RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249440.4

HOXD3-201, Transcript of homeobox D3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD3, Length 2,303 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD3-201ENST00000249440 ROCK1Q13464 1354 aa23.06■■□□□ 1.28
HOXD3-201ENST00000249440 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa23.05■■□□□ 1.28
HOXD3-201ENST00000249440 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
HOXD3-201ENST00000249440 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
HOXD3-201ENST00000249440 DAPK1P53355 1430 aa23.04■■□□□ 1.28
HOXD3-201ENST00000249440 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
HOXD3-201ENST00000249440 CLASP1Q7Z460 1538 aa23.02■■□□□ 1.28
HOXD3-201ENST00000249440 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
HOXD3-201ENST00000249440 ABCC5O15440 1437 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXD3-201ENST00000249440 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
HOXD3-201ENST00000249440 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP22.96■■□□□ 1.27
HOXD3-201ENST00000249440 SHROOM2Q13796 1616 aa22.94■■□□□ 1.26
HOXD3-201ENST00000249440 MYT1Q01538 1121 aa22.94■■□□□ 1.26
HOXD3-201ENST00000249440 L3MBTL2Q969R5 705 aa22.94■■□□□ 1.26
HOXD3-201ENST00000249440 WASHC2AQ641Q2 1341 aa22.93■■□□□ 1.26
HOXD3-201ENST00000249440 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
HOXD3-201ENST00000249440 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXD3-201ENST00000249440 FKBP8Q14318 412 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXD3-201ENST00000249440 OSCARQ8IYS5 282 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXD3-201ENST00000249440 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
HOXD3-201ENST00000249440 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
HOXD3-201ENST00000249440 FOXD1Q16676 465 aa22.91■■□□□ 1.26
HOXD3-201ENST00000249440 ITSN2Q9NZM3 1697 aa22.9■■□□□ 1.26
HOXD3-201ENST00000249440 NEFLP07196 543 aa22.9■■□□□ 1.26
HOXD3-201ENST00000249440 PLB1Q6P1J6 1458 aa22.88■■□□□ 1.25
HOXD3-201ENST00000249440 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
HOXD3-201ENST00000249440 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
HOXD3-201ENST00000249440 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa22.86■■□□□ 1.25
HOXD3-201ENST00000249440 ADCY10Q96PN6 1610 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXD3-201ENST00000249440 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXD3-201ENST00000249440 ADGBQ8N7X0 1667 aa22.84■■□□□ 1.25
HOXD3-201ENST00000249440 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa22.83■■□□□ 1.25
HOXD3-201ENST00000249440 TEX14Q8IWB6 1497 aa22.83■■□□□ 1.25
HOXD3-201ENST00000249440 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.24
HOXD3-201ENST00000249440 BCANQ96GW7 911 aa22.82■■□□□ 1.24
HOXD3-201ENST00000249440 CNTLNQ9NXG0 1405 aa22.82■■□□□ 1.24
HOXD3-201ENST00000249440 NCOA1Q15788 1441 aa22.81■■□□□ 1.24
HOXD3-201ENST00000249440 KIF14Q15058 1648 aa22.79■■□□□ 1.24
HOXD3-201ENST00000249440 CROCC2H7BZ55 1655 aa22.78■■□□□ 1.24
HOXD3-201ENST00000249440 ADGRL2O95490 1459 aa22.78■■□□□ 1.24
HOXD3-201ENST00000249440 CCDC7Q96M83 1385 aa22.78■■□□□ 1.24
HOXD3-201ENST00000249440 NBPF8Q3BBV2 869 aa22.77■■□□□ 1.24
HOXD3-201ENST00000249440 PZPP20742 1482 aa22.77■■□□□ 1.24
HOXD3-201ENST00000249440 PTPRGP23470 1445 aa22.76■■□□□ 1.23
HOXD3-201ENST00000249440 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP22.76■■□□□ 1.23
HOXD3-201ENST00000249440 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
HOXD3-201ENST00000249440 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
HOXD3-201ENST00000249440 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
HOXD3-201ENST00000249440 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa22.74■■□□□ 1.23
HOXD3-201ENST00000249440 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa22.73■■□□□ 1.23
HOXD3-201ENST00000249440 PLEKHD1A6NEE1 506 aa22.71■■□□□ 1.23
HOXD3-201ENST00000249440 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa22.71■■□□□ 1.23
HOXD3-201ENST00000249440 ABCA8O94911 1581 aa22.71■■□□□ 1.23
HOXD3-201ENST00000249440 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
HOXD3-201ENST00000249440 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa22.68■■□□□ 1.22
HOXD3-201ENST00000249440 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa22.66■■□□□ 1.22
HOXD3-201ENST00000249440 KIF7Q2M1P5 1343 aa22.65■■□□□ 1.22
HOXD3-201ENST00000249440 MBD5Q9P267 1494 aa22.64■■□□□ 1.22
HOXD3-201ENST00000249440 SHANK2Q9UPX8 1470 aa22.64■■□□□ 1.22
HOXD3-201ENST00000249440 ABCC10Q5T3U5 1492 aa22.64■■□□□ 1.21
HOXD3-201ENST00000249440 PKD2Q13563 968 aa22.64■■□□□ 1.21
HOXD3-201ENST00000249440 ATP10BO94823 1461 aa22.63■■□□□ 1.21
HOXD3-201ENST00000249440 CCDC184Q52MB2 194 aa22.6■■□□□ 1.21
HOXD3-201ENST00000249440 C9orf84Q5VXU9 1444 aa22.6■■□□□ 1.21
HOXD3-201ENST00000249440 MRS2Q9HD23 443 aa22.59■■□□□ 1.21
HOXD3-201ENST00000249440 TSPY4P0CV99 314 aa22.58■■□□□ 1.21
HOXD3-201ENST00000249440 TSPY10P0CW01 314 aa22.58■■□□□ 1.21
HOXD3-201ENST00000249440 NUP155O75694 1391 aa22.56■■□□□ 1.2
HOXD3-201ENST00000249440 USP47Q96K76 1375 aa22.55■■□□□ 1.2
HOXD3-201ENST00000249440 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa22.55■■□□□ 1.2
HOXD3-201ENST00000249440 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa22.55■■□□□ 1.2
HOXD3-201ENST00000249440 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa22.55■■□□□ 1.2
HOXD3-201ENST00000249440 FAM9BQ8IZU0 186 aa22.55■■□□□ 1.2
HOXD3-201ENST00000249440 ABCC2Q92887 1545 aa22.54■■□□□ 1.2
HOXD3-201ENST00000249440 KDM5DQ9BY66 1539 aa22.54■■□□□ 1.2
HOXD3-201ENST00000249440 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
HOXD3-201ENST00000249440 ARHGEF5Q12774 1597 aa22.53■■□□□ 1.2
HOXD3-201ENST00000249440 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
HOXD3-201ENST00000249440 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa22.52■■□□□ 1.2
HOXD3-201ENST00000249440 KDM5CP41229 1560 aa22.52■■□□□ 1.2
HOXD3-201ENST00000249440 ZBED9Q6R2W3 1325 aa22.51■■□□□ 1.19
HOXD3-201ENST00000249440 ERICH6BQ5W0A0 696 aa22.51■■□□□ 1.19
HOXD3-201ENST00000249440 CYB5RLQ6IPT4 315 aa22.51■■□□□ 1.19
HOXD3-201ENST00000249440 BCORL1Q5H9F3 1711 aa22.5■■□□□ 1.19
HOXD3-201ENST00000249440 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa22.5■■□□□ 1.19
HOXD3-201ENST00000249440 KIF15Q9NS87 1388 aa22.49■■□□□ 1.19
HOXD3-201ENST00000249440 RALGAPBQ86X10 1494 aa22.48■■□□□ 1.19
HOXD3-201ENST00000249440 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
HOXD3-201ENST00000249440 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP22.47■■□□□ 1.19
HOXD3-201ENST00000249440 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
HOXD3-201ENST00000249440 RSPH4AQ5TD94 716 aa22.46■■□□□ 1.19
HOXD3-201ENST00000249440 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa22.45■■□□□ 1.18
HOXD3-201ENST00000249440 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
HOXD3-201ENST00000249440 PREX2Q70Z35 1606 aa22.44■■□□□ 1.18
HOXD3-201ENST00000249440 CCDC141Q6ZP82 1450 aa22.44■■□□□ 1.18
HOXD3-201ENST00000249440 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
HOXD3-201ENST00000249440 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
HOXD3-201ENST00000249440 CARD11Q9BXL7 1154 aa22.42■■□□□ 1.18
HOXD3-201ENST00000249440 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa22.42■■□□□ 1.18
HOXD3-201ENST00000249440 POLR3GLQ9BT43 218 aa22.42■■□□□ 1.18
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