RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000344079.9

LRRC27-201, Transcript of leucine rich repeat containing 27, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene LRRC27, Length 1,809 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC27-201ENST00000344079 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP27.3■■□□□ 1.96
LRRC27-201ENST00000344079 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
LRRC27-201ENST00000344079 DAPK1P53355 1430 aa27.29■■□□□ 1.96
LRRC27-201ENST00000344079 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP27.25■■□□□ 1.95
LRRC27-201ENST00000344079 ABCC5O15440 1437 aa27.25■■□□□ 1.95
LRRC27-201ENST00000344079 NAIPQ13075 1403 aa27.25■■□□□ 1.95
LRRC27-201ENST00000344079 AKNAQ7Z591 1439 aa27.25■■□□□ 1.95
LRRC27-201ENST00000344079 CLSPNQ9HAW4 1339 aa27.25■■□□□ 1.95
LRRC27-201ENST00000344079 TTC37Q6PGP7 1564 aa27.24■■□□□ 1.95
LRRC27-201ENST00000344079 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP27.24■■□□□ 1.95
LRRC27-201ENST00000344079 PREX2Q70Z35 1606 aa27.24■■□□□ 1.95
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LRRC27-201ENST00000344079 KCNH8Q96L42 1107 aa27.2■■□□□ 1.94
LRRC27-201ENST00000344079 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa27.19■■□□□ 1.94
LRRC27-201ENST00000344079 GCC2Q8IWJ2 1684 aa27.19■■□□□ 1.94
LRRC27-201ENST00000344079 ROCK1Q13464 1354 aa27.18■■□□□ 1.94
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LRRC27-201ENST00000344079 WDR7Q9Y4E6 1490 aa27.17■■□□□ 1.94
LRRC27-201ENST00000344079 ASXL2Q76L83 1435 aa27.16■■□□□ 1.94
LRRC27-201ENST00000344079 MYO5CQ9NQX4 1742 aa27.16■■□□□ 1.94
LRRC27-201ENST00000344079 CROCC2H7BZ55 1655 aa27.14■■□□□ 1.94
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LRRC27-201ENST00000344079 ARHGEF5Q12774 1597 aa27.08■■□□□ 1.93
LRRC27-201ENST00000344079 ADGBQ8N7X0 1667 aa27.08■■□□□ 1.93
LRRC27-201ENST00000344079 PLCH2O75038 1416 aa27.08■■□□□ 1.93
LRRC27-201ENST00000344079 SHANK2Q9UPX8 1470 aa27.07■■□□□ 1.92
LRRC27-201ENST00000344079 ADGRL2O95490 1459 aa27.07■■□□□ 1.92
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LRRC27-201ENST00000344079 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa27■■□□□ 1.91
LRRC27-201ENST00000344079 RSPH4AQ5TD94 716 aa27■■□□□ 1.91
LRRC27-201ENST00000344079 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa26.99■■□□□ 1.91
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LRRC27-201ENST00000344079 TSPY10P0CW01 314 aa26.98■■□□□ 1.91
LRRC27-201ENST00000344079 DIP2BQ9P265 1576 aa26.96■■□□□ 1.91
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LRRC27-201ENST00000344079 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa26.91■■□□□ 1.9
LRRC27-201ENST00000344079 MAST1Q9Y2H9 1570 aa26.9■■□□□ 1.9
LRRC27-201ENST00000344079 KIF13AQ9H1H9 1805 aa26.89■■□□□ 1.9
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LRRC27-201ENST00000344079 GLI2P10070 1586 aa26.87■■□□□ 1.89
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LRRC27-201ENST00000344079 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa26.8■■□□□ 1.88
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LRRC27-201ENST00000344079 CD109Q6YHK3 1445 aa26.8■■□□□ 1.88
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LRRC27-201ENST00000344079 NEUROD1Q13562 356 aa26.76■■□□□ 1.88
LRRC27-201ENST00000344079 ADGRL1O94910 1474 aa26.75■■□□□ 1.87
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LRRC27-201ENST00000344079 CFAP74Q9C0B2 1584 aa26.72■■□□□ 1.87
LRRC27-201ENST00000344079 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa26.72■■□□□ 1.87
LRRC27-201ENST00000344079 SCAPERQ9BY12 1400 aa26.71■■□□□ 1.87
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LRRC27-201ENST00000344079 AFAP1Q8N556 730 aa26.69■■□□□ 1.86
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LRRC27-201ENST00000344079 KDM5DQ9BY66 1539 aa26.68■■□□□ 1.86
LRRC27-201ENST00000344079 NUP155O75694 1391 aa26.65■■□□□ 1.86
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LRRC27-201ENST00000344079 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
LRRC27-201ENST00000344079 PKD2Q13563 968 aa26.56■■□□□ 1.84
LRRC27-201ENST00000344079 POGZQ7Z3K3 1410 aa26.56■■□□□ 1.84
LRRC27-201ENST00000344079 FAM135AQ9P2D6 1515 aa26.54■■□□□ 1.84
LRRC27-201ENST00000344079 KDM5CP41229 1560 aa26.53■■□□□ 1.84
LRRC27-201ENST00000344079 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
LRRC27-201ENST00000344079 MAGI2Q86UL8 1455 aa26.52■■□□□ 1.84
LRRC27-201ENST00000344079 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
LRRC27-201ENST00000344079 MYT1LQ9UL68 1186 aa26.51■■□□□ 1.83
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