RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295688.7

CCT3-201, Transcript of chaperonin containing TCP1 subunit 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCT3, Length 2,150 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT3-201ENST00000295688 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa20.45■□□□□ 0.86
CCT3-201ENST00000295688 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
CCT3-201ENST00000295688 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
CCT3-201ENST00000295688 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
CCT3-201ENST00000295688 ABCC5O15440 1437 aa20.4■□□□□ 0.86
CCT3-201ENST00000295688 MRC2Q9UBG0 1479 aa20.4■□□□□ 0.86
CCT3-201ENST00000295688 FANCIQ9NVI1 1328 aa20.39■□□□□ 0.85
CCT3-201ENST00000295688 TEX14Q8IWB6 1497 aa20.39■□□□□ 0.85
CCT3-201ENST00000295688 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa20.38■□□□□ 0.85
CCT3-201ENST00000295688 KIAA0556O60303 1618 aa20.38■□□□□ 0.85
CCT3-201ENST00000295688 PPP4R2Q9NY27 417 aa20.36■□□□□ 0.85
CCT3-201ENST00000295688 BCL11AQ9H165 835 aa20.35■□□□□ 0.85
CCT3-201ENST00000295688 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa20.35■□□□□ 0.85
CCT3-201ENST00000295688 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
CCT3-201ENST00000295688 ZBED9Q6R2W3 1325 aa20.35■□□□□ 0.85
CCT3-201ENST00000295688 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa20.35■□□□□ 0.85
CCT3-201ENST00000295688 IFT140Q96RY7 1462 aa20.34■□□□□ 0.85
CCT3-201ENST00000295688 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
CCT3-201ENST00000295688 FOXD1Q16676 465 aa20.34■□□□□ 0.85
CCT3-201ENST00000295688 NBPF8Q3BBV2 869 aa20.33■□□□□ 0.85
CCT3-201ENST00000295688 DISP1Q96F81 1524 aa20.33■□□□□ 0.85
CCT3-201ENST00000295688 MRS2Q9HD23 443 aa20.33■□□□□ 0.85
CCT3-201ENST00000295688 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
CCT3-201ENST00000295688 ITSN2Q9NZM3 1697 aa20.31■□□□□ 0.84
CCT3-201ENST00000295688 ADGBQ8N7X0 1667 aa20.31■□□□□ 0.84
CCT3-201ENST00000295688 KIF7Q2M1P5 1343 aa20.3■□□□□ 0.84
CCT3-201ENST00000295688 MSH5O43196 834 aa20.29■□□□□ 0.84
CCT3-201ENST00000295688 CCDC184Q52MB2 194 aa20.29■□□□□ 0.84
CCT3-201ENST00000295688 FAM9BQ8IZU0 186 aa20.29■□□□□ 0.84
CCT3-201ENST00000295688 ARID3CA6NKF2 412 aa20.28■□□□□ 0.84
CCT3-201ENST00000295688 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
CCT3-201ENST00000295688 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
CCT3-201ENST00000295688 PZPP20742 1482 aa20.26■□□□□ 0.83
CCT3-201ENST00000295688 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
CCT3-201ENST00000295688 ADGRL2O95490 1459 aa20.25■□□□□ 0.83
CCT3-201ENST00000295688 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
CCT3-201ENST00000295688 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa20.25■□□□□ 0.83
CCT3-201ENST00000295688 DNAJC5BQ9UF47 199 aa20.25■□□□□ 0.83
CCT3-201ENST00000295688 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa20.24■□□□□ 0.83
CCT3-201ENST00000295688 GRIN2AQ12879 1464 aa20.23■□□□□ 0.83
CCT3-201ENST00000295688 ADCY10Q96PN6 1610 aa20.23■□□□□ 0.83
CCT3-201ENST00000295688 MBD5Q9P267 1494 aa20.23■□□□□ 0.83
CCT3-201ENST00000295688 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
CCT3-201ENST00000295688 CROCC2H7BZ55 1655 aa20.21■□□□□ 0.83
CCT3-201ENST00000295688 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
CCT3-201ENST00000295688 KIF14Q15058 1648 aa20.2■□□□□ 0.82
CCT3-201ENST00000295688 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa20.19■□□□□ 0.82
CCT3-201ENST00000295688 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
CCT3-201ENST00000295688 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
CCT3-201ENST00000295688 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
CCT3-201ENST00000295688 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
CCT3-201ENST00000295688 USP47Q96K76 1375 aa20.16■□□□□ 0.82
CCT3-201ENST00000295688 ERICH6Q7L0X2 663 aa20.16■□□□□ 0.82
CCT3-201ENST00000295688 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
CCT3-201ENST00000295688 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa20.14■□□□□ 0.81
CCT3-201ENST00000295688 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
CCT3-201ENST00000295688 KDM5CP41229 1560 aa20.14■□□□□ 0.81
CCT3-201ENST00000295688 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
CCT3-201ENST00000295688 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa20.13■□□□□ 0.81
CCT3-201ENST00000295688 PKD2Q13563 968 aa20.12■□□□□ 0.81
CCT3-201ENST00000295688 BCORL1Q5H9F3 1711 aa20.12■□□□□ 0.81
CCT3-201ENST00000295688 MYT1LQ9UL68 1186 aa20.12■□□□□ 0.81
CCT3-201ENST00000295688 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa20.11■□□□□ 0.81
CCT3-201ENST00000295688 SHANK2Q9UPX8 1470 aa20.11■□□□□ 0.81
CCT3-201ENST00000295688 RALGAPBQ86X10 1494 aa20.1■□□□□ 0.81
CCT3-201ENST00000295688 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa20.1■□□□□ 0.81
CCT3-201ENST00000295688 NUDCQ9Y266 331 aa20.1■□□□□ 0.81
CCT3-201ENST00000295688 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa20.08■□□□□ 0.81
CCT3-201ENST00000295688 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
CCT3-201ENST00000295688 PLB1Q6P1J6 1458 aa20.08■□□□□ 0.8
CCT3-201ENST00000295688 SYNJ2O15056 1496 aa20.07■□□□□ 0.8
CCT3-201ENST00000295688 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
CCT3-201ENST00000295688 KDM5DQ9BY66 1539 aa20.07■□□□□ 0.8
CCT3-201ENST00000295688 RNF123Q5XPI4 1314 aa20.06■□□□□ 0.8
CCT3-201ENST00000295688 CEP170Q5SW79 1584 aa20.05■□□□□ 0.8
CCT3-201ENST00000295688 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
CCT3-201ENST00000295688 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
CCT3-201ENST00000295688 PLEKHD1A6NEE1 506 aa20.04■□□□□ 0.8
CCT3-201ENST00000295688 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa20.04■□□□□ 0.8
CCT3-201ENST00000295688 KIF15Q9NS87 1388 aa20.03■□□□□ 0.8
CCT3-201ENST00000295688 NUP155O75694 1391 aa20.03■□□□□ 0.8
CCT3-201ENST00000295688 C9orf84Q5VXU9 1444 aa20.02■□□□□ 0.8
CCT3-201ENST00000295688 POLR3GLQ9BT43 218 aa20.02■□□□□ 0.8
CCT3-201ENST00000295688 TMC1Q8TDI8 760 aa20.01■□□□□ 0.79
CCT3-201ENST00000295688 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
CCT3-201ENST00000295688 CARD11Q9BXL7 1154 aa20.01■□□□□ 0.79
CCT3-201ENST00000295688 TSPY4P0CV99 314 aa20■□□□□ 0.79
CCT3-201ENST00000295688 TSPY10P0CW01 314 aa20■□□□□ 0.79
CCT3-201ENST00000295688 ABCC10Q5T3U5 1492 aa20■□□□□ 0.79
CCT3-201ENST00000295688 JPH4Q96JJ6 628 aa20■□□□□ 0.79
CCT3-201ENST00000295688 NUP160Q12769 1436 aa19.99■□□□□ 0.79
CCT3-201ENST00000295688 ABCA8O94911 1581 aa19.99■□□□□ 0.79
CCT3-201ENST00000295688 RALBP1Q15311 655 aa19.98■□□□□ 0.79
CCT3-201ENST00000295688 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
CCT3-201ENST00000295688 ARHGEF5Q12774 1597 aa19.98■□□□□ 0.79
CCT3-201ENST00000295688 PTPRGP23470 1445 aa19.97■□□□□ 0.79
CCT3-201ENST00000295688 CCDC136Q96JN2 1154 aa19.95■□□□□ 0.78
CCT3-201ENST00000295688 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP19.95■□□□□ 0.78
CCT3-201ENST00000295688 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP19.95■□□□□ 0.78
CCT3-201ENST00000295688 ATP10BO94823 1461 aa19.93■□□□□ 0.78
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