RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418244.5

FOXD3-AS1-201, FOXD3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene FOXD3-AS1, Length 941 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP28.16■■■□□ 2.1
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa28.15■■■□□ 2.1
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 RAPGEF3O95398 923 aa28.14■■■□□ 2.1
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa28.14■■■□□ 2.1
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 ARHGAP5Q13017 1502 aa28.13■■■□□ 2.09
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa28.12■■■□□ 2.09
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 MTUS2Q5JR59 1369 aa28.11■■■□□ 2.09
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 TIAM1Q13009 1591 aa28.09■■■□□ 2.09
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa28.08■■■□□ 2.09
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 SCAPERQ9BY12 1400 aa28.08■■■□□ 2.09
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 POGZQ7Z3K3 1410 aa28.06■■■□□ 2.08
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP28.04■■■□□ 2.08
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 MAP3K1Q13233 1512 aa28.03■■■□□ 2.08
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa28.02■■■□□ 2.08
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 ABCC1P33527 1531 aa28■■■□□ 2.07
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 MAGI2Q86UL8 1455 aa28■■■□□ 2.07
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 FBXO41Q8TF61 875 aa27.99■■■□□ 2.07
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP27.98■■■□□ 2.07
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 CCNB3Q8WWL7 1395 aa27.98■■■□□ 2.07
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 ITSN2Q9NZM3 1697 aa27.97■■■□□ 2.07
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa27.96■■■□□ 2.07
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 KDM5CP41229 1560 aa27.96■■■□□ 2.07
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa27.95■■■□□ 2.07
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa27.95■■■□□ 2.06
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa27.95■■■□□ 2.06
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa27.93■■■□□ 2.06
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 NCOA2Q15596 1464 aa27.92■■■□□ 2.06
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 YEATS2Q9ULM3 1422 aa27.9■■■□□ 2.06
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP27.89■■■□□ 2.06
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa27.88■■■□□ 2.05
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa27.87■■■□□ 2.05
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 AFAP1Q8N556 730 aa27.87■■■□□ 2.05
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa27.86■■■□□ 2.05
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 SYCP2Q9BX26 1530 aa27.86■■■□□ 2.05
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP27.85■■■□□ 2.05
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 MLH3Q9UHC1 1453 aa27.84■■■□□ 2.05
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP27.83■■■□□ 2.05
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 BCORL1Q5H9F3 1711 aa27.82■■■□□ 2.04
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 ADAMTSL3P82987 1691 aa27.81■■■□□ 2.04
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa27.81■■■□□ 2.04
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 ATP10AO60312 1499 aa27.81■■■□□ 2.04
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 PTPRMP28827 1452 aa27.8■■■□□ 2.04
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa27.78■■■□□ 2.04
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa27.78■■■□□ 2.04
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 C9orf84Q5VXU9 1444 aa27.78■■■□□ 2.04
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 APLP2Q06481 763 aa27.78■■■□□ 2.04
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 ABCA6Q8N139 1617 aa27.77■■■□□ 2.04
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 REREQ9P2R6 1566 aa27.76■■■□□ 2.03
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP27.75■■■□□ 2.03
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP27.74■■■□□ 2.03
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP27.74■■■□□ 2.03
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 MBD5Q9P267 1494 aa27.74■■■□□ 2.03
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa27.71■■■□□ 2.03
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP27.71■■■□□ 2.03
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 MYOM3Q5VTT5 1437 aa27.69■■■□□ 2.02
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 MADDQ8WXG6 1647 aa27.69■■■□□ 2.02
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 ATP7AQ04656 1500 aa27.68■■■□□ 2.02
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 MYT1LQ9UL68 1186 aa27.68■■■□□ 2.02
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP27.67■■■□□ 2.02
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 MIA2Q96PC5 1412 aa27.67■■■□□ 2.02
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 ARHGEF5Q12774 1597 aa27.65■■■□□ 2.02
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 AGLP35573 1532 aa27.64■■■□□ 2.02
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 CCDC141Q6ZP82 1450 aa27.63■■■□□ 2.01
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 RSPH4AQ5TD94 716 aa27.61■■■□□ 2.01
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP27.61■■■□□ 2.01
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa27.6■■■□□ 2.01
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa27.6■■■□□ 2.01
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 ADGBQ8N7X0 1667 aa27.58■■■□□ 2.01
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 LMTK3Q96Q04 1460 aa27.57■■■□□ 2
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 PLXNC1O60486 1568 aa27.56■■■□□ 2
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 MLECQ14165 292 aa27.54■■■□□ 2
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 PTPN23Q9H3S7 1636 aa27.53■■■□□ 2
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 A2MP01023 1474 aa27.53■■■□□ 2
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 FGD6Q6ZV73 1430 aa27.51■■□□□ 1.99
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 HSPA2P54652 639 aa27.51■■□□□ 1.99
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 MAST1Q9Y2H9 1570 aa27.51■■□□□ 1.99
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 PLPPR3Q6T4P5 718 aa27.49■■□□□ 1.99
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP27.49■■□□□ 1.99
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 TSPY4P0CV99 314 aa27.45■■□□□ 1.98
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 TSPY10P0CW01 314 aa27.45■■□□□ 1.98
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 CROCC2H7BZ55 1655 aa27.44■■□□□ 1.98
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 CERKQ8TCT0 537 aa27.42■■□□□ 1.98
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP27.42■■□□□ 1.98
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP27.41■■□□□ 1.98
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 SHANK2Q9UPX8 1470 aa27.4■■□□□ 1.98
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 ABCC5O15440 1437 aa27.39■■□□□ 1.97
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 CNTLNQ9NXG0 1405 aa27.37■■□□□ 1.97
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 DAPK1P53355 1430 aa27.36■■□□□ 1.97
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 MROH2AA6NES4 1674 aa27.36■■□□□ 1.97
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 C3P01024 1663 aa27.35■■□□□ 1.97
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 PPP6R1Q9UPN7 881 aa27.3■■□□□ 1.96
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP27.28■■□□□ 1.96
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 DUOX2Q9NRD8 1548 aa27.27■■□□□ 1.96
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 FAM135AQ9P2D6 1515 aa27.27■■□□□ 1.96
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP27.27■■□□□ 1.96
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 GGT6Q6P531 493 aa27.27■■□□□ 1.96
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 KIF3BO15066 747 aa27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.4 ms