RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317201.6

HOXA3-201, Transcript of homeobox A3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene HOXA3, Length 2,761 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3-201ENST00000317201 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa21.35■■□□□ 1.01
HOXA3-201ENST00000317201 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
HOXA3-201ENST00000317201 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
HOXA3-201ENST00000317201 AKNAQ7Z591 1439 aa21.34■■□□□ 1.01
HOXA3-201ENST00000317201 HFM1A2PYH4 1435 aa21.34■■□□□ 1.01
HOXA3-201ENST00000317201 KDM5BQ9UGL1 1544 aa21.34■■□□□ 1.01
HOXA3-201ENST00000317201 PTPRKQ15262 1439 aa21.33■■□□□ 1
HOXA3-201ENST00000317201 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
HOXA3-201ENST00000317201 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa21.29■■□□□ 1
HOXA3-201ENST00000317201 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
HOXA3-201ENST00000317201 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa21.26■□□□□ 0.99
HOXA3-201ENST00000317201 GCC2Q8IWJ2 1684 aa21.25■□□□□ 0.99
HOXA3-201ENST00000317201 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP21.25■□□□□ 0.99
HOXA3-201ENST00000317201 DAPK1P53355 1430 aa21.25■□□□□ 0.99
HOXA3-201ENST00000317201 ROCK1Q13464 1354 aa21.25■□□□□ 0.99
HOXA3-201ENST00000317201 NAIPQ13075 1403 aa21.25■□□□□ 0.99
HOXA3-201ENST00000317201 PREX2Q70Z35 1606 aa21.22■□□□□ 0.99
HOXA3-201ENST00000317201 ABCC5O15440 1437 aa21.22■□□□□ 0.99
HOXA3-201ENST00000317201 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP21.2■□□□□ 0.98
HOXA3-201ENST00000317201 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP21.19■□□□□ 0.98
HOXA3-201ENST00000317201 CROCC2H7BZ55 1655 aa21.18■□□□□ 0.98
HOXA3-201ENST00000317201 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP21.16■□□□□ 0.98
HOXA3-201ENST00000317201 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa21.16■□□□□ 0.98
HOXA3-201ENST00000317201 SHANK2Q9UPX8 1470 aa21.15■□□□□ 0.98
HOXA3-201ENST00000317201 ARHGEF5Q12774 1597 aa21.15■□□□□ 0.98
HOXA3-201ENST00000317201 TTC37Q6PGP7 1564 aa21.15■□□□□ 0.98
HOXA3-201ENST00000317201 ADGRL2O95490 1459 aa21.15■□□□□ 0.98
HOXA3-201ENST00000317201 ADGBQ8N7X0 1667 aa21.15■□□□□ 0.98
HOXA3-201ENST00000317201 MAPKBP1O60336 1514 aa21.15■□□□□ 0.98
HOXA3-201ENST00000317201 MYO5CQ9NQX4 1742 aa21.14■□□□□ 0.97
HOXA3-201ENST00000317201 MIER1Q8N108 512 aa21.13■□□□□ 0.97
HOXA3-201ENST00000317201 ARAP3Q8WWN8 1544 aa21.11■□□□□ 0.97
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HOXA3-201ENST00000317201 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa21.09■□□□□ 0.97
HOXA3-201ENST00000317201 CCDC136Q96JN2 1154 aa21.08■□□□□ 0.97
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HOXA3-201ENST00000317201 MBD5Q9P267 1494 aa21.07■□□□□ 0.96
HOXA3-201ENST00000317201 CHIC2Q9UKJ5 165 aa21.07■□□□□ 0.96
HOXA3-201ENST00000317201 NCOA1Q15788 1441 aa21.07■□□□□ 0.96
HOXA3-201ENST00000317201 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa21.07■□□□□ 0.96
HOXA3-201ENST00000317201 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa21.06■□□□□ 0.96
HOXA3-201ENST00000317201 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP21.06■□□□□ 0.96
HOXA3-201ENST00000317201 ARHGAP5Q13017 1502 aa21.06■□□□□ 0.96
HOXA3-201ENST00000317201 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa21.04■□□□□ 0.96
HOXA3-201ENST00000317201 CCDC141Q6ZP82 1450 aa21.03■□□□□ 0.96
HOXA3-201ENST00000317201 SLC24A1O60721 1099 aa21.02■□□□□ 0.96
HOXA3-201ENST00000317201 ABCA9Q8IUA7 1624 aa21.02■□□□□ 0.96
HOXA3-201ENST00000317201 MAST1Q9Y2H9 1570 aa21.02■□□□□ 0.96
HOXA3-201ENST00000317201 KDM6BO15054 1643 aa21.02■□□□□ 0.96
HOXA3-201ENST00000317201 C9orf84Q5VXU9 1444 aa21.02■□□□□ 0.95
HOXA3-201ENST00000317201 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP21.01■□□□□ 0.95
HOXA3-201ENST00000317201 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa21■□□□□ 0.95
HOXA3-201ENST00000317201 ASXL2Q76L83 1435 aa21■□□□□ 0.95
HOXA3-201ENST00000317201 KCNH8Q96L42 1107 aa20.99■□□□□ 0.95
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HOXA3-201ENST00000317201 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa20.97■□□□□ 0.95
HOXA3-201ENST00000317201 ABCC1P33527 1531 aa20.95■□□□□ 0.94
HOXA3-201ENST00000317201 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP20.94■□□□□ 0.94
HOXA3-201ENST00000317201 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP20.93■□□□□ 0.94
HOXA3-201ENST00000317201 BCANQ96GW7 911 aa20.92■□□□□ 0.94
HOXA3-201ENST00000317201 PLXNC1O60486 1568 aa20.92■□□□□ 0.94
HOXA3-201ENST00000317201 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa20.91■□□□□ 0.94
HOXA3-201ENST00000317201 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa20.91■□□□□ 0.94
HOXA3-201ENST00000317201 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa20.91■□□□□ 0.94
HOXA3-201ENST00000317201 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa20.91■□□□□ 0.94
HOXA3-201ENST00000317201 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
HOXA3-201ENST00000317201 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa20.89■□□□□ 0.93
HOXA3-201ENST00000317201 TRIM52Q96A61 297 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXA3-201ENST00000317201 MPHOSPH9Q99550 1183 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXA3-201ENST00000317201 KIF15Q9NS87 1388 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXA3-201ENST00000317201 KDM5DQ9BY66 1539 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXA3-201ENST00000317201 FANCAO15360 1455 aa20.85■□□□□ 0.93
HOXA3-201ENST00000317201 CFAP74Q9C0B2 1584 aa20.84■□□□□ 0.93
HOXA3-201ENST00000317201 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa20.84■□□□□ 0.93
HOXA3-201ENST00000317201 PZPP20742 1482 aa20.83■□□□□ 0.93
HOXA3-201ENST00000317201 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.92
HOXA3-201ENST00000317201 SIN3AQ96ST3 1273 aa20.82■□□□□ 0.92
HOXA3-201ENST00000317201 MSH5O43196 834 aa20.81■□□□□ 0.92
HOXA3-201ENST00000317201 DUOX2Q9NRD8 1548 aa20.8■□□□□ 0.92
HOXA3-201ENST00000317201 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa20.8■□□□□ 0.92
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HOXA3-201ENST00000317201 ERBINQ96RT1 1412 aa20.78■□□□□ 0.92
HOXA3-201ENST00000317201 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa20.77■□□□□ 0.92
HOXA3-201ENST00000317201 UNC13BO14795 1591 aa20.77■□□□□ 0.92
HOXA3-201ENST00000317201 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP20.77■□□□□ 0.92
HOXA3-201ENST00000317201 GLI2P10070 1586 aa20.77■□□□□ 0.91
HOXA3-201ENST00000317201 CD109Q6YHK3 1445 aa20.76■□□□□ 0.91
HOXA3-201ENST00000317201 ADGRL1O94910 1474 aa20.76■□□□□ 0.91
HOXA3-201ENST00000317201 DEKP35659 375 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
HOXA3-201ENST00000317201 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
HOXA3-201ENST00000317201 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa20.76■□□□□ 0.91
HOXA3-201ENST00000317201 TONSLQ96HA7 1378 aa20.75■□□□□ 0.91
HOXA3-201ENST00000317201 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP20.74■□□□□ 0.91
HOXA3-201ENST00000317201 CYB5RLQ6IPT4 315 aa20.73■□□□□ 0.91
HOXA3-201ENST00000317201 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP20.72■□□□□ 0.91
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