RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000371748.9

LHX3-202, Transcript of LIM homeobox 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LHX3, Length 2,365 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX3-202ENST00000371748 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP28.73■■■□□ 2.19
LHX3-202ENST00000371748 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa28.73■■■□□ 2.19
LHX3-202ENST00000371748 PLEKHD1A6NEE1 506 aa28.72■■■□□ 2.19
LHX3-202ENST00000371748 ABCC5O15440 1437 aa28.72■■■□□ 2.19
LHX3-202ENST00000371748 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP28.71■■■□□ 2.19
LHX3-202ENST00000371748 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa28.69■■■□□ 2.18
LHX3-202ENST00000371748 ERCC6L2Q5T890 1561 aa28.67■■■□□ 2.18
LHX3-202ENST00000371748 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP28.65■■■□□ 2.18
LHX3-202ENST00000371748 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa28.64■■■□□ 2.18
LHX3-202ENST00000371748 ROCK1Q13464 1354 aa28.64■■■□□ 2.18
LHX3-202ENST00000371748 TRIM52Q96A61 297 aa28.64■■■□□ 2.17
LHX3-202ENST00000371748 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa28.64■■■□□ 2.17
LHX3-202ENST00000371748 ABCC10Q5T3U5 1492 aa28.62■■■□□ 2.17
LHX3-202ENST00000371748 MIER1Q8N108 512 aa28.6■■■□□ 2.17
LHX3-202ENST00000371748 CLASP1Q7Z460 1538 aa28.57■■■□□ 2.16
LHX3-202ENST00000371748 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP28.57■■■□□ 2.16
LHX3-202ENST00000371748 TONSLQ96HA7 1378 aa28.55■■■□□ 2.16
LHX3-202ENST00000371748 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP28.54■■■□□ 2.16
LHX3-202ENST00000371748 CROCC2H7BZ55 1655 aa28.54■■■□□ 2.16
LHX3-202ENST00000371748 ADGBQ8N7X0 1667 aa28.53■■■□□ 2.16
LHX3-202ENST00000371748 MPHOSPH9Q99550 1183 aa28.51■■■□□ 2.15
LHX3-202ENST00000371748 ABCC2Q92887 1545 aa28.49■■■□□ 2.15
LHX3-202ENST00000371748 NCOA1Q15788 1441 aa28.47■■■□□ 2.15
LHX3-202ENST00000371748 ADGRL2O95490 1459 aa28.44■■■□□ 2.14
LHX3-202ENST00000371748 FOXD1Q16676 465 aa28.43■■■□□ 2.14
LHX3-202ENST00000371748 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa28.42■■■□□ 2.14
LHX3-202ENST00000371748 PREX2Q70Z35 1606 aa28.4■■■□□ 2.14
LHX3-202ENST00000371748 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa28.39■■■□□ 2.14
LHX3-202ENST00000371748 KDM5BQ9UGL1 1544 aa28.38■■■□□ 2.13
LHX3-202ENST00000371748 TTC37Q6PGP7 1564 aa28.37■■■□□ 2.13
LHX3-202ENST00000371748 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa28.36■■■□□ 2.13
LHX3-202ENST00000371748 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP28.36■■■□□ 2.13
LHX3-202ENST00000371748 C9orf84Q5VXU9 1444 aa28.35■■■□□ 2.13
LHX3-202ENST00000371748 SHANK2Q9UPX8 1470 aa28.35■■■□□ 2.13
LHX3-202ENST00000371748 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP28.34■■■□□ 2.13
LHX3-202ENST00000371748 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
LHX3-202ENST00000371748 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
LHX3-202ENST00000371748 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
LHX3-202ENST00000371748 ARHGEF5Q12774 1597 aa28.32■■■□□ 2.12
LHX3-202ENST00000371748 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP28.31■■■□□ 2.12
LHX3-202ENST00000371748 MBD5Q9P267 1494 aa28.31■■■□□ 2.12
LHX3-202ENST00000371748 PZPP20742 1482 aa28.31■■■□□ 2.12
LHX3-202ENST00000371748 TSPY4P0CV99 314 aa28.3■■■□□ 2.12
LHX3-202ENST00000371748 TSPY10P0CW01 314 aa28.3■■■□□ 2.12
LHX3-202ENST00000371748 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa28.3■■■□□ 2.12
LHX3-202ENST00000371748 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa28.29■■■□□ 2.12
LHX3-202ENST00000371748 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa28.29■■■□□ 2.12
LHX3-202ENST00000371748 KCNH8Q96L42 1107 aa28.29■■■□□ 2.12
LHX3-202ENST00000371748 ARHGAP5Q13017 1502 aa28.28■■■□□ 2.12
LHX3-202ENST00000371748 MYO5CQ9NQX4 1742 aa28.27■■■□□ 2.12
LHX3-202ENST00000371748 CCDC141Q6ZP82 1450 aa28.25■■■□□ 2.11
LHX3-202ENST00000371748 SYCP2Q9BX26 1530 aa28.23■■■□□ 2.11
LHX3-202ENST00000371748 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP28.22■■■□□ 2.11
LHX3-202ENST00000371748 KIF15Q9NS87 1388 aa28.21■■■□□ 2.11
LHX3-202ENST00000371748 L3MBTL2Q969R5 705 aa28.2■■■□□ 2.1
LHX3-202ENST00000371748 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP28.18■■■□□ 2.1
LHX3-202ENST00000371748 RSPH4AQ5TD94 716 aa28.16■■■□□ 2.1
LHX3-202ENST00000371748 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa28.15■■■□□ 2.1
LHX3-202ENST00000371748 PKD2Q13563 968 aa28.14■■■□□ 2.1
LHX3-202ENST00000371748 NUP155O75694 1391 aa28.14■■■□□ 2.09
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LHX3-202ENST00000371748 PLCH2O75038 1416 aa28.11■■■□□ 2.09
LHX3-202ENST00000371748 MAST1Q9Y2H9 1570 aa28.09■■■□□ 2.09
LHX3-202ENST00000371748 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa28.09■■■□□ 2.09
LHX3-202ENST00000371748 KDM5DQ9BY66 1539 aa28.08■■■□□ 2.09
LHX3-202ENST00000371748 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa28.08■■■□□ 2.09
LHX3-202ENST00000371748 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa28.04■■■□□ 2.08
LHX3-202ENST00000371748 OSCARQ8IYS5 282 aa28.03■■■□□ 2.08
LHX3-202ENST00000371748 NBPF8Q3BBV2 869 aa28.02■■■□□ 2.08
LHX3-202ENST00000371748 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP28.01■■■□□ 2.07
LHX3-202ENST00000371748 WDR7Q9Y4E6 1490 aa28.01■■■□□ 2.07
LHX3-202ENST00000371748 ABCC1P33527 1531 aa28■■■□□ 2.07
LHX3-202ENST00000371748 PLXNC1O60486 1568 aa28■■■□□ 2.07
LHX3-202ENST00000371748 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP27.96■■■□□ 2.07
LHX3-202ENST00000371748 FAM135AQ9P2D6 1515 aa27.96■■■□□ 2.07
LHX3-202ENST00000371748 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa27.94■■■□□ 2.06
LHX3-202ENST00000371748 MYT1Q01538 1121 aa27.94■■■□□ 2.06
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LHX3-202ENST00000371748 DUOX2Q9NRD8 1548 aa27.9■■■□□ 2.06
LHX3-202ENST00000371748 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP27.89■■■□□ 2.06
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LHX3-202ENST00000371748 ASXL2Q76L83 1435 aa27.89■■■□□ 2.05
LHX3-202ENST00000371748 WASHC2AQ641Q2 1341 aa27.87■■■□□ 2.05
LHX3-202ENST00000371748 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP27.85■■■□□ 2.05
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LHX3-202ENST00000371748 ERBINQ96RT1 1412 aa27.84■■■□□ 2.05
LHX3-202ENST00000371748 IQGAP3Q86VI3 1631 aa27.83■■■□□ 2.04
LHX3-202ENST00000371748 ANP32CO43423 234 aa27.82■■■□□ 2.04
LHX3-202ENST00000371748 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP27.82■■■□□ 2.04
LHX3-202ENST00000371748 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa27.79■■■□□ 2.04
LHX3-202ENST00000371748 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa27.78■■■□□ 2.04
LHX3-202ENST00000371748 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP27.78■■■□□ 2.04
LHX3-202ENST00000371748 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP27.78■■■□□ 2.04
LHX3-202ENST00000371748 MAGI2Q86UL8 1455 aa27.77■■■□□ 2.04
LHX3-202ENST00000371748 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa27.76■■■□□ 2.03
LHX3-202ENST00000371748 ADGRL1O94910 1474 aa27.74■■■□□ 2.03
LHX3-202ENST00000371748 CCDC144AA2RUR9 1427 aa27.73■■■□□ 2.03
LHX3-202ENST00000371748 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa27.73■■■□□ 2.03
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