RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369862.1

AMIGO1-201, Transcript of adhesion molecule with Ig like domain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene AMIGO1, Length 2,229 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMIGO1-201ENST00000369862 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP33.93■■■■□ 3.02
AMIGO1-201ENST00000369862 KDM5BQ9UGL1 1544 aa33.92■■■■□ 3.02
AMIGO1-201ENST00000369862 ABCC5O15440 1437 aa33.92■■■■□ 3.02
AMIGO1-201ENST00000369862 TRIM52Q96A61 297 aa33.89■■■■□ 3.02
AMIGO1-201ENST00000369862 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP33.89■■■■□ 3.02
AMIGO1-201ENST00000369862 ROCK1Q13464 1354 aa33.88■■■■□ 3.01
AMIGO1-201ENST00000369862 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP33.87■■■■□ 3.01
AMIGO1-201ENST00000369862 KIF14Q15058 1648 aa33.85■■■■□ 3.01
AMIGO1-201ENST00000369862 ADCY10Q96PN6 1610 aa33.84■■■■□ 3.01
AMIGO1-201ENST00000369862 MPHOSPH9Q99550 1183 aa33.81■■■■□ 3
AMIGO1-201ENST00000369862 ITSN2Q9NZM3 1697 aa33.81■■■■□ 3
AMIGO1-201ENST00000369862 KCNH8Q96L42 1107 aa33.81■■■■□ 3
AMIGO1-201ENST00000369862 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP33.8■■■■□ 3
AMIGO1-201ENST00000369862 ABCA8O94911 1581 aa33.79■■■■□ 3
AMIGO1-201ENST00000369862 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa33.79■■■■□ 3
AMIGO1-201ENST00000369862 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP33.75■■■□□ 2.99
AMIGO1-201ENST00000369862 FOXD1Q16676 465 aa33.7■■■□□ 2.99
AMIGO1-201ENST00000369862 ATP10BO94823 1461 aa33.68■■■□□ 2.98
AMIGO1-201ENST00000369862 ADGBQ8N7X0 1667 aa33.65■■■□□ 2.98
AMIGO1-201ENST00000369862 CROCC2H7BZ55 1655 aa33.64■■■□□ 2.98
AMIGO1-201ENST00000369862 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP33.63■■■□□ 2.97
AMIGO1-201ENST00000369862 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa33.63■■■□□ 2.97
AMIGO1-201ENST00000369862 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa33.63■■■□□ 2.97
AMIGO1-201ENST00000369862 NCOA1Q15788 1441 aa33.63■■■□□ 2.97
AMIGO1-201ENST00000369862 PLEKHD1A6NEE1 506 aa33.61■■■□□ 2.97
AMIGO1-201ENST00000369862 ABCC10Q5T3U5 1492 aa33.61■■■□□ 2.97
AMIGO1-201ENST00000369862 CCER2I3L3R5 266 aa33.6■■■□□ 2.97
AMIGO1-201ENST00000369862 ADGRL2O95490 1459 aa33.59■■■□□ 2.97
AMIGO1-201ENST00000369862 CHD1O14646 1710 aa33.59■■■□□ 2.97
AMIGO1-201ENST00000369862 L3MBTL2Q969R5 705 aa33.57■■■□□ 2.96
AMIGO1-201ENST00000369862 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa33.56■■■□□ 2.96
AMIGO1-201ENST00000369862 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP33.56■■■□□ 2.96
AMIGO1-201ENST00000369862 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP33.55■■■□□ 2.96
AMIGO1-201ENST00000369862 PZPP20742 1482 aa33.54■■■□□ 2.96
AMIGO1-201ENST00000369862 PTPRGP23470 1445 aa33.53■■■□□ 2.96
AMIGO1-201ENST00000369862 ANP32CO43423 234 aa33.51■■■□□ 2.96
AMIGO1-201ENST00000369862 TEX14Q8IWB6 1497 aa33.48■■■□□ 2.95
AMIGO1-201ENST00000369862 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP33.47■■■□□ 2.95
AMIGO1-201ENST00000369862 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa33.47■■■□□ 2.95
AMIGO1-201ENST00000369862 SHROOM2Q13796 1616 aa33.43■■■□□ 2.94
AMIGO1-201ENST00000369862 SHANK2Q9UPX8 1470 aa33.42■■■□□ 2.94
AMIGO1-201ENST00000369862 FKBP8Q14318 412 aa33.4■■■□□ 2.94
AMIGO1-201ENST00000369862 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa33.39■■■□□ 2.94
AMIGO1-201ENST00000369862 C9orf84Q5VXU9 1444 aa33.39■■■□□ 2.94
AMIGO1-201ENST00000369862 WASHC2AQ641Q2 1341 aa33.39■■■□□ 2.94
AMIGO1-201ENST00000369862 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP33.38■■■□□ 2.93
AMIGO1-201ENST00000369862 NBPF8Q3BBV2 869 aa33.38■■■□□ 2.93
AMIGO1-201ENST00000369862 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa33.35■■■□□ 2.93
AMIGO1-201ENST00000369862 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa33.32■■■□□ 2.92
AMIGO1-201ENST00000369862 ARHGEF5Q12774 1597 aa33.32■■■□□ 2.92
AMIGO1-201ENST00000369862 ERCC6L2Q5T890 1561 aa33.31■■■□□ 2.92
AMIGO1-201ENST00000369862 NEFLP07196 543 aa33.3■■■□□ 2.92
AMIGO1-201ENST00000369862 PREX2Q70Z35 1606 aa33.3■■■□□ 2.92
AMIGO1-201ENST00000369862 MBD5Q9P267 1494 aa33.3■■■□□ 2.92
AMIGO1-201ENST00000369862 BCANQ96GW7 911 aa33.3■■■□□ 2.92
AMIGO1-201ENST00000369862 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa33.29■■■□□ 2.92
AMIGO1-201ENST00000369862 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP33.29■■■□□ 2.92
AMIGO1-201ENST00000369862 PKD2Q13563 968 aa33.28■■■□□ 2.92
AMIGO1-201ENST00000369862 TSPY4P0CV99 314 aa33.26■■■□□ 2.91
AMIGO1-201ENST00000369862 TSPY10P0CW01 314 aa33.26■■■□□ 2.91
AMIGO1-201ENST00000369862 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP33.22■■■□□ 2.91
AMIGO1-201ENST00000369862 NUP155O75694 1391 aa33.22■■■□□ 2.91
AMIGO1-201ENST00000369862 KIF15Q9NS87 1388 aa33.21■■■□□ 2.91
AMIGO1-201ENST00000369862 TTC37Q6PGP7 1564 aa33.2■■■□□ 2.91
AMIGO1-201ENST00000369862 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa33.2■■■□□ 2.91
AMIGO1-201ENST00000369862 KDM5DQ9BY66 1539 aa33.2■■■□□ 2.91
AMIGO1-201ENST00000369862 ABCC2Q92887 1545 aa33.2■■■□□ 2.9
AMIGO1-201ENST00000369862 CCDC141Q6ZP82 1450 aa33.19■■■□□ 2.9
AMIGO1-201ENST00000369862 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP33.17■■■□□ 2.9
AMIGO1-201ENST00000369862 CCDC7Q96M83 1385 aa33.17■■■□□ 2.9
AMIGO1-201ENST00000369862 CNTLNQ9NXG0 1405 aa33.16■■■□□ 2.9
AMIGO1-201ENST00000369862 SYCP2Q9BX26 1530 aa33.12■■■□□ 2.89
AMIGO1-201ENST00000369862 ARHGAP5Q13017 1502 aa33.1■■■□□ 2.89
AMIGO1-201ENST00000369862 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP33.1■■■□□ 2.89
AMIGO1-201ENST00000369862 CLASP1Q7Z460 1538 aa33.1■■■□□ 2.89
AMIGO1-201ENST00000369862 RSPH4AQ5TD94 716 aa33.08■■■□□ 2.89
AMIGO1-201ENST00000369862 ANP32EQ9BTT0 268 aa33.06■■■□□ 2.88
AMIGO1-201ENST00000369862 MYO5CQ9NQX4 1742 aa33.05■■■□□ 2.88
AMIGO1-201ENST00000369862 KIF7Q2M1P5 1343 aa33.04■■■□□ 2.88
AMIGO1-201ENST00000369862 MAST1Q9Y2H9 1570 aa33.03■■■□□ 2.88
AMIGO1-201ENST00000369862 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP33■■■□□ 2.87
AMIGO1-201ENST00000369862 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP33■■■□□ 2.87
AMIGO1-201ENST00000369862 FAM135AQ9P2D6 1515 aa33■■■□□ 2.87
AMIGO1-201ENST00000369862 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa32.99■■■□□ 2.87
AMIGO1-201ENST00000369862 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa32.97■■■□□ 2.87
AMIGO1-201ENST00000369862 USP47Q96K76 1375 aa32.96■■■□□ 2.87
AMIGO1-201ENST00000369862 KDM5CP41229 1560 aa32.95■■■□□ 2.87
AMIGO1-201ENST00000369862 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa32.95■■■□□ 2.87
AMIGO1-201ENST00000369862 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP32.95■■■□□ 2.87
AMIGO1-201ENST00000369862 BCORL1Q5H9F3 1711 aa32.94■■■□□ 2.86
AMIGO1-201ENST00000369862 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa32.93■■■□□ 2.86
AMIGO1-201ENST00000369862 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP32.93■■■□□ 2.86
AMIGO1-201ENST00000369862 RALGAPBQ86X10 1494 aa32.92■■■□□ 2.86
AMIGO1-201ENST00000369862 UNC13BO14795 1591 aa32.92■■■□□ 2.86
AMIGO1-201ENST00000369862 PLXNC1O60486 1568 aa32.92■■■□□ 2.86
AMIGO1-201ENST00000369862 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP32.9■■■□□ 2.86
AMIGO1-201ENST00000369862 CCDC184Q52MB2 194 aa32.9■■■□□ 2.86
AMIGO1-201ENST00000369862 PLCH2O75038 1416 aa32.89■■■□□ 2.85
AMIGO1-201ENST00000369862 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa32.81■■■□□ 2.84
AMIGO1-201ENST00000369862 DCAF11Q8TEB1 546 aa32.8■■■□□ 2.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.6 ms