RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000337221.8

SCARA3-202, Transcript of scavenger receptor class A member 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCARA3, Length 1,910 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARA3-202ENST00000337221 CHIC2Q9UKJ5 165 aa41.3■■■■■ 4.2
SCARA3-202ENST00000337221 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP41.25■■■■■ 4.19
SCARA3-202ENST00000337221 OSCARQ8IYS5 282 aa41.25■■■■■ 4.19
SCARA3-202ENST00000337221 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa41.24■■■■■ 4.19
SCARA3-202ENST00000337221 KDM5BQ9UGL1 1544 aa41.24■■■■■ 4.19
SCARA3-202ENST00000337221 ROCK1Q13464 1354 aa41.24■■■■■ 4.19
SCARA3-202ENST00000337221 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP41.16■■■■■ 4.18
SCARA3-202ENST00000337221 CROCC2H7BZ55 1655 aa41.15■■■■■ 4.18
SCARA3-202ENST00000337221 PREX2Q70Z35 1606 aa41.15■■■■■ 4.18
SCARA3-202ENST00000337221 KDM6BO15054 1643 aa41.14■■■■■ 4.18
SCARA3-202ENST00000337221 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa41.12■■■■■ 4.17
SCARA3-202ENST00000337221 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP41.12■■■■■ 4.17
SCARA3-202ENST00000337221 TTC37Q6PGP7 1564 aa41.11■■■■■ 4.17
SCARA3-202ENST00000337221 ADGBQ8N7X0 1667 aa41.08■■■■■ 4.17
SCARA3-202ENST00000337221 ADGRL2O95490 1459 aa41.04■■■■■ 4.16
SCARA3-202ENST00000337221 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa41.01■■■■■ 4.16
SCARA3-202ENST00000337221 MYO5CQ9NQX4 1742 aa40.99■■■■■ 4.15
SCARA3-202ENST00000337221 ARHGEF5Q12774 1597 aa40.99■■■■■ 4.15
SCARA3-202ENST00000337221 NCOA1Q15788 1441 aa40.99■■■■■ 4.15
SCARA3-202ENST00000337221 SHANK2Q9UPX8 1470 aa40.98■■■■■ 4.15
SCARA3-202ENST00000337221 SIN3AQ96ST3 1273 aa40.94■■■■■ 4.14
SCARA3-202ENST00000337221 MBD5Q9P267 1494 aa40.94■■■■■ 4.14
SCARA3-202ENST00000337221 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP40.93■■■■■ 4.14
SCARA3-202ENST00000337221 KCNH8Q96L42 1107 aa40.93■■■■■ 4.14
SCARA3-202ENST00000337221 ARHGAP5Q13017 1502 aa40.91■■■■■ 4.14
SCARA3-202ENST00000337221 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP40.9■■■■■ 4.14
SCARA3-202ENST00000337221 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa40.88■■■■■ 4.13
SCARA3-202ENST00000337221 C9orf84Q5VXU9 1444 aa40.88■■■■■ 4.13
SCARA3-202ENST00000337221 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP40.87■■■■■ 4.13
SCARA3-202ENST00000337221 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP40.85■■■■■ 4.13
SCARA3-202ENST00000337221 TRIM52Q96A61 297 aa40.85■■■■■ 4.13
SCARA3-202ENST00000337221 NEUROD1Q13562 356 aa40.83■■■■■ 4.13
SCARA3-202ENST00000337221 WDR7Q9Y4E6 1490 aa40.83■■■■■ 4.13
SCARA3-202ENST00000337221 PLCH2O75038 1416 aa40.83■■■■■ 4.13
SCARA3-202ENST00000337221 CCDC141Q6ZP82 1450 aa40.83■■■■■ 4.13
SCARA3-202ENST00000337221 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa40.81■■■■■ 4.12
SCARA3-202ENST00000337221 SYCP2Q9BX26 1530 aa40.8■■■■■ 4.12
SCARA3-202ENST00000337221 RSPH4AQ5TD94 716 aa40.78■■■■■ 4.12
SCARA3-202ENST00000337221 TSPY4P0CV99 314 aa40.77■■■■■ 4.12
SCARA3-202ENST00000337221 TSPY10P0CW01 314 aa40.77■■■■■ 4.12
SCARA3-202ENST00000337221 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa40.77■■■■■ 4.12
SCARA3-202ENST00000337221 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa40.75■■■■■ 4.11
SCARA3-202ENST00000337221 MPHOSPH9Q99550 1183 aa40.75■■■■■ 4.11
SCARA3-202ENST00000337221 ARAP3Q8WWN8 1544 aa40.71■■■■■ 4.11
SCARA3-202ENST00000337221 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa40.7■■■■■ 4.11
SCARA3-202ENST00000337221 MAST1Q9Y2H9 1570 aa40.7■■■■■ 4.11
SCARA3-202ENST00000337221 ASXL2Q76L83 1435 aa40.69■■■■■ 4.1
SCARA3-202ENST00000337221 ABCA9Q8IUA7 1624 aa40.65■■■■■ 4.1
SCARA3-202ENST00000337221 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa40.65■■■■■ 4.1
SCARA3-202ENST00000337221 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa40.65■■■■■ 4.1
SCARA3-202ENST00000337221 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP40.63■■■■■ 4.09
SCARA3-202ENST00000337221 KIF15Q9NS87 1388 aa40.63■■■■■ 4.09
SCARA3-202ENST00000337221 PZPP20742 1482 aa40.63■■■■■ 4.09
SCARA3-202ENST00000337221 ABCC1P33527 1531 aa40.62■■■■■ 4.09
SCARA3-202ENST00000337221 TONSLQ96HA7 1378 aa40.57■■■■■ 4.09
SCARA3-202ENST00000337221 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP40.55■■■■■ 4.08
SCARA3-202ENST00000337221 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP40.55■■■■■ 4.08
SCARA3-202ENST00000337221 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP40.54■■■■■ 4.08
SCARA3-202ENST00000337221 PLXNC1O60486 1568 aa40.52■■■■■ 4.08
SCARA3-202ENST00000337221 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa40.51■■■■■ 4.08
SCARA3-202ENST00000337221 FOXD1Q16676 465 aa40.5■■■■■ 4.07
SCARA3-202ENST00000337221 KDM5DQ9BY66 1539 aa40.48■■■■■ 4.07
SCARA3-202ENST00000337221 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa40.45■■■■■ 4.07
SCARA3-202ENST00000337221 FANCAO15360 1455 aa40.44■■■■■ 4.06
SCARA3-202ENST00000337221 NUP155O75694 1391 aa40.39■■■■■ 4.06
SCARA3-202ENST00000337221 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP40.36■■■■■ 4.05
SCARA3-202ENST00000337221 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.36■■■■■ 4.05
SCARA3-202ENST00000337221 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.36■■■■■ 4.05
SCARA3-202ENST00000337221 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.36■■■■■ 4.05
SCARA3-202ENST00000337221 DUOX2Q9NRD8 1548 aa40.35■■■■■ 4.05
SCARA3-202ENST00000337221 UNC13BO14795 1591 aa40.31■■■■■ 4.04
SCARA3-202ENST00000337221 PKD2Q13563 968 aa40.31■■■■■ 4.04
SCARA3-202ENST00000337221 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa40.3■■■■■ 4.04
SCARA3-202ENST00000337221 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa40.27■■■■■ 4.04
SCARA3-202ENST00000337221 ADGRL1O94910 1474 aa40.27■■■■■ 4.04
SCARA3-202ENST00000337221 AFAP1Q8N556 730 aa40.26■■■■■ 4.04
SCARA3-202ENST00000337221 ERBINQ96RT1 1412 aa40.26■■■■■ 4.03
SCARA3-202ENST00000337221 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP40.25■■■■■ 4.03
SCARA3-202ENST00000337221 FAM135AQ9P2D6 1515 aa40.23■■■■■ 4.03
SCARA3-202ENST00000337221 SCAPERQ9BY12 1400 aa40.22■■■■■ 4.03
SCARA3-202ENST00000337221 CD109Q6YHK3 1445 aa40.22■■■■■ 4.03
SCARA3-202ENST00000337221 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.21■■■■■ 4.03
SCARA3-202ENST00000337221 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP40.21■■■■■ 4.03
SCARA3-202ENST00000337221 TEX14Q8IWB6 1497 aa40.2■■■■■ 4.03
SCARA3-202ENST00000337221 L3MBTL2Q969R5 705 aa40.18■■■■■ 4.02
SCARA3-202ENST00000337221 CFAP74Q9C0B2 1584 aa40.18■■■■■ 4.02
SCARA3-202ENST00000337221 MAGI2Q86UL8 1455 aa40.16■■■■■ 4.02
SCARA3-202ENST00000337221 ATP7AQ04656 1500 aa40.15■■■■■ 4.02
SCARA3-202ENST00000337221 IQGAP3Q86VI3 1631 aa40.15■■■■■ 4.02
SCARA3-202ENST00000337221 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa40.03■■■■■ 4
SCARA3-202ENST00000337221 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP40.02■■■■■ 4
SCARA3-202ENST00000337221 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa39.99■■■■□ 3.99
SCARA3-202ENST00000337221 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa39.99■■■■□ 3.99
SCARA3-202ENST00000337221 NEO1Q92859 1461 aa39.98■■■■□ 3.99
SCARA3-202ENST00000337221 GLI2P10070 1586 aa39.98■■■■□ 3.99
SCARA3-202ENST00000337221 POGZQ7Z3K3 1410 aa39.97■■■■□ 3.99
SCARA3-202ENST00000337221 KDM5CP41229 1560 aa39.97■■■■□ 3.99
SCARA3-202ENST00000337221 DEPDC5O75140 1603 aa39.96■■■■□ 3.99
SCARA3-202ENST00000337221 MIER1Q8N108 512 aa39.95■■■■□ 3.99
SCARA3-202ENST00000337221 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP39.91■■■■□ 3.98
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