RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418455.1

USP9YP27-201, Transcript of USP9Y pseudogene 27, humanhuman

BASIC

Gene USP9YP27, Length 438 nt, Biotype unprocessed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9YP27-201ENST00000418455 DCAF8L2P0C7V8 631 aa9.9□□□□□ -0.82
USP9YP27-201ENST00000418455 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
USP9YP27-201ENST00000418455 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
USP9YP27-201ENST00000418455 KIF3CO14782 793 aa9.88□□□□□ -0.83
USP9YP27-201ENST00000418455 DOK7Q18PE1 504 aa9.85□□□□□ -0.83
USP9YP27-201ENST00000418455 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
USP9YP27-201ENST00000418455 C2orf72A6NCS6 295 aa9.83□□□□□ -0.84
USP9YP27-201ENST00000418455 RIMBP2O15034 1052 aa9.8□□□□□ -0.84
USP9YP27-201ENST00000418455 ZNF710Q8N1W2 664 aa9.8□□□□□ -0.84
USP9YP27-201ENST00000418455 TMC2Q8TDI7 906 aa9.8□□□□□ -0.84
USP9YP27-201ENST00000418455 MARVELD3Q96A59 401 aa9.8□□□□□ -0.84
USP9YP27-201ENST00000418455 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
USP9YP27-201ENST00000418455 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa9.79□□□□□ -0.84
USP9YP27-201ENST00000418455 EMP3P54852 163 aa9.76□□□□□ -0.85
USP9YP27-201ENST00000418455 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
USP9YP27-201ENST00000418455 GPR153Q6NV75 609 aa9.75□□□□□ -0.85
USP9YP27-201ENST00000418455 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
USP9YP27-201ENST00000418455 SLC34A2O95436 690 aa9.74□□□□□ -0.85
USP9YP27-201ENST00000418455 FOXK1P85037 733 aa9.74□□□□□ -0.85
USP9YP27-201ENST00000418455 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa9.72□□□□□ -0.85
USP9YP27-201ENST00000418455 POTEB3A0JP26 581 aa9.7□□□□□ -0.86
USP9YP27-201ENST00000418455 MMRN1Q13201 1228 aa9.7□□□□□ -0.86
USP9YP27-201ENST00000418455 POTEBQ6S5H4 581 aa9.7□□□□□ -0.86
USP9YP27-201ENST00000418455 SPNS2Q8IVW8 549 aa9.7□□□□□ -0.86
USP9YP27-201ENST00000418455 HS3ST6Q96QI5 342 aa9.7□□□□□ -0.86
USP9YP27-201ENST00000418455 FAM205CA6NFA0 338 aa9.69□□□□□ -0.86
USP9YP27-201ENST00000418455 DSG2Q14126 1118 aa9.69□□□□□ -0.86
USP9YP27-201ENST00000418455 ARSIQ5FYB1 569 aa9.69□□□□□ -0.86
USP9YP27-201ENST00000418455 PLPP6Q8IY26 295 aa9.68□□□□□ -0.86
USP9YP27-201ENST00000418455 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa9.67□□□□□ -0.86
USP9YP27-201ENST00000418455 PDE4AP27815 886 aa9.66□□□□□ -0.86
USP9YP27-201ENST00000418455 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa9.66□□□□□ -0.86
USP9YP27-201ENST00000418455 ERBB3P21860 1342 aa9.65□□□□□ -0.86
USP9YP27-201ENST00000418455 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
USP9YP27-201ENST00000418455 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP9.65□□□□□ -0.86
USP9YP27-201ENST00000418455 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
USP9YP27-201ENST00000418455 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa9.63□□□□□ -0.87
USP9YP27-201ENST00000418455 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
USP9YP27-201ENST00000418455 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa9.62□□□□□ -0.87
USP9YP27-201ENST00000418455 MFSD10Q14728 455 aa9.61□□□□□ -0.87
USP9YP27-201ENST00000418455 CADPS2Q86UW7 1296 aa9.61□□□□□ -0.87
USP9YP27-201ENST00000418455 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa9.6□□□□□ -0.87
USP9YP27-201ENST00000418455 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
USP9YP27-201ENST00000418455 NUDT7P0C024 238 aa9.6□□□□□ -0.87
USP9YP27-201ENST00000418455 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
USP9YP27-201ENST00000418455 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa9.6□□□□□ -0.87
USP9YP27-201ENST00000418455 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa9.6□□□□□ -0.87
USP9YP27-201ENST00000418455 OXER1Q8TDS5 423 aa9.58□□□□□ -0.88
USP9YP27-201ENST00000418455 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
USP9YP27-201ENST00000418455 ZNF687Q8N1G0 1237 aa9.57□□□□□ -0.88
USP9YP27-201ENST00000418455 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
USP9YP27-201ENST00000418455 LHX6Q9UPM6 363 aa9.56□□□□□ -0.88
USP9YP27-201ENST00000418455 TBC1D12O60347 775 aa9.55□□□□□ -0.88
USP9YP27-201ENST00000418455 CFAP44Q96MT7 982 aa9.53□□□□□ -0.88
USP9YP27-201ENST00000418455 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP9.52□□□□□ -0.89
USP9YP27-201ENST00000418455 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
USP9YP27-201ENST00000418455 EMILIN3Q9NT22 766 aa9.49□□□□□ -0.89
USP9YP27-201ENST00000418455 CAMK2BQ13554 666 aa9.48□□□□□ -0.89
USP9YP27-201ENST00000418455 PBX2P40425 430 aa9.46□□□□□ -0.9
USP9YP27-201ENST00000418455 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
USP9YP27-201ENST00000418455 POTEEQ6S8J3 1075 aa9.45□□□□□ -0.9
USP9YP27-201ENST00000418455 EVI5O60447 810 aa9.43□□□□□ -0.9
USP9YP27-201ENST00000418455 MAP3K9P80192 1104 aa9.43□□□□□ -0.9
USP9YP27-201ENST00000418455 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP9.42□□□□□ -0.9
USP9YP27-201ENST00000418455 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa9.42□□□□□ -0.9
USP9YP27-201ENST00000418455 ARHGAP33O14559 1287 aa9.4□□□□□ -0.9
USP9YP27-201ENST00000418455 FOSBP53539 338 aa9.4□□□□□ -0.9
USP9YP27-201ENST00000418455 JPH4Q96JJ6 628 aa9.39□□□□□ -0.91
USP9YP27-201ENST00000418455 AXIN2Q9Y2T1 843 aa9.39□□□□□ -0.91
USP9YP27-201ENST00000418455 ZNF454Q8N9F8 522 aa9.38□□□□□ -0.91
USP9YP27-201ENST00000418455 DPYSL4O14531 572 aa9.36□□□□□ -0.91
USP9YP27-201ENST00000418455 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa9.36□□□□□ -0.91
USP9YP27-201ENST00000418455 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa9.36□□□□□ -0.91
USP9YP27-201ENST00000418455 PTGER2P43116 358 aa9.35□□□□□ -0.91
USP9YP27-201ENST00000418455 E2F4Q16254 413 aa9.35□□□□□ -0.91
USP9YP27-201ENST00000418455 BCL2L12Q9HB09 334 aa9.35□□□□□ -0.91
USP9YP27-201ENST00000418455 WDR70Q9NW82 654 aa9.35□□□□□ -0.91
USP9YP27-201ENST00000418455 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
USP9YP27-201ENST00000418455 PSEN2P49810 448 aa9.33□□□□□ -0.92
USP9YP27-201ENST00000418455 TK2O00142 265 aa9.32□□□□□ -0.92
USP9YP27-201ENST00000418455 DMRTA1Q5VZB9 504 aa9.32□□□□□ -0.92
USP9YP27-201ENST00000418455 ZDHHC16Q969W1 377 aa9.32□□□□□ -0.92
USP9YP27-201ENST00000418455 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa9.32□□□□□ -0.92
USP9YP27-201ENST00000418455 PLCB2Q00722 1185 aa9.31□□□□□ -0.92
USP9YP27-201ENST00000418455 PDIA6Q15084 440 aa9.31□□□□□ -0.92
USP9YP27-201ENST00000418455 MYT1LQ9UL68 1186 aa9.31□□□□□ -0.92
USP9YP27-201ENST00000418455 PHF14O94880 888 aa9.3□□□□□ -0.92
USP9YP27-201ENST00000418455 ADGRD1Q6QNK2 874 aa9.3□□□□□ -0.92
USP9YP27-201ENST00000418455 KCNK17Q96T54 332 aa9.3□□□□□ -0.92
USP9YP27-201ENST00000418455 ADAM33Q9BZ11 813 aa9.3□□□□□ -0.92
USP9YP27-201ENST00000418455 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
USP9YP27-201ENST00000418455 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
USP9YP27-201ENST00000418455 KCNH8Q96L42 1107 aa9.29□□□□□ -0.92
USP9YP27-201ENST00000418455 PTPREP23469 700 aa9.28□□□□□ -0.92
USP9YP27-201ENST00000418455 TYW1BQ6NUM6 668 aa9.27□□□□□ -0.93
USP9YP27-201ENST00000418455 FBXW7Q969H0 707 aa9.27□□□□□ -0.93
USP9YP27-201ENST00000418455 EPAS1Q99814 870 aa9.27□□□□□ -0.93
USP9YP27-201ENST00000418455 SLC4A5Q9BY07 1137 aa9.27□□□□□ -0.93
USP9YP27-201ENST00000418455 HRO43593 1189 aa9.26□□□□□ -0.93
USP9YP27-201ENST00000418455 ZBED2Q9BTP6 218 aa9.24□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 76.3 ms