RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295645.8

PDCL2-201, Transcript of phosducin like 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDCL2, Length 861 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2-201ENST00000295645 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
PDCL2-201ENST00000295645 RIMBP2O15034 1052 aa13.41□□□□□ -0.26
PDCL2-201ENST00000295645 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
PDCL2-201ENST00000295645 ZNF710Q8N1W2 664 aa13.39□□□□□ -0.27
PDCL2-201ENST00000295645 KIF3CO14782 793 aa13.37□□□□□ -0.27
PDCL2-201ENST00000295645 TMC2Q8TDI7 906 aa13.37□□□□□ -0.27
PDCL2-201ENST00000295645 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa13.37□□□□□ -0.27
PDCL2-201ENST00000295645 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP13.34□□□□□ -0.27
PDCL2-201ENST00000295645 C2orf72A6NCS6 295 aa13.33□□□□□ -0.28
PDCL2-201ENST00000295645 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP13.31□□□□□ -0.28
PDCL2-201ENST00000295645 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP13.31□□□□□ -0.28
PDCL2-201ENST00000295645 EMP3P54852 163 aa13.29□□□□□ -0.28
PDCL2-201ENST00000295645 MARVELD3Q96A59 401 aa13.27□□□□□ -0.29
PDCL2-201ENST00000295645 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP13.27□□□□□ -0.29
PDCL2-201ENST00000295645 SLC34A2O95436 690 aa13.25□□□□□ -0.29
PDCL2-201ENST00000295645 FOXK1P85037 733 aa13.23□□□□□ -0.29
PDCL2-201ENST00000295645 CDAN1Q8IWY9 1227 aa13.23□□□□□ -0.29
PDCL2-201ENST00000295645 GPR153Q6NV75 609 aa13.22□□□□□ -0.29
PDCL2-201ENST00000295645 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP13.22□□□□□ -0.29
PDCL2-201ENST00000295645 PDE4AP27815 886 aa13.19□□□□□ -0.3
PDCL2-201ENST00000295645 FAM205CA6NFA0 338 aa13.17□□□□□ -0.3
PDCL2-201ENST00000295645 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa13.17□□□□□ -0.3
PDCL2-201ENST00000295645 ARSIQ5FYB1 569 aa13.16□□□□□ -0.3
PDCL2-201ENST00000295645 PLPP6Q8IY26 295 aa13.16□□□□□ -0.3
PDCL2-201ENST00000295645 HS3ST6Q96QI5 342 aa13.16□□□□□ -0.3
PDCL2-201ENST00000295645 ERBB3P21860 1342 aa13.15□□□□□ -0.3
PDCL2-201ENST00000295645 DSG2Q14126 1118 aa13.14□□□□□ -0.31
PDCL2-201ENST00000295645 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa13.14□□□□□ -0.31
PDCL2-201ENST00000295645 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
PDCL2-201ENST00000295645 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa13.12□□□□□ -0.31
PDCL2-201ENST00000295645 TBC1D12O60347 775 aa13.11□□□□□ -0.31
PDCL2-201ENST00000295645 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa13.09□□□□□ -0.31
PDCL2-201ENST00000295645 POTEB3A0JP26 581 aa13.07□□□□□ -0.32
PDCL2-201ENST00000295645 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa13.07□□□□□ -0.32
PDCL2-201ENST00000295645 POTEBQ6S5H4 581 aa13.07□□□□□ -0.32
PDCL2-201ENST00000295645 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
PDCL2-201ENST00000295645 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
PDCL2-201ENST00000295645 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
PDCL2-201ENST00000295645 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
PDCL2-201ENST00000295645 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP13.04□□□□□ -0.32
PDCL2-201ENST00000295645 NUDT7P0C024 238 aa13.03□□□□□ -0.32
PDCL2-201ENST00000295645 MFSD10Q14728 455 aa13.03□□□□□ -0.32
PDCL2-201ENST00000295645 PLSCR2Q9NRY7 297 aa13.03□□□□□ -0.32
PDCL2-201ENST00000295645 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP13.02□□□□□ -0.33
PDCL2-201ENST00000295645 ZNF687Q8N1G0 1237 aa13.02□□□□□ -0.33
PDCL2-201ENST00000295645 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
PDCL2-201ENST00000295645 OXER1Q8TDS5 423 aa12.99□□□□□ -0.33
PDCL2-201ENST00000295645 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa12.97□□□□□ -0.33
PDCL2-201ENST00000295645 CADPS2Q86UW7 1296 aa12.97□□□□□ -0.33
PDCL2-201ENST00000295645 CFAP44Q96MT7 982 aa12.97□□□□□ -0.33
PDCL2-201ENST00000295645 LHX6Q9UPM6 363 aa12.96□□□□□ -0.33
PDCL2-201ENST00000295645 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa12.95□□□□□ -0.34
PDCL2-201ENST00000295645 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa12.95□□□□□ -0.34
PDCL2-201ENST00000295645 PBX2P40425 430 aa12.91□□□□□ -0.34
PDCL2-201ENST00000295645 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP12.91□□□□□ -0.34
PDCL2-201ENST00000295645 SPNS2Q8IVW8 549 aa12.9□□□□□ -0.34
PDCL2-201ENST00000295645 MAP3K9P80192 1104 aa12.88□□□□□ -0.35
PDCL2-201ENST00000295645 CAMK2BQ13554 666 aa12.87□□□□□ -0.35
PDCL2-201ENST00000295645 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
PDCL2-201ENST00000295645 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa12.86□□□□□ -0.35
PDCL2-201ENST00000295645 EVI5O60447 810 aa12.83□□□□□ -0.36
PDCL2-201ENST00000295645 EMILIN3Q9NT22 766 aa12.82□□□□□ -0.36
PDCL2-201ENST00000295645 WDR70Q9NW82 654 aa12.82□□□□□ -0.36
PDCL2-201ENST00000295645 ARHGAP33O14559 1287 aa12.8□□□□□ -0.36
PDCL2-201ENST00000295645 PTGER2P43116 358 aa12.8□□□□□ -0.36
PDCL2-201ENST00000295645 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP12.79□□□□□ -0.36
PDCL2-201ENST00000295645 MMRN1Q13201 1228 aa12.79□□□□□ -0.36
PDCL2-201ENST00000295645 KCNH8Q96L42 1107 aa12.78□□□□□ -0.36
PDCL2-201ENST00000295645 FOSBP53539 338 aa12.76□□□□□ -0.37
PDCL2-201ENST00000295645 ZNF454Q8N9F8 522 aa12.76□□□□□ -0.37
PDCL2-201ENST00000295645 JPH4Q96JJ6 628 aa12.76□□□□□ -0.37
PDCL2-201ENST00000295645 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa12.75□□□□□ -0.37
PDCL2-201ENST00000295645 E2F4Q16254 413 aa12.74□□□□□ -0.37
PDCL2-201ENST00000295645 POTEEQ6S8J3 1075 aa12.73□□□□□ -0.37
PDCL2-201ENST00000295645 BCL2L12Q9HB09 334 aa12.71□□□□□ -0.37
PDCL2-201ENST00000295645 AXIN2Q9Y2T1 843 aa12.71□□□□□ -0.37
PDCL2-201ENST00000295645 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP12.71□□□□□ -0.37
PDCL2-201ENST00000295645 TK2O00142 265 aa12.7□□□□□ -0.38
PDCL2-201ENST00000295645 DPYSL4O14531 572 aa12.7□□□□□ -0.38
PDCL2-201ENST00000295645 ZDHHC16Q969W1 377 aa12.7□□□□□ -0.38
PDCL2-201ENST00000295645 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP12.69□□□□□ -0.38
PDCL2-201ENST00000295645 FBXW7Q969H0 707 aa12.68□□□□□ -0.38
PDCL2-201ENST00000295645 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa12.68□□□□□ -0.38
PDCL2-201ENST00000295645 PHF14O94880 888 aa12.67□□□□□ -0.38
PDCL2-201ENST00000295645 MYT1LQ9UL68 1186 aa12.67□□□□□ -0.38
PDCL2-201ENST00000295645 PTPREP23469 700 aa12.66□□□□□ -0.38
PDCL2-201ENST00000295645 PLCB2Q00722 1185 aa12.65□□□□□ -0.38
PDCL2-201ENST00000295645 KCNK17Q96T54 332 aa12.65□□□□□ -0.38
PDCL2-201ENST00000295645 EPAS1Q99814 870 aa12.65□□□□□ -0.38
PDCL2-201ENST00000295645 PSEN2P49810 448 aa12.64□□□□□ -0.39
PDCL2-201ENST00000295645 PDIA6Q15084 440 aa12.64□□□□□ -0.39
PDCL2-201ENST00000295645 TYW1BQ6NUM6 668 aa12.64□□□□□ -0.39
PDCL2-201ENST00000295645 ADGRD1Q6QNK2 874 aa12.64□□□□□ -0.39
PDCL2-201ENST00000295645 SLC4A5Q9BY07 1137 aa12.64□□□□□ -0.39
PDCL2-201ENST00000295645 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa12.63□□□□□ -0.39
PDCL2-201ENST00000295645 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP12.62□□□□□ -0.39
PDCL2-201ENST00000295645 DMRTA1Q5VZB9 504 aa12.61□□□□□ -0.39
PDCL2-201ENST00000295645 ADAM33Q9BZ11 813 aa12.6□□□□□ -0.39
PDCL2-201ENST00000295645 STAC3Q96MF2 364 aa12.58□□□□□ -0.4
PDCL2-201ENST00000295645 HRO43593 1189 aa12.56□□□□□ -0.4
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