RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000222753.5

HOXA13-201, Transcript of homeobox A13, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXA13, Length 5,030 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13-201ENST00000222753 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
HOXA13-201ENST00000222753 PKD2Q13563 968 aa23.7■■□□□ 1.39
HOXA13-201ENST00000222753 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
HOXA13-201ENST00000222753 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
HOXA13-201ENST00000222753 L3MBTL2Q969R5 705 aa23.68■■□□□ 1.38
HOXA13-201ENST00000222753 GBP4Q96PP9 640 aa23.67■■□□□ 1.38
HOXA13-201ENST00000222753 ZBED9Q6R2W3 1325 aa23.66■■□□□ 1.38
HOXA13-201ENST00000222753 NLRP13Q86W25 1043 aa23.66■■□□□ 1.38
HOXA13-201ENST00000222753 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa23.65■■□□□ 1.38
HOXA13-201ENST00000222753 WIZO95785 1651 aa23.64■■□□□ 1.38
HOXA13-201ENST00000222753 FOXD1Q16676 465 aa23.64■■□□□ 1.37
HOXA13-201ENST00000222753 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
HOXA13-201ENST00000222753 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23.61■■□□□ 1.37
HOXA13-201ENST00000222753 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
HOXA13-201ENST00000222753 PHLDB1Q86UU1 1377 aa23.6■■□□□ 1.37
HOXA13-201ENST00000222753 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
HOXA13-201ENST00000222753 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa23.59■■□□□ 1.37
HOXA13-201ENST00000222753 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
HOXA13-201ENST00000222753 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
HOXA13-201ENST00000222753 MORC1Q86VD1 984 aa23.59■■□□□ 1.37
HOXA13-201ENST00000222753 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa23.58■■□□□ 1.37
HOXA13-201ENST00000222753 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.36
HOXA13-201ENST00000222753 PLCB2Q00722 1185 aa23.57■■□□□ 1.36
HOXA13-201ENST00000222753 GOLGA2Q08379 1002 aa23.56■■□□□ 1.36
HOXA13-201ENST00000222753 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa23.56■■□□□ 1.36
HOXA13-201ENST00000222753 PDE4AP27815 886 aa23.56■■□□□ 1.36
HOXA13-201ENST00000222753 C14orf37Q86TY3 774 aa23.56■■□□□ 1.36
HOXA13-201ENST00000222753 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
HOXA13-201ENST00000222753 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
HOXA13-201ENST00000222753 KIF15Q9NS87 1388 aa23.55■■□□□ 1.36
HOXA13-201ENST00000222753 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa23.54■■□□□ 1.36
HOXA13-201ENST00000222753 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa23.53■■□□□ 1.36
HOXA13-201ENST00000222753 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa23.53■■□□□ 1.36
HOXA13-201ENST00000222753 MCCP23508 829 aa23.53■■□□□ 1.36
HOXA13-201ENST00000222753 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
HOXA13-201ENST00000222753 NRDCO43847 1150 aa23.52■■□□□ 1.36
HOXA13-201ENST00000222753 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
HOXA13-201ENST00000222753 NUP155O75694 1391 aa23.51■■□□□ 1.35
HOXA13-201ENST00000222753 POGKQ9P215 609 aa23.51■■□□□ 1.35
HOXA13-201ENST00000222753 KANK1Q14678 1352 aa23.5■■□□□ 1.35
HOXA13-201ENST00000222753 GSE1Q14687 1217 aa23.5■■□□□ 1.35
HOXA13-201ENST00000222753 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
HOXA13-201ENST00000222753 RSPH6AQ9H0K4 717 aa23.5■■□□□ 1.35
HOXA13-201ENST00000222753 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
HOXA13-201ENST00000222753 ZBTB7CA1YPR0 619 aa23.49■■□□□ 1.35
HOXA13-201ENST00000222753 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa23.49■■□□□ 1.35
HOXA13-201ENST00000222753 TPRNQ4KMQ1 711 aa23.48■■□□□ 1.35
HOXA13-201ENST00000222753 RRP1P56182 461 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
HOXA13-201ENST00000222753 CADPSQ9ULU8 1353 aa23.47■■□□□ 1.35
HOXA13-201ENST00000222753 FAM161AQ3B820 660 aa23.47■■□□□ 1.35
HOXA13-201ENST00000222753 PLEKHG5O94827 1062 aa23.46■■□□□ 1.35
HOXA13-201ENST00000222753 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa23.44■■□□□ 1.34
HOXA13-201ENST00000222753 FHOD3Q2V2M9 1422 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXA13-201ENST00000222753 KIAA2012Q0VF49 1180 aa23.42■■□□□ 1.34
HOXA13-201ENST00000222753 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
HOXA13-201ENST00000222753 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
HOXA13-201ENST00000222753 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
HOXA13-201ENST00000222753 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.4■■□□□ 1.34
HOXA13-201ENST00000222753 EXOC6Q8TAG9 804 aa23.4■■□□□ 1.34
HOXA13-201ENST00000222753 CCDC18Q5T9S5 1454 aa23.4■■□□□ 1.34
HOXA13-201ENST00000222753 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
HOXA13-201ENST00000222753 ITPRIPQ8IWB1 547 aa23.39■■□□□ 1.33
HOXA13-201ENST00000222753 KCNJ4P48050 445 aa23.38■■□□□ 1.33
HOXA13-201ENST00000222753 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
HOXA13-201ENST00000222753 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
HOXA13-201ENST00000222753 DDX11L8A8MPP1 907 aa23.37■■□□□ 1.33
HOXA13-201ENST00000222753 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
HOXA13-201ENST00000222753 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP23.36■■□□□ 1.33
HOXA13-201ENST00000222753 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
HOXA13-201ENST00000222753 A0A0G2JS52 829 aa23.34■■□□□ 1.33
HOXA13-201ENST00000222753 FGD1P98174 961 aa23.34■■□□□ 1.33
HOXA13-201ENST00000222753 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.32
HOXA13-201ENST00000222753 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa23.31■■□□□ 1.32
HOXA13-201ENST00000222753 CGNL1Q0VF96 1302 aa23.3■■□□□ 1.32
HOXA13-201ENST00000222753 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa23.3■■□□□ 1.32
HOXA13-201ENST00000222753 SMC4Q9NTJ3 1288 aa23.3■■□□□ 1.32
HOXA13-201ENST00000222753 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
HOXA13-201ENST00000222753 USP47Q96K76 1375 aa23.29■■□□□ 1.32
HOXA13-201ENST00000222753 RSPH4AQ5TD94 716 aa23.29■■□□□ 1.32
HOXA13-201ENST00000222753 SMARCA4P51532 1647 aa23.29■■□□□ 1.32
HOXA13-201ENST00000222753 CRBNQ96SW2 442 aa23.29■■□□□ 1.32
HOXA13-201ENST00000222753 DRC7Q8IY82 874 aa23.28■■□□□ 1.32
HOXA13-201ENST00000222753 GGT6Q6P531 493 aa23.28■■□□□ 1.32
HOXA13-201ENST00000222753 CCDC7Q96M83 1385 aa23.26■■□□□ 1.31
HOXA13-201ENST00000222753 CNTLNQ9NXG0 1405 aa23.26■■□□□ 1.31
HOXA13-201ENST00000222753 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
HOXA13-201ENST00000222753 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
HOXA13-201ENST00000222753 NGEFQ8N5V2 710 aa23.26■■□□□ 1.31
HOXA13-201ENST00000222753 E9PSI1 815 aa23.25■■□□□ 1.31
HOXA13-201ENST00000222753 SLC4A3P48751 1232 aa23.25■■□□□ 1.31
HOXA13-201ENST00000222753 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa23.24■■□□□ 1.31
HOXA13-201ENST00000222753 CCDC146Q8IYE0 955 aa23.24■■□□□ 1.31
HOXA13-201ENST00000222753 UACAQ9BZF9 1416 aa23.24■■□□□ 1.31
HOXA13-201ENST00000222753 HDGFP51858 240 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
HOXA13-201ENST00000222753 CLUAP1Q96AJ1 413 aa23.24■■□□□ 1.31
HOXA13-201ENST00000222753 PLIN1O60240 522 aa23.23■■□□□ 1.31
HOXA13-201ENST00000222753 KIF21BO75037 1637 aa23.23■■□□□ 1.31
HOXA13-201ENST00000222753 MLECQ14165 292 aa23.23■■□□□ 1.31
HOXA13-201ENST00000222753 PANK3Q9H999 370 aa23.22■■□□□ 1.31
HOXA13-201ENST00000222753 LMOD2Q6P5Q4 547 aa23.2■■□□□ 1.3
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