RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420058.1

NFE4-201, Transcript of nuclear factor, erythroid 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NFE4, Length 1,072 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE4-201ENST00000420058 POGZQ7Z3K3 1410 aa23.83■■□□□ 1.4
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NFE4-201ENST00000420058 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa23.77■■□□□ 1.4
NFE4-201ENST00000420058 EHMT2Q96KQ7 1210 aa23.76■■□□□ 1.39
NFE4-201ENST00000420058 ATP10AO60312 1499 aa23.75■■□□□ 1.39
NFE4-201ENST00000420058 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
NFE4-201ENST00000420058 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa23.74■■□□□ 1.39
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NFE4-201ENST00000420058 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa23.67■■□□□ 1.38
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NFE4-201ENST00000420058 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
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NFE4-201ENST00000420058 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa23.56■■□□□ 1.36
NFE4-201ENST00000420058 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa23.55■■□□□ 1.36
NFE4-201ENST00000420058 MLH3Q9UHC1 1453 aa23.55■■□□□ 1.36
NFE4-201ENST00000420058 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa23.54■■□□□ 1.36
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NFE4-201ENST00000420058 STRCQ7RTU9 1775 aa23.52■■□□□ 1.36
NFE4-201ENST00000420058 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa23.52■■□□□ 1.36
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NFE4-201ENST00000420058 MYT1LQ9UL68 1186 aa23.5■■□□□ 1.35
NFE4-201ENST00000420058 DMRT2Q9Y5R5 561 aa23.5■■□□□ 1.35
NFE4-201ENST00000420058 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa23.49■■□□□ 1.35
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NFE4-201ENST00000420058 ABCA6Q8N139 1617 aa23.48■■□□□ 1.35
NFE4-201ENST00000420058 AGLP35573 1532 aa23.47■■□□□ 1.35
NFE4-201ENST00000420058 ABCC1P33527 1531 aa23.44■■□□□ 1.34
NFE4-201ENST00000420058 PREX2Q70Z35 1606 aa23.42■■□□□ 1.34
NFE4-201ENST00000420058 C3P01024 1663 aa23.41■■□□□ 1.34
NFE4-201ENST00000420058 PTPRTO14522 1441 aa23.41■■□□□ 1.34
NFE4-201ENST00000420058 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa23.4■■□□□ 1.34
NFE4-201ENST00000420058 CCDC18Q5T9S5 1454 aa23.4■■□□□ 1.34
NFE4-201ENST00000420058 ITSN2Q9NZM3 1697 aa23.38■■□□□ 1.33
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NFE4-201ENST00000420058 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa23.36■■□□□ 1.33
NFE4-201ENST00000420058 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP23.35■■□□□ 1.33
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NFE4-201ENST00000420058 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa23.34■■□□□ 1.33
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NFE4-201ENST00000420058 LTBP4Q8N2S1 1624 aa23.33■■□□□ 1.32
NFE4-201ENST00000420058 NCOA1Q15788 1441 aa23.33■■□□□ 1.32
NFE4-201ENST00000420058 ZMYM3Q14202 1370 aa23.32■■□□□ 1.32
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NFE4-201ENST00000420058 DISP3Q9P2K9 1392 aa23.27■■□□□ 1.32
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NFE4-201ENST00000420058 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa23.26■■□□□ 1.31
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NFE4-201ENST00000420058 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa23.22■■□□□ 1.31
NFE4-201ENST00000420058 MROH2AA6NES4 1674 aa23.21■■□□□ 1.31
NFE4-201ENST00000420058 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
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NFE4-201ENST00000420058 ATP7AQ04656 1500 aa23.19■■□□□ 1.3
NFE4-201ENST00000420058 A2MP01023 1474 aa23.19■■□□□ 1.3
NFE4-201ENST00000420058 IQSEC2Q5JU85 1478 aa23.19■■□□□ 1.3
NFE4-201ENST00000420058 PTPRKQ15262 1439 aa23.19■■□□□ 1.3
NFE4-201ENST00000420058 CCNB3Q8WWL7 1395 aa23.18■■□□□ 1.3
NFE4-201ENST00000420058 SOCS7O14512 581 aa23.18■■□□□ 1.3
NFE4-201ENST00000420058 GGT6Q6P531 493 aa23.18■■□□□ 1.3
NFE4-201ENST00000420058 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa23.17■■□□□ 1.3
NFE4-201ENST00000420058 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
NFE4-201ENST00000420058 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
NFE4-201ENST00000420058 MBD5Q9P267 1494 aa23.14■■□□□ 1.29
NFE4-201ENST00000420058 PPP6R1Q9UPN7 881 aa23.14■■□□□ 1.29
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NFE4-201ENST00000420058 PLA2R1Q13018 1463 aa23.11■■□□□ 1.29
NFE4-201ENST00000420058 MTUS2Q5JR59 1369 aa23.11■■□□□ 1.29
NFE4-201ENST00000420058 MYO3AQ8NEV4 1616 aa23.08■■□□□ 1.28
NFE4-201ENST00000420058 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
NFE4-201ENST00000420058 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
NFE4-201ENST00000420058 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
NFE4-201ENST00000420058 UBAP1LF5GYI3 381 aa23.06■■□□□ 1.28
NFE4-201ENST00000420058 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa23.06■■□□□ 1.28
NFE4-201ENST00000420058 TIAM1Q13009 1591 aa23.06■■□□□ 1.28
NFE4-201ENST00000420058 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa23.05■■□□□ 1.28
NFE4-201ENST00000420058 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
NFE4-201ENST00000420058 CEP162Q5TB80 1403 aa23.02■■□□□ 1.28
NFE4-201ENST00000420058 ADGBQ8N7X0 1667 aa23.02■■□□□ 1.28
NFE4-201ENST00000420058 A2ML1A8K2U0 1454 aa23.01■■□□□ 1.27
NFE4-201ENST00000420058 KIF3BO15066 747 aa22.99■■□□□ 1.27
NFE4-201ENST00000420058 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
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