RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373166.7

TRAPPC3-204, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,265 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-204ENST00000373166 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP31.75■■■□□ 2.67
TRAPPC3-204ENST00000373166 HECW1Q76N89 1606 aa31.73■■■□□ 2.67
TRAPPC3-204ENST00000373166 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa31.72■■■□□ 2.67
TRAPPC3-204ENST00000373166 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP31.71■■■□□ 2.67
TRAPPC3-204ENST00000373166 UBTFP17480 764 aaKnown RBP31.7■■■□□ 2.67
TRAPPC3-204ENST00000373166 FMN1Q68DA7 1419 aa31.68■■■□□ 2.66
TRAPPC3-204ENST00000373166 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa31.66■■■□□ 2.66
TRAPPC3-204ENST00000373166 ATP10AO60312 1499 aa31.66■■■□□ 2.66
TRAPPC3-204ENST00000373166 EHMT2Q96KQ7 1210 aa31.64■■■□□ 2.66
TRAPPC3-204ENST00000373166 C9orf84Q5VXU9 1444 aa31.62■■■□□ 2.65
TRAPPC3-204ENST00000373166 CERKQ8TCT0 537 aa31.59■■■□□ 2.65
TRAPPC3-204ENST00000373166 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa31.58■■■□□ 2.65
TRAPPC3-204ENST00000373166 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa31.58■■■□□ 2.65
TRAPPC3-204ENST00000373166 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa31.56■■■□□ 2.64
TRAPPC3-204ENST00000373166 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa31.54■■■□□ 2.64
TRAPPC3-204ENST00000373166 MYO5CQ9NQX4 1742 aa31.53■■■□□ 2.64
TRAPPC3-204ENST00000373166 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP31.53■■■□□ 2.64
TRAPPC3-204ENST00000373166 AFAP1Q8N556 730 aa31.53■■■□□ 2.64
TRAPPC3-204ENST00000373166 MYT1LQ9UL68 1186 aa31.53■■■□□ 2.64
TRAPPC3-204ENST00000373166 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP31.52■■■□□ 2.64
TRAPPC3-204ENST00000373166 CLIP1P30622 1438 aa31.51■■■□□ 2.64
TRAPPC3-204ENST00000373166 KIF14Q15058 1648 aa31.5■■■□□ 2.63
TRAPPC3-204ENST00000373166 ARHGAP5Q13017 1502 aa31.49■■■□□ 2.63
TRAPPC3-204ENST00000373166 DMRT2Q9Y5R5 561 aa31.46■■■□□ 2.63
TRAPPC3-204ENST00000373166 KDM5CP41229 1560 aa31.43■■■□□ 2.62
TRAPPC3-204ENST00000373166 PREX1Q8TCU6 1659 aa31.42■■■□□ 2.62
TRAPPC3-204ENST00000373166 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa31.4■■■□□ 2.62
TRAPPC3-204ENST00000373166 MLH3Q9UHC1 1453 aa31.36■■■□□ 2.61
TRAPPC3-204ENST00000373166 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP31.36■■■□□ 2.61
TRAPPC3-204ENST00000373166 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa31.34■■■□□ 2.61
TRAPPC3-204ENST00000373166 REREQ9P2R6 1566 aa31.34■■■□□ 2.61
TRAPPC3-204ENST00000373166 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa31.3■■■□□ 2.6
TRAPPC3-204ENST00000373166 CCDC18Q5T9S5 1454 aa31.27■■■□□ 2.6
TRAPPC3-204ENST00000373166 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa31.27■■■□□ 2.6
TRAPPC3-204ENST00000373166 AGLP35573 1532 aa31.27■■■□□ 2.6
TRAPPC3-204ENST00000373166 ABCA6Q8N139 1617 aa31.26■■■□□ 2.59
TRAPPC3-204ENST00000373166 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa31.26■■■□□ 2.59
TRAPPC3-204ENST00000373166 ABCC1P33527 1531 aa31.25■■■□□ 2.59
TRAPPC3-204ENST00000373166 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa31.25■■■□□ 2.59
TRAPPC3-204ENST00000373166 STRCQ7RTU9 1775 aa31.25■■■□□ 2.59
TRAPPC3-204ENST00000373166 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP31.24■■■□□ 2.59
TRAPPC3-204ENST00000373166 PREX2Q70Z35 1606 aa31.23■■■□□ 2.59
TRAPPC3-204ENST00000373166 PTPRTO14522 1441 aa31.22■■■□□ 2.59
TRAPPC3-204ENST00000373166 CNTLNQ9NXG0 1405 aa31.2■■■□□ 2.59
TRAPPC3-204ENST00000373166 C3P01024 1663 aa31.18■■■□□ 2.58
TRAPPC3-204ENST00000373166 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP31.16■■■□□ 2.58
TRAPPC3-204ENST00000373166 ITSN2Q9NZM3 1697 aa31.16■■■□□ 2.58
TRAPPC3-204ENST00000373166 DISP3Q9P2K9 1392 aa31.12■■■□□ 2.57
TRAPPC3-204ENST00000373166 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa31.12■■■□□ 2.57
TRAPPC3-204ENST00000373166 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP31.11■■■□□ 2.57
TRAPPC3-204ENST00000373166 FYCO1Q9BQS8 1478 aa31.1■■■□□ 2.57
TRAPPC3-204ENST00000373166 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa31.08■■■□□ 2.57
TRAPPC3-204ENST00000373166 NCOA1Q15788 1441 aa31.07■■■□□ 2.57
TRAPPC3-204ENST00000373166 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP31.07■■■□□ 2.56
TRAPPC3-204ENST00000373166 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa31.07■■■□□ 2.56
TRAPPC3-204ENST00000373166 NPATQ14207 1427 aa31.07■■■□□ 2.56
TRAPPC3-204ENST00000373166 ZMYM3Q14202 1370 aa31.05■■■□□ 2.56
TRAPPC3-204ENST00000373166 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP31.05■■■□□ 2.56
TRAPPC3-204ENST00000373166 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP31.02■■■□□ 2.56
TRAPPC3-204ENST00000373166 SYCP2Q9BX26 1530 aa31.02■■■□□ 2.56
TRAPPC3-204ENST00000373166 LTBP4Q8N2S1 1624 aa31.01■■■□□ 2.55
TRAPPC3-204ENST00000373166 ILDR2Q71H61 639 aa31■■■□□ 2.55
TRAPPC3-204ENST00000373166 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa30.99■■■□□ 2.55
TRAPPC3-204ENST00000373166 IQSEC2Q5JU85 1478 aa30.98■■■□□ 2.55
TRAPPC3-204ENST00000373166 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa30.98■■■□□ 2.55
TRAPPC3-204ENST00000373166 MROH2AA6NES4 1674 aa30.97■■■□□ 2.55
TRAPPC3-204ENST00000373166 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa30.96■■■□□ 2.55
TRAPPC3-204ENST00000373166 CCNB3Q8WWL7 1395 aa30.95■■■□□ 2.55
TRAPPC3-204ENST00000373166 ATP7AQ04656 1500 aa30.94■■■□□ 2.54
TRAPPC3-204ENST00000373166 A2MP01023 1474 aa30.94■■■□□ 2.54
TRAPPC3-204ENST00000373166 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa30.94■■■□□ 2.54
TRAPPC3-204ENST00000373166 SOCS7O14512 581 aa30.93■■■□□ 2.54
TRAPPC3-204ENST00000373166 GGT6Q6P531 493 aa30.93■■■□□ 2.54
TRAPPC3-204ENST00000373166 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP30.9■■■□□ 2.54
TRAPPC3-204ENST00000373166 MTUS2Q5JR59 1369 aa30.9■■■□□ 2.54
TRAPPC3-204ENST00000373166 PKD2Q13563 968 aa30.89■■■□□ 2.54
TRAPPC3-204ENST00000373166 PPP6R1Q9UPN7 881 aa30.89■■■□□ 2.54
TRAPPC3-204ENST00000373166 PLXNC1O60486 1568 aa30.88■■■□□ 2.53
TRAPPC3-204ENST00000373166 PTPRKQ15262 1439 aa30.86■■■□□ 2.53
TRAPPC3-204ENST00000373166 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP30.86■■■□□ 2.53
TRAPPC3-204ENST00000373166 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP30.85■■■□□ 2.53
TRAPPC3-204ENST00000373166 PLA2R1Q13018 1463 aa30.84■■■□□ 2.53
TRAPPC3-204ENST00000373166 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP30.84■■■□□ 2.53
TRAPPC3-204ENST00000373166 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa30.83■■■□□ 2.53
TRAPPC3-204ENST00000373166 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP30.8■■■□□ 2.52
TRAPPC3-204ENST00000373166 UBAP1LF5GYI3 381 aa30.8■■■□□ 2.52
TRAPPC3-204ENST00000373166 MYO3AQ8NEV4 1616 aa30.79■■■□□ 2.52
TRAPPC3-204ENST00000373166 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP30.79■■■□□ 2.52
TRAPPC3-204ENST00000373166 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP30.77■■■□□ 2.52
TRAPPC3-204ENST00000373166 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP30.76■■■□□ 2.51
TRAPPC3-204ENST00000373166 MBD5Q9P267 1494 aa30.74■■■□□ 2.51
TRAPPC3-204ENST00000373166 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa30.73■■■□□ 2.51
TRAPPC3-204ENST00000373166 ADGBQ8N7X0 1667 aa30.72■■■□□ 2.51
TRAPPC3-204ENST00000373166 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP30.71■■■□□ 2.51
TRAPPC3-204ENST00000373166 TIAM1Q13009 1591 aa30.7■■■□□ 2.5
TRAPPC3-204ENST00000373166 A2ML1A8K2U0 1454 aa30.69■■■□□ 2.5
TRAPPC3-204ENST00000373166 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa30.68■■■□□ 2.5
TRAPPC3-204ENST00000373166 CEP162Q5TB80 1403 aa30.66■■■□□ 2.5
TRAPPC3-204ENST00000373166 KIF3BO15066 747 aa30.66■■■□□ 2.5
TRAPPC3-204ENST00000373166 RSPH4AQ5TD94 716 aa30.63■■■□□ 2.49
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