RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000371725.7

SDCCAG3-204, Transcript of Serologically defined colon cancer antigen 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene SDCCAG3, Length 2,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCCAG3-204ENST00000371725 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP41.47■■■■■ 4.23
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SDCCAG3-204ENST00000371725 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa41.45■■■■■ 4.23
SDCCAG3-204ENST00000371725 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP41.44■■■■■ 4.22
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SDCCAG3-204ENST00000371725 KCNH8Q96L42 1107 aa41.39■■■■■ 4.22
SDCCAG3-204ENST00000371725 TTC37Q6PGP7 1564 aa41.36■■■■■ 4.21
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SDCCAG3-204ENST00000371725 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa41.14■■■■■ 4.18
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SDCCAG3-204ENST00000371725 AKNAQ7Z591 1439 aa41.1■■■■■ 4.17
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SDCCAG3-204ENST00000371725 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.05■■■■■ 4.16
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SDCCAG3-204ENST00000371725 C9orf84Q5VXU9 1444 aa40.92■■■■■ 4.14
SDCCAG3-204ENST00000371725 ADGRL2O95490 1459 aa40.91■■■■■ 4.14
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SDCCAG3-204ENST00000371725 SHANK2Q9UPX8 1470 aa40.87■■■■■ 4.13
SDCCAG3-204ENST00000371725 CCDC141Q6ZP82 1450 aa40.87■■■■■ 4.13
SDCCAG3-204ENST00000371725 TRIM52Q96A61 297 aa40.86■■■■■ 4.13
SDCCAG3-204ENST00000371725 TSPY4P0CV99 314 aa40.85■■■■■ 4.13
SDCCAG3-204ENST00000371725 TSPY10P0CW01 314 aa40.85■■■■■ 4.13
SDCCAG3-204ENST00000371725 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa40.84■■■■■ 4.13
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SDCCAG3-204ENST00000371725 SIN3AQ96ST3 1273 aa40.83■■■■■ 4.13
SDCCAG3-204ENST00000371725 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa40.77■■■■■ 4.12
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SDCCAG3-204ENST00000371725 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa40.7■■■■■ 4.11
SDCCAG3-204ENST00000371725 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa40.69■■■■■ 4.1
SDCCAG3-204ENST00000371725 KIF15Q9NS87 1388 aa40.69■■■■■ 4.1
SDCCAG3-204ENST00000371725 MPHOSPH9Q99550 1183 aa40.66■■■■■ 4.1
SDCCAG3-204ENST00000371725 MAST1Q9Y2H9 1570 aa40.64■■■■■ 4.1
SDCCAG3-204ENST00000371725 FOXD1Q16676 465 aa40.62■■■■■ 4.09
SDCCAG3-204ENST00000371725 AFAP1Q8N556 730 aa40.6■■■■■ 4.09
SDCCAG3-204ENST00000371725 CD109Q6YHK3 1445 aa40.58■■■■■ 4.09
SDCCAG3-204ENST00000371725 ADGRL1O94910 1474 aa40.54■■■■■ 4.08
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SDCCAG3-204ENST00000371725 PLXNC1O60486 1568 aa40.5■■■■■ 4.07
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SDCCAG3-204ENST00000371725 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa40.41■■■■■ 4.06
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SDCCAG3-204ENST00000371725 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa40.35■■■■■ 4.05
SDCCAG3-204ENST00000371725 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa40.33■■■■■ 4.05
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SDCCAG3-204ENST00000371725 PKD2Q13563 968 aa40.31■■■■■ 4.04
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SDCCAG3-204ENST00000371725 KDM5DQ9BY66 1539 aa40.3■■■■■ 4.04
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SDCCAG3-204ENST00000371725 MYT1LQ9UL68 1186 aa40.3■■■■■ 4.04
SDCCAG3-204ENST00000371725 DIP2BQ9P265 1576 aa40.29■■■■■ 4.04
SDCCAG3-204ENST00000371725 GLI2P10070 1586 aa40.28■■■■■ 4.04
SDCCAG3-204ENST00000371725 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP40.27■■■■■ 4.043e-7■■□□□ 12.6
SDCCAG3-204ENST00000371725 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa40.26■■■■■ 4.04
SDCCAG3-204ENST00000371725 UNC13BO14795 1591 aa40.25■■■■■ 4.03
SDCCAG3-204ENST00000371725 ERBINQ96RT1 1412 aa40.24■■■■■ 4.03
SDCCAG3-204ENST00000371725 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa40.22■■■■■ 4.03
SDCCAG3-204ENST00000371725 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP40.22■■■■■ 4.03
SDCCAG3-204ENST00000371725 FAM135AQ9P2D6 1515 aa40.22■■■■■ 4.03
SDCCAG3-204ENST00000371725 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa40.22■■■■■ 4.03
SDCCAG3-204ENST00000371725 POGZQ7Z3K3 1410 aa40.21■■■■■ 4.03
SDCCAG3-204ENST00000371725 NEO1Q92859 1461 aa40.19■■■■■ 4.03
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