RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000397023.5

PPARG-208, Transcript of peroxisome proliferator activated receptor gamma, human

TSL 5

Gene PPARG, Length 2,002 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPARG-208	ENST00000397023	ADRA2B	P18089	450 aa		13.15	□□□□□ -0.3
PPARG-208	ENST00000397023	NOP58	Q9Y2X3	529 aa	Known RBP	13.15	□□□□□ -0.3
PPARG-208	ENST00000397023	SMG6	Q86US8	1419 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
PPARG-208	ENST00000397023	IRX6	P78412	446 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
PPARG-208	ENST00000397023	MRS2	Q9HD23	443 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PPARG-208	ENST00000397023	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
PPARG-208	ENST00000397023	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
PPARG-208	ENST00000397023	DEK	P35659	375 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
PPARG-208	ENST00000397023	ROCK1	Q13464	1354 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PPARG-208	ENST00000397023	ANP32A	P39687	249 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
PPARG-208	ENST00000397023	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		13.08	□□□□□ -0.31
PPARG-208	ENST00000397023	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PPARG-208	ENST00000397023	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
PPARG-208	ENST00000397023	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PPARG-208	ENST00000397023	B4GALNT3	Q6L9W6	998 aa		13.07	□□□□□ -0.32
PPARG-208	ENST00000397023	PBRM1	Q86U86	1689 aa		13.07	□□□□□ -0.32
PPARG-208	ENST00000397023	FAM9B	Q8IZU0	186 aa		13.06	□□□□□ -0.32
PPARG-208	ENST00000397023	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		13.06	□□□□□ -0.32
PPARG-208	ENST00000397023	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		13.05	□□□□□ -0.32
PPARG-208	ENST00000397023	NUDC	Q9Y266	331 aa		13.05	□□□□□ -0.32
PPARG-208	ENST00000397023	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		13.05	□□□□□ -0.32
PPARG-208	ENST00000397023	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		13.05	□□□□□ -0.32
PPARG-208	ENST00000397023	KDM6B	O15054	1643 aa		13.04	□□□□□ -0.32
PPARG-208	ENST00000397023	RTL5	Q5HYW3	569 aa	Predicted RBP	13.04	□□□□□ -0.32
PPARG-208	ENST00000397023	IPO9	Q96P70	1041 aa	Known RBP	13.04	□□□□□ -0.32
PPARG-208	ENST00000397023	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		13.03	□□□□□ -0.32
PPARG-208	ENST00000397023	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	13.03	□□□□□ -0.32
PPARG-208	ENST00000397023	ADAMTS12	P58397	1594 aa		13.03	□□□□□ -0.32
PPARG-208	ENST00000397023	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		13.03	□□□□□ -0.32
PPARG-208	ENST00000397023	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		13.03	□□□□□ -0.32
PPARG-208	ENST00000397023	ROCK2	O75116	1388 aa	Known RBP	13.03	□□□□□ -0.32
PPARG-208	ENST00000397023	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	13.02	□□□□□ -0.32
PPARG-208	ENST00000397023	CCDC184	Q52MB2	194 aa		13.02	□□□□□ -0.33
PPARG-208	ENST00000397023	CCDC136	Q96JN2	1154 aa		13.01	□□□□□ -0.33
PPARG-208	ENST00000397023	KTN1	Q86UP2	1357 aa	Known RBP	13.01	□□□□□ -0.33
PPARG-208	ENST00000397023	KIF14	Q15058	1648 aa		13.01	□□□□□ -0.33
PPARG-208	ENST00000397023	ZBTB47	Q9UFB7	747 aa	Predicted RBP	13	□□□□□ -0.33
PPARG-208	ENST00000397023	IQGAP2	Q13576	1575 aa		12.99	□□□□□ -0.33
PPARG-208	ENST00000397023	WDR62	O43379	1518 aa		12.99	□□□□□ -0.33
PPARG-208	ENST00000397023	DAPK1	P53355	1430 aa		12.99	□□□□□ -0.33
PPARG-208	ENST00000397023	MBD5	Q9P267	1494 aa		12.99	□□□□□ -0.33
PPARG-208	ENST00000397023	C11orf95	C9JLR9	678 aa	Predicted RBP	12.98	□□□□□ -0.33
PPARG-208	ENST00000397023	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	12.98	□□□□□ -0.33
PPARG-208	ENST00000397023	USP35	Q9P2H5	1018 aa		12.97	□□□□□ -0.33
PPARG-208	ENST00000397023	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		12.97	□□□□□ -0.33
PPARG-208	ENST00000397023	IFT140	Q96RY7	1462 aa		12.96	□□□□□ -0.33
PPARG-208	ENST00000397023	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		12.96	□□□□□ -0.34
PPARG-208	ENST00000397023	KDM5C	P41229	1560 aa		12.95	□□□□□ -0.34
PPARG-208	ENST00000397023	NBPF8	Q3BBV2	869 aa		12.95	□□□□□ -0.34
PPARG-208	ENST00000397023	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	12.93	□□□□□ -0.34
PPARG-208	ENST00000397023	PAK3	O75914	559 aa	Predicted RBP	12.93	□□□□□ -0.34
PPARG-208	ENST00000397023	NBR1	Q14596	966 aa		12.93	□□□□□ -0.34
PPARG-208	ENST00000397023	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		12.93	□□□□□ -0.34
PPARG-208	ENST00000397023	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	12.92	□□□□□ -0.34
PPARG-208	ENST00000397023	ABCC5	O15440	1437 aa		12.92	□□□□□ -0.34
PPARG-208	ENST00000397023	BRD4	O60885	1362 aa	Predicted RBP	12.92	□□□□□ -0.34
PPARG-208	ENST00000397023	USP47	Q96K76	1375 aa		12.92	□□□□□ -0.34
PPARG-208	ENST00000397023	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		12.92	□□□□□ -0.34
PPARG-208	ENST00000397023	KIF15	Q9NS87	1388 aa		12.91	□□□□□ -0.34
PPARG-208	ENST00000397023	MS4A1	P11836	297 aa		12.91	□□□□□ -0.34
PPARG-208	ENST00000397023	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		12.91	□□□□□ -0.34
PPARG-208	ENST00000397023	RALGAPB	Q86X10	1494 aa		12.91	□□□□□ -0.34
PPARG-208	ENST00000397023	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		12.91	□□□□□ -0.34
PPARG-208	ENST00000397023	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	12.91	□□□□□ -0.34
PPARG-208	ENST00000397023	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	12.91	□□□□□ -0.34
PPARG-208	ENST00000397023	LRPPRC	P42704	1394 aa	Known RBP	12.9	□□□□□ -0.34
PPARG-208	ENST00000397023	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		12.9	□□□□□ -0.34
PPARG-208	ENST00000397023	ADGRL2	O95490	1459 aa		12.9	□□□□□ -0.34
PPARG-208	ENST00000397023	PZP	P20742	1482 aa		12.9	□□□□□ -0.34
PPARG-208	ENST00000397023	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		12.89	□□□□□ -0.35
PPARG-208	ENST00000397023	PDE3B	Q13370	1112 aa		12.89	□□□□□ -0.35
PPARG-208	ENST00000397023	PNISR	Q8TF01	805 aa	Known RBP	12.89	□□□□□ -0.35
PPARG-208	ENST00000397023	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		12.89	□□□□□ -0.35
PPARG-208	ENST00000397023	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		12.89	□□□□□ -0.35
PPARG-208	ENST00000397023	INSR	P06213	1382 aa		12.89	□□□□□ -0.35
PPARG-208	ENST00000397023	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	12.88	□□□□□ -0.35
PPARG-208	ENST00000397023	RALBP1	Q15311	655 aa		12.88	□□□□□ -0.35
PPARG-208	ENST00000397023		E9PCH4	1651 aa		12.88	□□□□□ -0.35
PPARG-208	ENST00000397023	TMC1	Q8TDI8	760 aa		12.88	□□□□□ -0.35
PPARG-208	ENST00000397023	DISP1	Q96F81	1524 aa		12.87	□□□□□ -0.35
PPARG-208	ENST00000397023	KIAA0556	O60303	1618 aa		12.86	□□□□□ -0.35
PPARG-208	ENST00000397023	RRP1	P56182	461 aa	Known RBP	12.86	□□□□□ -0.35
PPARG-208	ENST00000397023	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	12.86	□□□□□ -0.35
PPARG-208	ENST00000397023	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
PPARG-208	ENST00000397023	DDRGK1	Q96HY6	314 aa		12.85	□□□□□ -0.35
PPARG-208	ENST00000397023	GRIN2A	Q12879	1464 aa		12.84	□□□□□ -0.35
PPARG-208	ENST00000397023	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		12.84	□□□□□ -0.35
PPARG-208	ENST00000397023	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		12.84	□□□□□ -0.35
PPARG-208	ENST00000397023	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		12.83	□□□□□ -0.36
PPARG-208	ENST00000397023	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		12.82	□□□□□ -0.36
PPARG-208	ENST00000397023	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		12.82	□□□□□ -0.36
PPARG-208	ENST00000397023	RCAN3	Q9UKA8	241 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PPARG-208	ENST00000397023	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
PPARG-208	ENST00000397023	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
PPARG-208	ENST00000397023	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PPARG-208	ENST00000397023	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PPARG-208	ENST00000397023	BACH2	Q9BYV9	841 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PPARG-208	ENST00000397023	PDE4A	P27815	886 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PPARG-208	ENST00000397023	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
PPARG-208	ENST00000397023	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		12.78	□□□□□ -0.36

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