RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000256413.7

CTIF-201, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTIF, Length 5,750 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-201ENST00000256413 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
CTIF-201ENST00000256413 CEP164Q9UPV0 1460 aa20.27■□□□□ 0.84
CTIF-201ENST00000256413 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
CTIF-201ENST00000256413 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
CTIF-201ENST00000256413 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
CTIF-201ENST00000256413 FAM13BQ9NYF5 915 aa20.24■□□□□ 0.83
CTIF-201ENST00000256413 PODXL2Q9NZ53 605 aa20.24■□□□□ 0.83
CTIF-201ENST00000256413 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
CTIF-201ENST00000256413 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
CTIF-201ENST00000256413 SCRIBQ14160 1630 aa20.22■□□□□ 0.83
CTIF-201ENST00000256413 IL27Q8NEV9 243 aa20.22■□□□□ 0.83
CTIF-201ENST00000256413 A0A0G2JS52 829 aa20.21■□□□□ 0.83
CTIF-201ENST00000256413 FGD1P98174 961 aa20.21■□□□□ 0.83
CTIF-201ENST00000256413 FAM161AQ3B820 660 aa20.21■□□□□ 0.83
CTIF-201ENST00000256413 SETD5Q9C0A6 1442 aa20.2■□□□□ 0.82
CTIF-201ENST00000256413 KCNJ4P48050 445 aa20.2■□□□□ 0.82
CTIF-201ENST00000256413 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa20.2■□□□□ 0.82
CTIF-201ENST00000256413 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
CTIF-201ENST00000256413 FAM43AQ8N2R8 423 aa20.18■□□□□ 0.82
CTIF-201ENST00000256413 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
CTIF-201ENST00000256413 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa20.17■□□□□ 0.82
CTIF-201ENST00000256413 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
CTIF-201ENST00000256413 PDE3BQ13370 1112 aa20.15■□□□□ 0.82
CTIF-201ENST00000256413 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa20.15■□□□□ 0.82
CTIF-201ENST00000256413 RALBP1Q15311 655 aa20.15■□□□□ 0.82
CTIF-201ENST00000256413 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.82
CTIF-201ENST00000256413 PHF14O94880 888 aa20.14■□□□□ 0.81
CTIF-201ENST00000256413 MAP7D2Q96T17 732 aa20.13■□□□□ 0.81
CTIF-201ENST00000256413 BRPF3Q9ULD4 1205 aa20.13■□□□□ 0.81
CTIF-201ENST00000256413 NFKBIBQ15653 356 aa20.13■□□□□ 0.81
CTIF-201ENST00000256413 TMF1P82094 1093 aa20.13■□□□□ 0.81
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CTIF-201ENST00000256413 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
CTIF-201ENST00000256413 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
CTIF-201ENST00000256413 FOXD4L1Q9NU39 408 aa20.12■□□□□ 0.81
CTIF-201ENST00000256413 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
CTIF-201ENST00000256413 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
CTIF-201ENST00000256413 TAOK2Q9UL54 1235 aa20.08■□□□□ 0.81
CTIF-201ENST00000256413 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
CTIF-201ENST00000256413 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
CTIF-201ENST00000256413 ZBED9Q6R2W3 1325 aa20.08■□□□□ 0.8
CTIF-201ENST00000256413 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
CTIF-201ENST00000256413 EXOC6Q8TAG9 804 aa20.07■□□□□ 0.8
CTIF-201ENST00000256413 TPM2P07951 284 aa20.07■□□□□ 0.8
CTIF-201ENST00000256413 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa20.06■□□□□ 0.8
CTIF-201ENST00000256413 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
CTIF-201ENST00000256413 SETQ01105 290 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
CTIF-201ENST00000256413 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP20.05■□□□□ 0.89e-6■■■■■ 50.1
CTIF-201ENST00000256413 VPS8Q8N3P4 1428 aa20.05■□□□□ 0.8
CTIF-201ENST00000256413 RRP1P56182 461 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
CTIF-201ENST00000256413 ITPRIPQ8IWB1 547 aa20.04■□□□□ 0.8
CTIF-201ENST00000256413 TPM4P67936 248 aa20.03■□□□□ 0.8
CTIF-201ENST00000256413 GOLGA2Q08379 1002 aa20.02■□□□□ 0.8
CTIF-201ENST00000256413 MRE11P49959 708 aa20■□□□□ 0.79
CTIF-201ENST00000256413 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa20■□□□□ 0.79
CTIF-201ENST00000256413 DCAF11Q8TEB1 546 aa20■□□□□ 0.79
CTIF-201ENST00000256413 CHMP5Q9NZZ3 219 aa20■□□□□ 0.79
CTIF-201ENST00000256413 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
CTIF-201ENST00000256413 ST18O60284 1047 aa19.98■□□□□ 0.79
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CTIF-201ENST00000256413 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP19.97■□□□□ 0.79
CTIF-201ENST00000256413 RRP9O43818 475 aaKnown RBP19.96■□□□□ 0.79
CTIF-201ENST00000256413 NLRP13Q86W25 1043 aa19.96■□□□□ 0.79
CTIF-201ENST00000256413 TEX35Q5T0J7 233 aa19.95■□□□□ 0.78
CTIF-201ENST00000256413 CRBNQ96SW2 442 aa19.95■□□□□ 0.78
CTIF-201ENST00000256413 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP19.95■□□□□ 0.78
CTIF-201ENST00000256413 MORC1Q86VD1 984 aa19.94■□□□□ 0.78
CTIF-201ENST00000256413 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP19.93■□□□□ 0.78
CTIF-201ENST00000256413 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP19.93■□□□□ 0.78
CTIF-201ENST00000256413 GPS2Q13227 327 aa19.93■□□□□ 0.78
CTIF-201ENST00000256413 PLIN1O60240 522 aa19.92■□□□□ 0.78
CTIF-201ENST00000256413 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP19.92■□□□□ 0.78
CTIF-201ENST00000256413 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP19.92■□□□□ 0.78
CTIF-201ENST00000256413 KIF16BQ96L93 1317 aa19.92■□□□□ 0.78
CTIF-201ENST00000256413 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP19.91■□□□□ 0.78
CTIF-201ENST00000256413 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa19.91■□□□□ 0.78
CTIF-201ENST00000256413 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP19.91■□□□□ 0.78
CTIF-201ENST00000256413 PHLDB1Q86UU1 1377 aa19.91■□□□□ 0.78
CTIF-201ENST00000256413 KIF27Q86VH2 1401 aa19.9■□□□□ 0.78
CTIF-201ENST00000256413 CLUAP1Q96AJ1 413 aa19.9■□□□□ 0.78
CTIF-201ENST00000256413 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP19.9■□□□□ 0.78
CTIF-201ENST00000256413 FHAD1B1AJZ9 1412 aa19.9■□□□□ 0.78
CTIF-201ENST00000256413 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP19.89■□□□□ 0.77
CTIF-201ENST00000256413 ZNF592Q92610 1267 aa19.88■□□□□ 0.77
CTIF-201ENST00000256413 CCDC66A2RUB6 948 aa19.88■□□□□ 0.77
CTIF-201ENST00000256413 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP19.88■□□□□ 0.77
CTIF-201ENST00000256413 SMC4Q9NTJ3 1288 aa19.87■□□□□ 0.77
CTIF-201ENST00000256413 SOGA1O94964 1423 aa19.87■□□□□ 0.77
CTIF-201ENST00000256413 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP19.87■□□□□ 0.77
CTIF-201ENST00000256413 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP19.87■□□□□ 0.77
CTIF-201ENST00000256413 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP19.86■□□□□ 0.77
CTIF-201ENST00000256413 PLEKHD1A6NEE1 506 aa19.86■□□□□ 0.77
CTIF-201ENST00000256413 APPP05067 770 aa19.86■□□□□ 0.77
CTIF-201ENST00000256413 NASPP49321 788 aaPredicted RBP19.85■□□□□ 0.77
CTIF-201ENST00000256413 RBM10P98175 930 aaKnown RBP19.85■□□□□ 0.77
CTIF-201ENST00000256413 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP19.85■□□□□ 0.77
CTIF-201ENST00000256413 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP19.84■□□□□ 0.77
CTIF-201ENST00000256413 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa19.84■□□□□ 0.77
CTIF-201ENST00000256413 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP19.84■□□□□ 0.77
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