RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331803.8

UPP1-201, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UPP1, Length 1,932 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-201ENST00000331803 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP28.28■■■□□ 2.12
UPP1-201ENST00000331803 ABCC5O15440 1437 aa28.27■■■□□ 2.12
UPP1-201ENST00000331803 AKNAQ7Z591 1439 aa28.25■■■□□ 2.11
UPP1-201ENST00000331803 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa28.25■■■□□ 2.11
UPP1-201ENST00000331803 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP28.2■■■□□ 2.1
UPP1-201ENST00000331803 ROCK1Q13464 1354 aa28.2■■■□□ 2.1
UPP1-201ENST00000331803 KCNH8Q96L42 1107 aa28.2■■■□□ 2.1
UPP1-201ENST00000331803 GCC2Q8IWJ2 1684 aa28.18■■■□□ 2.1
UPP1-201ENST00000331803 MAPKBP1O60336 1514 aa28.17■■■□□ 2.1
UPP1-201ENST00000331803 TTC37Q6PGP7 1564 aa28.17■■■□□ 2.1
UPP1-201ENST00000331803 PREX2Q70Z35 1606 aa28.16■■■□□ 2.1
UPP1-201ENST00000331803 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa28.14■■■□□ 2.1
UPP1-201ENST00000331803 CROCC2H7BZ55 1655 aa28.09■■■□□ 2.09
UPP1-201ENST00000331803 MYO5CQ9NQX4 1742 aa28.07■■■□□ 2.08
UPP1-201ENST00000331803 ARHGAP5Q13017 1502 aa28.07■■■□□ 2.08
UPP1-201ENST00000331803 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa28.07■■■□□ 2.08
UPP1-201ENST00000331803 WDR7Q9Y4E6 1490 aa28.07■■■□□ 2.08
UPP1-201ENST00000331803 KDM6BO15054 1643 aa28.06■■■□□ 2.08
UPP1-201ENST00000331803 NCOA1Q15788 1441 aa28.06■■■□□ 2.08
UPP1-201ENST00000331803 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP28.06■■■□□ 2.08
UPP1-201ENST00000331803 ADGRL2O95490 1459 aa28.05■■■□□ 2.08
UPP1-201ENST00000331803 MBD5Q9P267 1494 aa28.04■■■□□ 2.08
UPP1-201ENST00000331803 ADGBQ8N7X0 1667 aa28.04■■■□□ 2.08
UPP1-201ENST00000331803 PLCH2O75038 1416 aa28.04■■■□□ 2.08
UPP1-201ENST00000331803 ARHGEF5Q12774 1597 aa28.03■■■□□ 2.08
UPP1-201ENST00000331803 SHANK2Q9UPX8 1470 aa28.03■■■□□ 2.08
UPP1-201ENST00000331803 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP28.02■■■□□ 2.08
UPP1-201ENST00000331803 TSPY4P0CV99 314 aa28.02■■■□□ 2.08
UPP1-201ENST00000331803 TSPY10P0CW01 314 aa28.02■■■□□ 2.08
UPP1-201ENST00000331803 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa28.01■■■□□ 2.07
UPP1-201ENST00000331803 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP28.01■■■□□ 2.07
UPP1-201ENST00000331803 RSPH4AQ5TD94 716 aa28.01■■■□□ 2.07
UPP1-201ENST00000331803 TRIM52Q96A61 297 aa28■■■□□ 2.07
UPP1-201ENST00000331803 C9orf84Q5VXU9 1444 aa28■■■□□ 2.07
UPP1-201ENST00000331803 ASXL2Q76L83 1435 aa28■■■□□ 2.07
UPP1-201ENST00000331803 CCDC141Q6ZP82 1450 aa27.97■■■□□ 2.07
UPP1-201ENST00000331803 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa27.96■■■□□ 2.07
UPP1-201ENST00000331803 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa27.96■■■□□ 2.07
UPP1-201ENST00000331803 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa27.95■■■□□ 2.07
UPP1-201ENST00000331803 SIN3AQ96ST3 1273 aa27.95■■■□□ 2.06
UPP1-201ENST00000331803 SYCP2Q9BX26 1530 aa27.95■■■□□ 2.06
UPP1-201ENST00000331803 NEUROD1Q13562 356 aa27.91■■■□□ 2.06
UPP1-201ENST00000331803 ARAP3Q8WWN8 1544 aa27.91■■■□□ 2.06
UPP1-201ENST00000331803 ABCA9Q8IUA7 1624 aa27.9■■■□□ 2.06
UPP1-201ENST00000331803 MPHOSPH9Q99550 1183 aa27.89■■■□□ 2.06
UPP1-201ENST00000331803 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa27.88■■■□□ 2.05
UPP1-201ENST00000331803 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa27.86■■■□□ 2.05
UPP1-201ENST00000331803 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP27.86■■■□□ 2.05
UPP1-201ENST00000331803 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa27.86■■■□□ 2.05
UPP1-201ENST00000331803 KIF15Q9NS87 1388 aa27.84■■■□□ 2.05
UPP1-201ENST00000331803 ABCC1P33527 1531 aa27.83■■■□□ 2.05
UPP1-201ENST00000331803 CYB5RLQ6IPT4 315 aa27.83■■■□□ 2.05
UPP1-201ENST00000331803 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa27.83■■■□□ 2.05
UPP1-201ENST00000331803 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa27.83■■■□□ 2.05
UPP1-201ENST00000331803 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa27.83■■■□□ 2.05
UPP1-201ENST00000331803 MAST1Q9Y2H9 1570 aa27.83■■■□□ 2.05
UPP1-201ENST00000331803 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP27.81■■■□□ 2.04
UPP1-201ENST00000331803 FANCAO15360 1455 aa27.78■■■□□ 2.04
UPP1-201ENST00000331803 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP27.78■■■□□ 2.04
UPP1-201ENST00000331803 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa27.75■■■□□ 2.03
UPP1-201ENST00000331803 PZPP20742 1482 aa27.74■■■□□ 2.03
UPP1-201ENST00000331803 FOXD1Q16676 465 aa27.72■■■□□ 2.03
UPP1-201ENST00000331803 PLXNC1O60486 1568 aa27.72■■■□□ 2.03
UPP1-201ENST00000331803 TONSLQ96HA7 1378 aa27.71■■■□□ 2.03
UPP1-201ENST00000331803 CD109Q6YHK3 1445 aa27.69■■■□□ 2.02
UPP1-201ENST00000331803 AFAP1Q8N556 730 aa27.69■■■□□ 2.02
UPP1-201ENST00000331803 NUP155O75694 1391 aa27.67■■■□□ 2.02
UPP1-201ENST00000331803 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa27.67■■■□□ 2.02
UPP1-201ENST00000331803 ADGRL1O94910 1474 aa27.67■■■□□ 2.02
UPP1-201ENST00000331803 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP27.67■■■□□ 2.02
UPP1-201ENST00000331803 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP27.66■■■□□ 2.02
UPP1-201ENST00000331803 SCAPERQ9BY12 1400 aa27.65■■■□□ 2.02
UPP1-201ENST00000331803 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa27.65■■■□□ 2.02
UPP1-201ENST00000331803 KDM5DQ9BY66 1539 aa27.64■■■□□ 2.01
UPP1-201ENST00000331803 DUOX2Q9NRD8 1548 aa27.64■■■□□ 2.01
UPP1-201ENST00000331803 PKD2Q13563 968 aa27.61■■■□□ 2.01
UPP1-201ENST00000331803 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa27.58■■■□□ 2.01
UPP1-201ENST00000331803 ERBINQ96RT1 1412 aa27.58■■■□□ 2.01
UPP1-201ENST00000331803 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP27.58■■■□□ 2.01
UPP1-201ENST00000331803 CFAP74Q9C0B2 1584 aa27.57■■■□□ 2
UPP1-201ENST00000331803 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP27.54■■■□□ 2
UPP1-201ENST00000331803 UNC13BO14795 1591 aa27.53■■■□□ 2
UPP1-201ENST00000331803 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP27.53■■■□□ 2
UPP1-201ENST00000331803 ATP7AQ04656 1500 aa27.53■■■□□ 2
UPP1-201ENST00000331803 FAM135AQ9P2D6 1515 aa27.52■■■□□ 2
UPP1-201ENST00000331803 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa27.5■■□□□ 1.99
UPP1-201ENST00000331803 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP27.49■■□□□ 1.99
UPP1-201ENST00000331803 GLI2P10070 1586 aa27.49■■□□□ 1.99
UPP1-201ENST00000331803 MYT1LQ9UL68 1186 aa27.49■■□□□ 1.99
UPP1-201ENST00000331803 NEO1Q92859 1461 aa27.48■■□□□ 1.99
UPP1-201ENST00000331803 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa27.48■■□□□ 1.99
UPP1-201ENST00000331803 L3MBTL2Q969R5 705 aa27.47■■□□□ 1.99
UPP1-201ENST00000331803 MAGI2Q86UL8 1455 aa27.45■■□□□ 1.99
UPP1-201ENST00000331803 POGZQ7Z3K3 1410 aa27.44■■□□□ 1.98
UPP1-201ENST00000331803 IQGAP3Q86VI3 1631 aa27.43■■□□□ 1.98
UPP1-201ENST00000331803 FAM69CQ0P6D2 419 aa27.43■■□□□ 1.98
UPP1-201ENST00000331803 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa27.41■■□□□ 1.98
UPP1-201ENST00000331803 KDM5CP41229 1560 aa27.4■■□□□ 1.98
UPP1-201ENST00000331803 DIP2BQ9P265 1576 aa27.4■■□□□ 1.98
UPP1-201ENST00000331803 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.4 ms