RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000270645.7

RCN3-201, Transcript of reticulocalbin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RCN3, Length 1,859 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCN3-201ENST00000270645 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa30.3■■■□□ 2.44
RCN3-201ENST00000270645 KDM5BQ9UGL1 1544 aa30.29■■■□□ 2.44
RCN3-201ENST00000270645 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa30.28■■■□□ 2.44
RCN3-201ENST00000270645 ROCK1Q13464 1354 aa30.26■■■□□ 2.43
RCN3-201ENST00000270645 GCC2Q8IWJ2 1684 aa30.25■■■□□ 2.43
RCN3-201ENST00000270645 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP30.24■■■□□ 2.43
RCN3-201ENST00000270645 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP30.24■■■□□ 2.43
RCN3-201ENST00000270645 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP30.17■■■□□ 2.42
RCN3-201ENST00000270645 PREX2Q70Z35 1606 aa30.14■■■□□ 2.42
RCN3-201ENST00000270645 TTC37Q6PGP7 1564 aa30.12■■■□□ 2.41
RCN3-201ENST00000270645 KDM6BO15054 1643 aa30.12■■■□□ 2.41
RCN3-201ENST00000270645 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa30.12■■■□□ 2.41
RCN3-201ENST00000270645 CROCC2H7BZ55 1655 aa30.1■■■□□ 2.41
RCN3-201ENST00000270645 KCNH8Q96L42 1107 aa30.1■■■□□ 2.41
RCN3-201ENST00000270645 ADGRL2O95490 1459 aa30.09■■■□□ 2.41
RCN3-201ENST00000270645 NCOA1Q15788 1441 aa30.08■■■□□ 2.41
RCN3-201ENST00000270645 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP30.07■■■□□ 2.4
RCN3-201ENST00000270645 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa30.06■■■□□ 2.4
RCN3-201ENST00000270645 ADGBQ8N7X0 1667 aa30.05■■■□□ 2.4
RCN3-201ENST00000270645 SHANK2Q9UPX8 1470 aa30.05■■■□□ 2.4
RCN3-201ENST00000270645 MBD5Q9P267 1494 aa30.04■■■□□ 2.4
RCN3-201ENST00000270645 ARHGEF5Q12774 1597 aa30.04■■■□□ 2.4
RCN3-201ENST00000270645 SIN3AQ96ST3 1273 aa30.04■■■□□ 2.4
RCN3-201ENST00000270645 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP30.02■■■□□ 2.4
RCN3-201ENST00000270645 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa30.02■■■□□ 2.4
RCN3-201ENST00000270645 ARHGAP5Q13017 1502 aa30.01■■■□□ 2.4
RCN3-201ENST00000270645 MYO5CQ9NQX4 1742 aa30.01■■■□□ 2.39
RCN3-201ENST00000270645 TRIM52Q96A61 297 aa30.01■■■□□ 2.39
RCN3-201ENST00000270645 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP30■■■□□ 2.39
RCN3-201ENST00000270645 PLCH2O75038 1416 aa30■■■□□ 2.39
RCN3-201ENST00000270645 RSPH4AQ5TD94 716 aa29.99■■■□□ 2.39
RCN3-201ENST00000270645 C9orf84Q5VXU9 1444 aa29.99■■■□□ 2.39
RCN3-201ENST00000270645 WDR7Q9Y4E6 1490 aa29.98■■■□□ 2.39
RCN3-201ENST00000270645 TSPY4P0CV99 314 aa29.97■■■□□ 2.39
RCN3-201ENST00000270645 TSPY10P0CW01 314 aa29.97■■■□□ 2.39
RCN3-201ENST00000270645 NEUROD1Q13562 356 aa29.97■■■□□ 2.39
RCN3-201ENST00000270645 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa29.97■■■□□ 2.39
RCN3-201ENST00000270645 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP29.95■■■□□ 2.38
RCN3-201ENST00000270645 CCDC141Q6ZP82 1450 aa29.94■■■□□ 2.38
RCN3-201ENST00000270645 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa29.93■■■□□ 2.38
RCN3-201ENST00000270645 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa29.93■■■□□ 2.38
RCN3-201ENST00000270645 MPHOSPH9Q99550 1183 aa29.93■■■□□ 2.38
RCN3-201ENST00000270645 SYCP2Q9BX26 1530 aa29.9■■■□□ 2.38
RCN3-201ENST00000270645 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa29.9■■■□□ 2.38
RCN3-201ENST00000270645 ASXL2Q76L83 1435 aa29.89■■■□□ 2.38
RCN3-201ENST00000270645 ARAP3Q8WWN8 1544 aa29.87■■■□□ 2.37
RCN3-201ENST00000270645 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa29.87■■■□□ 2.37
RCN3-201ENST00000270645 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP29.87■■■□□ 2.37
RCN3-201ENST00000270645 MAST1Q9Y2H9 1570 aa29.83■■■□□ 2.37
RCN3-201ENST00000270645 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa29.82■■■□□ 2.37
RCN3-201ENST00000270645 KIF15Q9NS87 1388 aa29.82■■■□□ 2.36
RCN3-201ENST00000270645 ABCA9Q8IUA7 1624 aa29.81■■■□□ 2.36
RCN3-201ENST00000270645 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa29.79■■■□□ 2.36
RCN3-201ENST00000270645 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa29.79■■■□□ 2.36
RCN3-201ENST00000270645 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa29.79■■■□□ 2.36
RCN3-201ENST00000270645 PZPP20742 1482 aa29.78■■■□□ 2.36
RCN3-201ENST00000270645 ABCC1P33527 1531 aa29.78■■■□□ 2.36
RCN3-201ENST00000270645 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP29.77■■■□□ 2.36
RCN3-201ENST00000270645 CYB5RLQ6IPT4 315 aa29.76■■■□□ 2.36
RCN3-201ENST00000270645 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP29.76■■■□□ 2.35
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RCN3-201ENST00000270645 TONSLQ96HA7 1378 aa29.75■■■□□ 2.35
RCN3-201ENST00000270645 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa29.72■■■□□ 2.35
RCN3-201ENST00000270645 FOXD1Q16676 465 aa29.72■■■□□ 2.35
RCN3-201ENST00000270645 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa29.7■■■□□ 2.35
RCN3-201ENST00000270645 PLXNC1O60486 1568 aa29.69■■■□□ 2.34
RCN3-201ENST00000270645 FANCAO15360 1455 aa29.69■■■□□ 2.34
RCN3-201ENST00000270645 KDM5DQ9BY66 1539 aa29.66■■■□□ 2.34
RCN3-201ENST00000270645 NUP155O75694 1391 aa29.65■■■□□ 2.34
RCN3-201ENST00000270645 PKD2Q13563 968 aa29.6■■■□□ 2.33
RCN3-201ENST00000270645 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa29.6■■■□□ 2.33
RCN3-201ENST00000270645 DUOX2Q9NRD8 1548 aa29.6■■■□□ 2.33
RCN3-201ENST00000270645 AFAP1Q8N556 730 aa29.59■■■□□ 2.33
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RCN3-201ENST00000270645 CD109Q6YHK3 1445 aa29.56■■■□□ 2.32
RCN3-201ENST00000270645 ADGRL1O94910 1474 aa29.56■■■□□ 2.32
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RCN3-201ENST00000270645 ERBINQ96RT1 1412 aa29.54■■■□□ 2.32
RCN3-201ENST00000270645 UNC13BO14795 1591 aa29.52■■■□□ 2.32
RCN3-201ENST00000270645 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa29.52■■■□□ 2.32
RCN3-201ENST00000270645 L3MBTL2Q969R5 705 aa29.49■■■□□ 2.31
RCN3-201ENST00000270645 FAM135AQ9P2D6 1515 aa29.49■■■□□ 2.31
RCN3-201ENST00000270645 CFAP74Q9C0B2 1584 aa29.46■■■□□ 2.31
RCN3-201ENST00000270645 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP29.46■■■□□ 2.31
RCN3-201ENST00000270645 ATP7AQ04656 1500 aa29.45■■■□□ 2.3
RCN3-201ENST00000270645 TEX14Q8IWB6 1497 aa29.44■■■□□ 2.3
RCN3-201ENST00000270645 MAGI2Q86UL8 1455 aa29.43■■■□□ 2.3
RCN3-201ENST00000270645 IQGAP3Q86VI3 1631 aa29.4■■■□□ 2.3
RCN3-201ENST00000270645 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP29.4■■■□□ 2.35e-6■■■□□ 15.2
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RCN3-201ENST00000270645 NEO1Q92859 1461 aa29.37■■■□□ 2.29
RCN3-201ENST00000270645 GLI2P10070 1586 aa29.36■■■□□ 2.29
RCN3-201ENST00000270645 POGZQ7Z3K3 1410 aa29.34■■■□□ 2.29
RCN3-201ENST00000270645 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa29.33■■■□□ 2.29
RCN3-201ENST00000270645 MYT1LQ9UL68 1186 aa29.33■■■□□ 2.29
RCN3-201ENST00000270645 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP29.32■■■□□ 2.28
RCN3-201ENST00000270645 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa29.31■■■□□ 2.28
RCN3-201ENST00000270645 KDM5CP41229 1560 aa29.31■■■□□ 2.28
RCN3-201ENST00000270645 NBPF8Q3BBV2 869 aa29.29■■■□□ 2.28
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