RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412845.1

NEFHP1-201, Transcript of neurofilament heavy pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene NEFHP1, Length 2,629 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP1-201ENST00000412845 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa25.84■■□□□ 1.73
NEFHP1-201ENST00000412845 ARID3CA6NKF2 412 aa25.82■■□□□ 1.72
NEFHP1-201ENST00000412845 ERICH6Q7L0X2 663 aa25.82■■□□□ 1.72
NEFHP1-201ENST00000412845 ZBED9Q6R2W3 1325 aa25.81■■□□□ 1.72
NEFHP1-201ENST00000412845 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP25.81■■□□□ 1.72
NEFHP1-201ENST00000412845 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
NEFHP1-201ENST00000412845 KIF7Q2M1P5 1343 aa25.77■■□□□ 1.72
NEFHP1-201ENST00000412845 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa25.77■■□□□ 1.72
NEFHP1-201ENST00000412845 MIA2Q96PC5 1412 aa25.76■■□□□ 1.71
NEFHP1-201ENST00000412845 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
NEFHP1-201ENST00000412845 TEX14Q8IWB6 1497 aa25.75■■□□□ 1.71
NEFHP1-201ENST00000412845 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa25.73■■□□□ 1.71
NEFHP1-201ENST00000412845 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP25.7■■□□□ 1.7
NEFHP1-201ENST00000412845 DAPK1P53355 1430 aa25.68■■□□□ 1.7
NEFHP1-201ENST00000412845 WDR62O43379 1518 aa25.67■■□□□ 1.7
NEFHP1-201ENST00000412845 IQGAP2Q13576 1575 aa25.66■■□□□ 1.7
NEFHP1-201ENST00000412845 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP25.66■■□□□ 1.7
NEFHP1-201ENST00000412845 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP25.65■■□□□ 1.7
NEFHP1-201ENST00000412845 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP25.65■■□□□ 1.7
NEFHP1-201ENST00000412845 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP25.65■■□□□ 1.7
NEFHP1-201ENST00000412845 ABCC5O15440 1437 aa25.64■■□□□ 1.69
NEFHP1-201ENST00000412845 ROCK1Q13464 1354 aa25.63■■□□□ 1.69
NEFHP1-201ENST00000412845 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
NEFHP1-201ENST00000412845 PBRM1Q86U86 1689 aa25.6■■□□□ 1.69
NEFHP1-201ENST00000412845 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP25.59■■□□□ 1.69
NEFHP1-201ENST00000412845 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.58■■□□□ 1.69
NEFHP1-201ENST00000412845 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.68
NEFHP1-201ENST00000412845 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa25.57■■□□□ 1.68
NEFHP1-201ENST00000412845 BCORL1Q5H9F3 1711 aa25.55■■□□□ 1.68
NEFHP1-201ENST00000412845 POLR3GLQ9BT43 218 aa25.55■■□□□ 1.68
NEFHP1-201ENST00000412845 DNAJC5BQ9UF47 199 aa25.54■■□□□ 1.68
NEFHP1-201ENST00000412845 PZPP20742 1482 aa25.53■■□□□ 1.68
NEFHP1-201ENST00000412845 NUDCQ9Y266 331 aa25.52■■□□□ 1.68
NEFHP1-201ENST00000412845 ADAMTS12P58397 1594 aa25.52■■□□□ 1.68
NEFHP1-201ENST00000412845 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
NEFHP1-201ENST00000412845 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
NEFHP1-201ENST00000412845 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
NEFHP1-201ENST00000412845 USP47Q96K76 1375 aa25.49■■□□□ 1.67
NEFHP1-201ENST00000412845 RNF123Q5XPI4 1314 aa25.49■■□□□ 1.67
NEFHP1-201ENST00000412845 MBD5Q9P267 1494 aa25.49■■□□□ 1.67
NEFHP1-201ENST00000412845 DEKP35659 375 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
NEFHP1-201ENST00000412845 CCDC136Q96JN2 1154 aa25.46■■□□□ 1.67
NEFHP1-201ENST00000412845 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
NEFHP1-201ENST00000412845 MYT1LQ9UL68 1186 aa25.43■■□□□ 1.66
NEFHP1-201ENST00000412845 NBR1Q14596 966 aa25.42■■□□□ 1.66
NEFHP1-201ENST00000412845 KDM5CP41229 1560 aa25.41■■□□□ 1.66
NEFHP1-201ENST00000412845 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
NEFHP1-201ENST00000412845 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa25.4■■□□□ 1.66
NEFHP1-201ENST00000412845 DISP1Q96F81 1524 aa25.4■■□□□ 1.66
NEFHP1-201ENST00000412845 KIAA0556O60303 1618 aa25.39■■□□□ 1.65
NEFHP1-201ENST00000412845 KIF14Q15058 1648 aa25.39■■□□□ 1.65
NEFHP1-201ENST00000412845 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa25.38■■□□□ 1.65
NEFHP1-201ENST00000412845 PKD2Q13563 968 aa25.38■■□□□ 1.65
NEFHP1-201ENST00000412845 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
NEFHP1-201ENST00000412845 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa25.37■■□□□ 1.65
NEFHP1-201ENST00000412845 TMC1Q8TDI8 760 aa25.35■■□□□ 1.65
NEFHP1-201ENST00000412845 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
NEFHP1-201ENST00000412845 ADGBQ8N7X0 1667 aa25.34■■□□□ 1.65
NEFHP1-201ENST00000412845 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
NEFHP1-201ENST00000412845 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
NEFHP1-201ENST00000412845 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
NEFHP1-201ENST00000412845 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
NEFHP1-201ENST00000412845 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa25.29■■□□□ 1.64
NEFHP1-201ENST00000412845 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
NEFHP1-201ENST00000412845 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
NEFHP1-201ENST00000412845 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
NEFHP1-201ENST00000412845 CARD11Q9BXL7 1154 aa25.27■■□□□ 1.64
NEFHP1-201ENST00000412845 ADGRL2O95490 1459 aa25.27■■□□□ 1.64
NEFHP1-201ENST00000412845 CROCC2H7BZ55 1655 aa25.26■■□□□ 1.63
NEFHP1-201ENST00000412845 RALGAPBQ86X10 1494 aa25.26■■□□□ 1.63
NEFHP1-201ENST00000412845 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
NEFHP1-201ENST00000412845 ITSN2Q9NZM3 1697 aa25.26■■□□□ 1.63
NEFHP1-201ENST00000412845 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa25.25■■□□□ 1.63
NEFHP1-201ENST00000412845 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
NEFHP1-201ENST00000412845 KIF15Q9NS87 1388 aa25.24■■□□□ 1.63
NEFHP1-201ENST00000412845 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa25.23■■□□□ 1.63
NEFHP1-201ENST00000412845 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa25.23■■□□□ 1.63
NEFHP1-201ENST00000412845 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa25.22■■□□□ 1.63
NEFHP1-201ENST00000412845 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa25.22■■□□□ 1.63
NEFHP1-201ENST00000412845 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
NEFHP1-201ENST00000412845 PLB1Q6P1J6 1458 aa25.2■■□□□ 1.62
NEFHP1-201ENST00000412845 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
NEFHP1-201ENST00000412845 EXOC6Q8TAG9 804 aa25.19■■□□□ 1.62
NEFHP1-201ENST00000412845 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
NEFHP1-201ENST00000412845 RRP1P56182 461 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
NEFHP1-201ENST00000412845 NUP155O75694 1391 aa25.19■■□□□ 1.62
NEFHP1-201ENST00000412845 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
NEFHP1-201ENST00000412845 MRC2Q9UBG0 1479 aa25.18■■□□□ 1.62
NEFHP1-201ENST00000412845 ADCY10Q96PN6 1610 aa25.15■■□□□ 1.62
NEFHP1-201ENST00000412845 GRIN2AQ12879 1464 aa25.15■■□□□ 1.62
NEFHP1-201ENST00000412845 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa25.14■■□□□ 1.62
NEFHP1-201ENST00000412845 RALBP1Q15311 655 aa25.14■■□□□ 1.62
NEFHP1-201ENST00000412845 E9PCH4 1651 aa25.14■■□□□ 1.61
NEFHP1-201ENST00000412845 DCAF11Q8TEB1 546 aa25.13■■□□□ 1.61
NEFHP1-201ENST00000412845 RCAN3Q9UKA8 241 aa25.13■■□□□ 1.61
NEFHP1-201ENST00000412845 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
NEFHP1-201ENST00000412845 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa25.1■■□□□ 1.61
NEFHP1-201ENST00000412845 IFT140Q96RY7 1462 aa25.09■■□□□ 1.61
NEFHP1-201ENST00000412845 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
NEFHP1-201ENST00000412845 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
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