RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299238.6

HPS6-201, Transcript of HPS6, biogenesis of lysosomal organelles complex 2 subunit 3, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene HPS6, Length 2,649 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS6-201ENST00000299238 TONSLQ96HA7 1378 aa28.42■■■□□ 2.14
HPS6-201ENST00000299238 FBLN2P98095 1184 aa28.42■■■□□ 2.14
HPS6-201ENST00000299238 PLB1Q6P1J6 1458 aa28.39■■■□□ 2.14
HPS6-201ENST00000299238 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP28.38■■■□□ 2.13
HPS6-201ENST00000299238 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa28.36■■■□□ 2.13
HPS6-201ENST00000299238 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP28.36■■■□□ 2.13
HPS6-201ENST00000299238 FKBP8Q14318 412 aa28.36■■■□□ 2.13
HPS6-201ENST00000299238 DAPK1P53355 1430 aa28.35■■■□□ 2.13
HPS6-201ENST00000299238 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP28.34■■■□□ 2.13
HPS6-201ENST00000299238 KDM5BQ9UGL1 1544 aa28.34■■■□□ 2.13
HPS6-201ENST00000299238 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP28.33■■■□□ 2.13
HPS6-201ENST00000299238 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP28.33■■■□□ 2.13
HPS6-201ENST00000299238 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP28.32■■■□□ 2.12
HPS6-201ENST00000299238 ADCY10Q96PN6 1610 aa28.32■■■□□ 2.12
HPS6-201ENST00000299238 ITSN2Q9NZM3 1697 aa28.32■■■□□ 2.12
HPS6-201ENST00000299238 JPH4Q96JJ6 628 aa28.31■■■□□ 2.12
HPS6-201ENST00000299238 ABCC5O15440 1437 aa28.29■■■□□ 2.12
HPS6-201ENST00000299238 ROCK1Q13464 1354 aa28.29■■■□□ 2.12
HPS6-201ENST00000299238 KIF14Q15058 1648 aa28.29■■■□□ 2.12
HPS6-201ENST00000299238 TRIM52Q96A61 297 aa28.26■■■□□ 2.12
HPS6-201ENST00000299238 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP28.26■■■□□ 2.11
HPS6-201ENST00000299238 ABCA8O94911 1581 aa28.24■■■□□ 2.11
HPS6-201ENST00000299238 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa28.24■■■□□ 2.11
HPS6-201ENST00000299238 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP28.2■■■□□ 2.1
HPS6-201ENST00000299238 ADGBQ8N7X0 1667 aa28.18■■■□□ 2.1
HPS6-201ENST00000299238 MPHOSPH9Q99550 1183 aa28.18■■■□□ 2.1
HPS6-201ENST00000299238 CROCC2H7BZ55 1655 aa28.17■■■□□ 2.1
HPS6-201ENST00000299238 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP28.15■■■□□ 2.1
HPS6-201ENST00000299238 CCER2I3L3R5 266 aa28.14■■■□□ 2.09
HPS6-201ENST00000299238 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa28.12■■■□□ 2.09
HPS6-201ENST00000299238 CHD1O14646 1710 aa28.11■■■□□ 2.09
HPS6-201ENST00000299238 ATP10BO94823 1461 aa28.1■■■□□ 2.09
HPS6-201ENST00000299238 ANP32CO43423 234 aa28.09■■■□□ 2.09
HPS6-201ENST00000299238 DEKP35659 375 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.09
HPS6-201ENST00000299238 FOXD1Q16676 465 aa28.06■■■□□ 2.08
HPS6-201ENST00000299238 ADGRL2O95490 1459 aa28.06■■■□□ 2.08
HPS6-201ENST00000299238 ABCC10Q5T3U5 1492 aa28.06■■■□□ 2.08
HPS6-201ENST00000299238 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP28.05■■■□□ 2.08
HPS6-201ENST00000299238 NCOA1Q15788 1441 aa28.04■■■□□ 2.08
HPS6-201ENST00000299238 PLEKHD1A6NEE1 506 aa28.03■■■□□ 2.08
HPS6-201ENST00000299238 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa28.03■■■□□ 2.08
HPS6-201ENST00000299238 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP28.01■■■□□ 2.07
HPS6-201ENST00000299238 PZPP20742 1482 aa27.99■■■□□ 2.07
HPS6-201ENST00000299238 PTPRGP23470 1445 aa27.99■■■□□ 2.07
HPS6-201ENST00000299238 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP27.97■■■□□ 2.07
HPS6-201ENST00000299238 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP27.97■■■□□ 2.07
HPS6-201ENST00000299238 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP27.96■■■□□ 2.07
HPS6-201ENST00000299238 L3MBTL2Q969R5 705 aa27.96■■■□□ 2.07
HPS6-201ENST00000299238 TEX14Q8IWB6 1497 aa27.95■■■□□ 2.07
HPS6-201ENST00000299238 SHROOM2Q13796 1616 aa27.95■■■□□ 2.07
HPS6-201ENST00000299238 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa27.94■■■□□ 2.06
HPS6-201ENST00000299238 SHANK2Q9UPX8 1470 aa27.94■■■□□ 2.06
HPS6-201ENST00000299238 WASHC2AQ641Q2 1341 aa27.93■■■□□ 2.06
HPS6-201ENST00000299238 FANCIQ9NVI1 1328 aa27.93■■■□□ 2.06
HPS6-201ENST00000299238 NEFLP07196 543 aa27.92■■■□□ 2.06
HPS6-201ENST00000299238 C9orf84Q5VXU9 1444 aa27.89■■■□□ 2.05
HPS6-201ENST00000299238 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP27.88■■■□□ 2.05
HPS6-201ENST00000299238 CCDC136Q96JN2 1154 aa27.88■■■□□ 2.05
HPS6-201ENST00000299238 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa27.87■■■□□ 2.05
HPS6-201ENST00000299238 PREX2Q70Z35 1606 aa27.86■■■□□ 2.05
HPS6-201ENST00000299238 ARHGEF5Q12774 1597 aa27.85■■■□□ 2.05
HPS6-201ENST00000299238 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa27.85■■■□□ 2.05
HPS6-201ENST00000299238 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa27.84■■■□□ 2.05
HPS6-201ENST00000299238 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa27.81■■■□□ 2.04
HPS6-201ENST00000299238 ERCC6L2Q5T890 1561 aa27.81■■■□□ 2.04
HPS6-201ENST00000299238 NBPF8Q3BBV2 869 aa27.8■■■□□ 2.04
HPS6-201ENST00000299238 MBD5Q9P267 1494 aa27.78■■■□□ 2.04
HPS6-201ENST00000299238 CNTLNQ9NXG0 1405 aa27.77■■■□□ 2.04
HPS6-201ENST00000299238 MYT1LQ9UL68 1186 aa27.77■■■□□ 2.04
HPS6-201ENST00000299238 TTC37Q6PGP7 1564 aa27.76■■■□□ 2.03
HPS6-201ENST00000299238 ABCC2Q92887 1545 aa27.75■■■□□ 2.03
HPS6-201ENST00000299238 KDM5DQ9BY66 1539 aa27.75■■■□□ 2.03
HPS6-201ENST00000299238 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP27.74■■■□□ 2.03
HPS6-201ENST00000299238 TSPY4P0CV99 314 aa27.74■■■□□ 2.03
HPS6-201ENST00000299238 TSPY10P0CW01 314 aa27.74■■■□□ 2.03
HPS6-201ENST00000299238 PKD2Q13563 968 aa27.74■■■□□ 2.03
HPS6-201ENST00000299238 CCDC141Q6ZP82 1450 aa27.74■■■□□ 2.03
HPS6-201ENST00000299238 CCDC7Q96M83 1385 aa27.74■■■□□ 2.03
HPS6-201ENST00000299238 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP27.73■■■□□ 2.03
HPS6-201ENST00000299238 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa27.73■■■□□ 2.03
HPS6-201ENST00000299238 KIF15Q9NS87 1388 aa27.73■■■□□ 2.03
HPS6-201ENST00000299238 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP27.71■■■□□ 2.03
HPS6-201ENST00000299238 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP27.7■■■□□ 2.03
HPS6-201ENST00000299238 NUP155O75694 1391 aa27.7■■■□□ 2.03
HPS6-201ENST00000299238 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP27.7■■■□□ 2.02
HPS6-201ENST00000299238 MYO5CQ9NQX4 1742 aa27.68■■■□□ 2.02
HPS6-201ENST00000299238 CLASP1Q7Z460 1538 aa27.68■■■□□ 2.02
HPS6-201ENST00000299238 SYCP2Q9BX26 1530 aa27.68■■■□□ 2.02
HPS6-201ENST00000299238 NBR1Q14596 966 aa27.67■■■□□ 2.02
HPS6-201ENST00000299238 ARHGAP5Q13017 1502 aa27.67■■■□□ 2.02
HPS6-201ENST00000299238 CCDC184Q52MB2 194 aa27.65■■■□□ 2.02
HPS6-201ENST00000299238 MAST1Q9Y2H9 1570 aa27.62■■■□□ 2.01
HPS6-201ENST00000299238 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP27.6■■■□□ 2.01
HPS6-201ENST00000299238 KIF7Q2M1P5 1343 aa27.59■■■□□ 2.01
HPS6-201ENST00000299238 RSPH4AQ5TD94 716 aa27.59■■■□□ 2.01
HPS6-201ENST00000299238 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP27.59■■■□□ 2.01
HPS6-201ENST00000299238 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP27.59■■■□□ 2.01
HPS6-201ENST00000299238 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP27.58■■■□□ 2.01
HPS6-201ENST00000299238 IL27Q8NEV9 243 aa27.56■■■□□ 2
HPS6-201ENST00000299238 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa27.56■■■□□ 2
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