RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000313285.12

TRIP10-202, Transcript of thyroid hormone receptor interactor 10, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRIP10, Length 2,035 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP10-202ENST00000313285 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa44.51■■■■■ 4.72
TRIP10-202ENST00000313285 ABCC2Q92887 1545 aa44.51■■■■■ 4.72
TRIP10-202ENST00000313285 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa44.43■■■■■ 4.7
TRIP10-202ENST00000313285 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP44.38■■■■■ 4.7
TRIP10-202ENST00000313285 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa44.36■■■■■ 4.69
TRIP10-202ENST00000313285 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa44.36■■■■■ 4.69
TRIP10-202ENST00000313285 SIN3AQ96ST3 1273 aa44.34■■■■■ 4.69
TRIP10-202ENST00000313285 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP44.33■■■■■ 4.69
TRIP10-202ENST00000313285 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP44.32■■■■■ 4.69
TRIP10-202ENST00000313285 KDM6BO15054 1643 aa44.31■■■■■ 4.68
TRIP10-202ENST00000313285 CROCC2H7BZ55 1655 aa44.25■■■■■ 4.67
TRIP10-202ENST00000313285 NEUROD1Q13562 356 aa44.24■■■■■ 4.67
TRIP10-202ENST00000313285 ADGRL2O95490 1459 aa44.24■■■■■ 4.67
TRIP10-202ENST00000313285 KDM5BQ9UGL1 1544 aa44.22■■■■■ 4.67
TRIP10-202ENST00000313285 NCOA1Q15788 1441 aa44.21■■■■■ 4.67
TRIP10-202ENST00000313285 ADGBQ8N7X0 1667 aa44.2■■■■■ 4.67
TRIP10-202ENST00000313285 PREX2Q70Z35 1606 aa44.18■■■■■ 4.66
TRIP10-202ENST00000313285 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP44.16■■■■■ 4.66
TRIP10-202ENST00000313285 SHANK2Q9UPX8 1470 aa44.15■■■■■ 4.66
TRIP10-202ENST00000313285 TRIM52Q96A61 297 aa44.15■■■■■ 4.66
TRIP10-202ENST00000313285 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP44.13■■■■■ 4.666e-6■■■■□ 21.5
TRIP10-202ENST00000313285 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa44.13■■■■■ 4.66
TRIP10-202ENST00000313285 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP44.13■■■■■ 4.65
TRIP10-202ENST00000313285 TTC37Q6PGP7 1564 aa44.1■■■■■ 4.65
TRIP10-202ENST00000313285 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa44.1■■■■■ 4.65
TRIP10-202ENST00000313285 ARHGEF5Q12774 1597 aa44.09■■■■■ 4.65
TRIP10-202ENST00000313285 OSCARQ8IYS5 282 aa44.08■■■■■ 4.65
TRIP10-202ENST00000313285 MPHOSPH9Q99550 1183 aa44.07■■■■■ 4.65
TRIP10-202ENST00000313285 MBD5Q9P267 1494 aa44.06■■■■■ 4.64
TRIP10-202ENST00000313285 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa44.05■■■■■ 4.64
TRIP10-202ENST00000313285 C9orf84Q5VXU9 1444 aa44.03■■■■■ 4.64
TRIP10-202ENST00000313285 RSPH4AQ5TD94 716 aa43.99■■■■■ 4.63
TRIP10-202ENST00000313285 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP43.99■■■■■ 4.63
TRIP10-202ENST00000313285 TSPY4P0CV99 314 aa43.99■■■■■ 4.63
TRIP10-202ENST00000313285 TSPY10P0CW01 314 aa43.99■■■■■ 4.63
TRIP10-202ENST00000313285 TONSLQ96HA7 1378 aa43.98■■■■■ 4.63
TRIP10-202ENST00000313285 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP43.96■■■■■ 4.63
TRIP10-202ENST00000313285 MYO5CQ9NQX4 1742 aa43.96■■■■■ 4.63
TRIP10-202ENST00000313285 ARHGAP5Q13017 1502 aa43.96■■■■■ 4.63
TRIP10-202ENST00000313285 KCNH8Q96L42 1107 aa43.94■■■■■ 4.62
TRIP10-202ENST00000313285 CCDC141Q6ZP82 1450 aa43.94■■■■■ 4.62
TRIP10-202ENST00000313285 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa43.9■■■■■ 4.62
TRIP10-202ENST00000313285 PLCH2O75038 1416 aa43.87■■■■■ 4.61
TRIP10-202ENST00000313285 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa43.87■■■■■ 4.61
TRIP10-202ENST00000313285 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa43.87■■■■■ 4.61
TRIP10-202ENST00000313285 SYCP2Q9BX26 1530 aa43.83■■■■■ 4.61
TRIP10-202ENST00000313285 PZPP20742 1482 aa43.82■■■■■ 4.61
TRIP10-202ENST00000313285 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP43.82■■■■■ 4.6
TRIP10-202ENST00000313285 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa43.79■■■■■ 4.6
TRIP10-202ENST00000313285 WDR7Q9Y4E6 1490 aa43.78■■■■■ 4.6
TRIP10-202ENST00000313285 KIF15Q9NS87 1388 aa43.78■■■■■ 4.6
TRIP10-202ENST00000313285 MAST1Q9Y2H9 1570 aa43.76■■■■■ 4.6
TRIP10-202ENST00000313285 FOXD1Q16676 465 aa43.73■■■■■ 4.59
TRIP10-202ENST00000313285 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa43.73■■■■■ 4.59
TRIP10-202ENST00000313285 ARAP3Q8WWN8 1544 aa43.72■■■■■ 4.59
TRIP10-202ENST00000313285 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa43.66■■■■■ 4.58
TRIP10-202ENST00000313285 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP43.65■■■■■ 4.58
TRIP10-202ENST00000313285 KDM5DQ9BY66 1539 aa43.64■■■■■ 4.58
TRIP10-202ENST00000313285 ABCC1P33527 1531 aa43.61■■■■■ 4.57
TRIP10-202ENST00000313285 ASXL2Q76L83 1435 aa43.59■■■■■ 4.57
TRIP10-202ENST00000313285 NUP155O75694 1391 aa43.58■■■■■ 4.57
TRIP10-202ENST00000313285 PLXNC1O60486 1568 aa43.58■■■■■ 4.57
TRIP10-202ENST00000313285 ABCA9Q8IUA7 1624 aa43.57■■■■■ 4.56
TRIP10-202ENST00000313285 MIER1Q8N108 512 aa43.56■■■■■ 4.56
TRIP10-202ENST00000313285 PKD2Q13563 968 aa43.52■■■■■ 4.56
TRIP10-202ENST00000313285 L3MBTL2Q969R5 705 aa43.49■■■■■ 4.55
TRIP10-202ENST00000313285 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP43.48■■■■■ 4.55
TRIP10-202ENST00000313285 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa43.45■■■■■ 4.55
TRIP10-202ENST00000313285 TEX14Q8IWB6 1497 aa43.45■■■■■ 4.55
TRIP10-202ENST00000313285 DUOX2Q9NRD8 1548 aa43.42■■■■■ 4.54
TRIP10-202ENST00000313285 FANCAO15360 1455 aa43.41■■■■■ 4.54
TRIP10-202ENST00000313285 UNC13BO14795 1591 aa43.37■■■■■ 4.53
TRIP10-202ENST00000313285 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa43.37■■■■■ 4.53
TRIP10-202ENST00000313285 ERBINQ96RT1 1412 aa43.36■■■■■ 4.53
TRIP10-202ENST00000313285 FAM135AQ9P2D6 1515 aa43.35■■■■■ 4.53
TRIP10-202ENST00000313285 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP43.29■■■■■ 4.52
TRIP10-202ENST00000313285 AFAP1Q8N556 730 aa43.27■■■■■ 4.52
TRIP10-202ENST00000313285 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa43.26■■■■■ 4.51
TRIP10-202ENST00000313285 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP43.24■■■■■ 4.51
TRIP10-202ENST00000313285 ADGRL1O94910 1474 aa43.24■■■■■ 4.51
TRIP10-202ENST00000313285 MAGI2Q86UL8 1455 aa43.24■■■■■ 4.51
TRIP10-202ENST00000313285 IQGAP3Q86VI3 1631 aa43.2■■■■■ 4.51
TRIP10-202ENST00000313285 SCAPERQ9BY12 1400 aa43.19■■■■■ 4.5
TRIP10-202ENST00000313285 NBPF8Q3BBV2 869 aa43.17■■■■■ 4.5
TRIP10-202ENST00000313285 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP43.15■■■■■ 4.5
TRIP10-202ENST00000313285 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP43.12■■■■■ 4.49
TRIP10-202ENST00000313285 CD109Q6YHK3 1445 aa43.12■■■■■ 4.49
TRIP10-202ENST00000313285 ATP7AQ04656 1500 aa43.12■■■■■ 4.49
TRIP10-202ENST00000313285 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP43.1■■■■■ 4.492e-8■□□□□ 11.1
TRIP10-202ENST00000313285 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP43.1■■■■■ 4.49
TRIP10-202ENST00000313285 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP43.07■■■■■ 4.49
TRIP10-202ENST00000313285 CFAP74Q9C0B2 1584 aa43.05■■■■■ 4.48
TRIP10-202ENST00000313285 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP43.04■■■■■ 4.48
TRIP10-202ENST00000313285 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa43■■■■■ 4.47
TRIP10-202ENST00000313285 PLA2R1Q13018 1463 aa42.99■■■■■ 4.47
TRIP10-202ENST00000313285 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa42.99■■■■■ 4.47
TRIP10-202ENST00000313285 ATP10AO60312 1499 aa42.97■■■■■ 4.47
TRIP10-202ENST00000313285 CCDC144AA2RUR9 1427 aa42.97■■■■■ 4.47
TRIP10-202ENST00000313285 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa42.95■■■■■ 4.47
TRIP10-202ENST00000313285 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa42.95■■■■■ 4.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.6 ms