RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356455.8

UBE2C-204, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 C, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2C, Length 850 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2C-204ENST00000356455 EEA1Q15075 1411 aa30.88■■■□□ 2.53
UBE2C-204ENST00000356455 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP30.84■■■□□ 2.53
UBE2C-204ENST00000356455 PLCH2O75038 1416 aa30.82■■■□□ 2.52
UBE2C-204ENST00000356455 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP30.8■■■□□ 2.52
UBE2C-204ENST00000356455 ATP10AO60312 1499 aa30.8■■■□□ 2.52
UBE2C-204ENST00000356455 C9orf84Q5VXU9 1444 aa30.78■■■□□ 2.52
UBE2C-204ENST00000356455 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP30.77■■■□□ 2.52
UBE2C-204ENST00000356455 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa30.77■■■□□ 2.52
UBE2C-204ENST00000356455 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa30.76■■■□□ 2.51
UBE2C-204ENST00000356455 PREX1Q8TCU6 1659 aa30.74■■■□□ 2.51
UBE2C-204ENST00000356455 MYT1LQ9UL68 1186 aa30.71■■■□□ 2.51
UBE2C-204ENST00000356455 DMRT2Q9Y5R5 561 aa30.71■■■□□ 2.51
UBE2C-204ENST00000356455 MYO5CQ9NQX4 1742 aa30.69■■■□□ 2.5
UBE2C-204ENST00000356455 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP30.68■■■□□ 2.5
UBE2C-204ENST00000356455 DISP3Q9P2K9 1392 aa30.67■■■□□ 2.5
UBE2C-204ENST00000356455 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa30.64■■■□□ 2.5
UBE2C-204ENST00000356455 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa30.64■■■□□ 2.5
UBE2C-204ENST00000356455 EHMT2Q96KQ7 1210 aa30.64■■■□□ 2.5
UBE2C-204ENST00000356455 AFAP1Q8N556 730 aa30.62■■■□□ 2.49
UBE2C-204ENST00000356455 FMN1Q68DA7 1419 aa30.62■■■□□ 2.49
UBE2C-204ENST00000356455 ARHGAP5Q13017 1502 aa30.61■■■□□ 2.49
UBE2C-204ENST00000356455 STRCQ7RTU9 1775 aa30.59■■■□□ 2.49
UBE2C-204ENST00000356455 KIF14Q15058 1648 aa30.59■■■□□ 2.49
UBE2C-204ENST00000356455 UBTFP17480 764 aaKnown RBP30.59■■■□□ 2.49
UBE2C-204ENST00000356455 ILDR2Q71H61 639 aa30.57■■■□□ 2.48
UBE2C-204ENST00000356455 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP30.55■■■□□ 2.48
UBE2C-204ENST00000356455 KDM5CP41229 1560 aa30.54■■■□□ 2.48
UBE2C-204ENST00000356455 CLIP1P30622 1438 aa30.54■■■□□ 2.48
UBE2C-204ENST00000356455 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP30.54■■■□□ 2.48
UBE2C-204ENST00000356455 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP30.53■■■□□ 2.48
UBE2C-204ENST00000356455 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa30.52■■■□□ 2.48
UBE2C-204ENST00000356455 SOCS7O14512 581 aa30.51■■■□□ 2.47
UBE2C-204ENST00000356455 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa30.49■■■□□ 2.47
UBE2C-204ENST00000356455 PTPRTO14522 1441 aa30.47■■■□□ 2.47
UBE2C-204ENST00000356455 REREQ9P2R6 1566 aa30.46■■■□□ 2.47
UBE2C-204ENST00000356455 C3P01024 1663 aa30.46■■■□□ 2.47
UBE2C-204ENST00000356455 ABCA6Q8N139 1617 aa30.45■■■□□ 2.47
UBE2C-204ENST00000356455 MLH3Q9UHC1 1453 aa30.44■■■□□ 2.46
UBE2C-204ENST00000356455 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa30.4■■■□□ 2.46
UBE2C-204ENST00000356455 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa30.39■■■□□ 2.46
UBE2C-204ENST00000356455 AGLP35573 1532 aa30.39■■■□□ 2.46
UBE2C-204ENST00000356455 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa30.39■■■□□ 2.46
UBE2C-204ENST00000356455 ABCC1P33527 1531 aa30.35■■■□□ 2.45
UBE2C-204ENST00000356455 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa30.34■■■□□ 2.45
UBE2C-204ENST00000356455 CNTLNQ9NXG0 1405 aa30.34■■■□□ 2.45
UBE2C-204ENST00000356455 PREX2Q70Z35 1606 aa30.33■■■□□ 2.45
UBE2C-204ENST00000356455 LTBP4Q8N2S1 1624 aa30.33■■■□□ 2.45
UBE2C-204ENST00000356455 NCOA1Q15788 1441 aa30.32■■■□□ 2.44
UBE2C-204ENST00000356455 ITSN2Q9NZM3 1697 aa30.32■■■□□ 2.44
UBE2C-204ENST00000356455 IQSEC2Q5JU85 1478 aa30.29■■■□□ 2.44
UBE2C-204ENST00000356455 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa30.27■■■□□ 2.44
UBE2C-204ENST00000356455 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP30.25■■■□□ 2.43
UBE2C-204ENST00000356455 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa30.25■■■□□ 2.43
UBE2C-204ENST00000356455 CCDC18Q5T9S5 1454 aa30.25■■■□□ 2.43
UBE2C-204ENST00000356455 NPATQ14207 1427 aa30.22■■■□□ 2.43
UBE2C-204ENST00000356455 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa30.21■■■□□ 2.43
UBE2C-204ENST00000356455 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa30.21■■■□□ 2.43
UBE2C-204ENST00000356455 ZMYM3Q14202 1370 aa30.2■■■□□ 2.43
UBE2C-204ENST00000356455 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa30.19■■■□□ 2.42
UBE2C-204ENST00000356455 MROH2AA6NES4 1674 aa30.18■■■□□ 2.42
UBE2C-204ENST00000356455 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa30.18■■■□□ 2.42
UBE2C-204ENST00000356455 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP30.18■■■□□ 2.42
UBE2C-204ENST00000356455 UBAP1LF5GYI3 381 aa30.16■■■□□ 2.42
UBE2C-204ENST00000356455 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP30.16■■■□□ 2.42
UBE2C-204ENST00000356455 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP30.13■■■□□ 2.41
UBE2C-204ENST00000356455 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP30.13■■■□□ 2.41
UBE2C-204ENST00000356455 SYCP2Q9BX26 1530 aa30.12■■■□□ 2.41
UBE2C-204ENST00000356455 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP30.09■■■□□ 2.41
UBE2C-204ENST00000356455 PKD2Q13563 968 aa30.09■■■□□ 2.41
UBE2C-204ENST00000356455 GGT6Q6P531 493 aa30.07■■■□□ 2.4
UBE2C-204ENST00000356455 MYO3AQ8NEV4 1616 aa30.06■■■□□ 2.4
UBE2C-204ENST00000356455 ATP7AQ04656 1500 aa30.06■■■□□ 2.4
UBE2C-204ENST00000356455 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP30.06■■■□□ 2.4
UBE2C-204ENST00000356455 PLA2R1Q13018 1463 aa30.05■■■□□ 2.4
UBE2C-204ENST00000356455 A2MP01023 1474 aa30.04■■■□□ 2.4
UBE2C-204ENST00000356455 FYCO1Q9BQS8 1478 aa30.04■■■□□ 2.4
UBE2C-204ENST00000356455 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP30.03■■■□□ 2.4
UBE2C-204ENST00000356455 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP30.02■■■□□ 2.4
UBE2C-204ENST00000356455 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP30.02■■■□□ 2.4
UBE2C-204ENST00000356455 PTPRKQ15262 1439 aa30.02■■■□□ 2.4
UBE2C-204ENST00000356455 CHIC1Q5VXU3 224 aa30.01■■■□□ 2.39
UBE2C-204ENST00000356455 PPP6R1Q9UPN7 881 aa30.01■■■□□ 2.39
UBE2C-204ENST00000356455 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa30■■■□□ 2.39
UBE2C-204ENST00000356455 PLXNC1O60486 1568 aa29.99■■■□□ 2.39
UBE2C-204ENST00000356455 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa29.99■■■□□ 2.39
UBE2C-204ENST00000356455 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP29.99■■■□□ 2.39
UBE2C-204ENST00000356455 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP29.98■■■□□ 2.39
UBE2C-204ENST00000356455 CCNB3Q8WWL7 1395 aa29.97■■■□□ 2.39
UBE2C-204ENST00000356455 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP29.96■■■□□ 2.39
UBE2C-204ENST00000356455 PIP4K2BP78356 416 aa29.89■■■□□ 2.38
UBE2C-204ENST00000356455 A2ML1A8K2U0 1454 aa29.88■■■□□ 2.37
UBE2C-204ENST00000356455 ADGBQ8N7X0 1667 aa29.88■■■□□ 2.37
UBE2C-204ENST00000356455 MTUS2Q5JR59 1369 aa29.87■■■□□ 2.37
UBE2C-204ENST00000356455 HSPA1LP34931 641 aa29.85■■■□□ 2.37
UBE2C-204ENST00000356455 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP29.85■■■□□ 2.37
UBE2C-204ENST00000356455 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP29.83■■■□□ 2.37
UBE2C-204ENST00000356455 TOM1O60784 492 aa29.83■■■□□ 2.37
UBE2C-204ENST00000356455 TNRQ92752 1358 aa29.79■■■□□ 2.36
UBE2C-204ENST00000356455 CPS1P31327 1500 aa29.78■■■□□ 2.36
UBE2C-204ENST00000356455 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP29.78■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.3 ms