU9 1444 aa28.02■■■□□ 2.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP28.02■■■□□ 2.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PLCH2O75038 1416 aa28.01■■■□□ 2.07
RFX3-AS1-201ENST00000423112 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa27.98■■■□□ 2.07
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP27.97■■■□□ 2.07
RFX3-AS1-201ENST00000423112 STRCQ7RTU9 1775 aa27.94■■■□□ 2.06
RFX3-AS1-201ENST00000423112 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa27.93■■■□□ 2.06
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa27.93■■■□□ 2.06
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PTPRTO14522 1441 aa27.91■■■□□ 2.06
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP27.87■■■□□ 2.05
RFX3-AS1-201ENST00000423112 EEA1Q15075 1411 aa27.87■■■□□ 2.05
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa27.87■■■□□ 2.05
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RFX3-AS1-201ENST00000423112 IQSEC2Q5JU85 1478 aa27.83■■■□□ 2.04
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP27.81■■■□□ 2.04
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MYO5CQ9NQX4 1742 aa27.81■■■□□ 2.04
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MYT1LQ9UL68 1186 aa27.79■■■□□ 2.04
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KDM5CP41229 1560 aa27.78■■■□□ 2.04
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP27.78■■■□□ 2.04
RFX3-AS1-201ENST00000423112 AFAP1Q8N556 730 aa27.77■■■□□ 2.04
RFX3-AS1-201ENST00000423112 REREQ9P2R6 1566 aa27.77■■■□□ 2.04
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LTBP4Q8N2S1 1624 aa27.76■■■□□ 2.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa27.75■■■□□ 2.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP27.73■■■□□ 2.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa27.73■■■□□ 2.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ARHGAP5Q13017 1502 aa27.72■■■□□ 2.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 C3P01024 1663 aa27.72■■■□□ 2.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FMN1Q68DA7 1419 aa27.71■■■□□ 2.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KIF14Q15058 1648 aa27.7■■■□□ 2.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MLH3Q9UHC1 1453 aa27.7■■■□□ 2.02
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NCOA1Q15788 1441 aa27.69■■■□□ 2.02
RFX3-AS1-201ENST00000423112 AGLP35573 1532 aa27.69■■■□□ 2.02
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CLIP1P30622 1438 aa27.67■■■□□ 2.02
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP27.67■■■□□ 2.02
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CNTLNQ9NXG0 1405 aa27.67■■■□□ 2.02
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ABCA6Q8N139 1617 aa27.63■■■□□ 2.01
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NPATQ14207 1427 aa27.58■■■□□ 2.01
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa27.56■■■□□ 2
RFX3-AS1-201ENST00000423112 UBAP1LF5GYI3 381 aa27.56■■■□□ 2
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ABCC1P33527 1531 aa27.52■■■□□ 2
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa27.52■■■□□ 2
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa27.51■■□□□ 1.99
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP27.5■■□□□ 1.99
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RFX3-AS1-201ENST00000423112 MROH2AA6NES4 1674 aa27.49■■□□□ 1.99
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PKD2Q13563 968 aa27.49■■□□□ 1.99
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZMYM3Q14202 1370 aa27.48■■□□□ 1.99
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa27.48■■□□□ 1.99
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PREX2Q70Z35 1606 aa27.48■■□□□ 1.99
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa27.47■■□□□ 1.99
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ITSN2Q9NZM3 1697 aa27.46■■□□□ 1.99
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RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP27.37■■□□□ 1.97
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa27.37■■□□□ 1.97
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CCDC18Q5T9S5 1454 aa27.37■■□□□ 1.97
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa27.36■■□□□ 1.97
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PPP6R1Q9UPN7 881 aa27.36■■□□□ 1.97
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MYO3AQ8NEV4 1616 aa27.35■■□□□ 1.97
RFX3-AS1-201ENST00000423112 EHMT2Q96KQ7 1210 aa27.35■■□□□ 1.97
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP27.35■■□□□ 1.97
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PTPRKQ15262 1439 aa27.33■■□□□ 1.96
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP27.31■■□□□ 1.96
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa27.3■■□□□ 1.96
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TOM1O60784 492 aa27.29■■□□□ 1.96
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP27.29■■□□□ 1.96
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa27.29■■□□□ 1.96
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP27.28■■□□□ 1.96
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HSPA1LP34931 641 aa27.28■■□□□ 1.96
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SYCP2Q9BX26 1530 aa27.26■■□□□ 1.96
RFX3-AS1-201ENST00000423112 A2MP01023 1474 aa27.26■■□□□ 1.95
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PLXNC1O60486 1568 aa27.26■■□□□ 1.95
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ATP7AQ04656 1500 aa27.26■■□□□ 1.95
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP27.25■■□□□ 1.95
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GGT6Q6P531 493 aa27.25■■□□□ 1.95
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PIP4K2BP78356 416 aa27.24■■□□□ 1.95
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa27.24■■□□□ 1.95
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CPS1P31327 1500 aa27.23■■□□□ 1.95
RFX3-AS1-201ENST00000423112 A2ML1A8K2U0 1454 aa27.22■■□□□ 1.95
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa27.22■■□□□ 1.95
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP27.21■■□□□ 1.95
RFX3-AS1-201ENST00000423112 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP27.19■■□□□ 1.94
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP27.17■■□□□ 1.94
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP27.16■■□□□ 1.94
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP27.16■■□□□ 1.94
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SHANK2Q9UPX8 1470 aa27.15■■□□□ 1.94
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FYCO1Q9BQS8 1478 aa27.13■■□□□ 1.93
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ADGBQ8N7X0 1667 aa27.1■■□□□ 1.93
RFX3-AS1-201ENST00000423112 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP27.1■■□□□ 1.93
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CCNB3Q8WWL7 1395 aa27.09■■□□□ 1.93
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ANKLE2Q86XL3 938 aa27.08■■□□□ 1.93
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