RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000088512.11

Rnps1-201, Transcript of RNA-binding protein with serine-rich domain 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Rnps1, Length 1,798 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Exosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Sall2Q9QX96 1004 aa18.68■□□□□ 0.58
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Caskin1Q6P9K8 1431 aa18.66■□□□□ 0.58
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Gm14025A2AP89 1413 aa18.66■□□□□ 0.58
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Chic2Q9D9G3 165 aa18.65■□□□□ 0.58
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Adcy10Q8C0T9 1614 aa18.64■□□□□ 0.58
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Ube2uB1AUC4 352 aa18.64■□□□□ 0.57
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Fancd2Q80V62 1450 aa18.64■□□□□ 0.57
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Mroh2aD3Z750 1679 aa18.64■□□□□ 0.57
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Rnps1-201ENSMUST00000088512 Arhgef40Q3UPH7 1517 aa18.62■□□□□ 0.57
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Rnps1-201ENSMUST00000088512 Wdr7Q920I9 1489 aa18.6■□□□□ 0.57
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Prex2Q3LAC4 1598 aa18.58■□□□□ 0.57
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Rnps1-201ENSMUST00000088512 Kiaa1210E9Q0C6 1637 aa18.56■□□□□ 0.56
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Kdm3bQ6ZPY7 1562 aa18.56■□□□□ 0.56
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Rnps1-201ENSMUST00000088512 Kdm6bQ5NCY0 1641 aa18.51■□□□□ 0.55
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Setbp1Q9Z180 1582 aa18.51■□□□□ 0.55
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Rnps1-201ENSMUST00000088512 Rnf17Q99MV7 1640 aa18.47■□□□□ 0.55
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Rnps1-201ENSMUST00000088512 SphkapQ6NSW3 1687 aa18.44■□□□□ 0.54
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Neurl4Q5NCX5 1563 aa18.44■□□□□ 0.54
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Adgrl2Q8JZZ7 1487 aa18.42■□□□□ 0.54
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Fmn2Q9JL04 1578 aa18.42■□□□□ 0.54
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Naip5Q9R016 1403 aa18.41■□□□□ 0.54
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Gm13697A2AK42 830 aa18.41■□□□□ 0.54
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Arhgap5P97393 1501 aa18.41■□□□□ 0.54
Rnps1-201ENSMUST00000088512 DroshaQ5HZJ0 1373 aaKnown RBP18.4■□□□□ 0.54
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Clstn2Q9ER65 966 aa18.4■□□□□ 0.54
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Adgrb2Q8CGM1 1561 aa18.4■□□□□ 0.54
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Pdcd11Q6NS46 1862 aaKnown RBP18.39■□□□□ 0.53
Rnps1-201ENSMUST00000088512 AlkP97793 1621 aa18.38■□□□□ 0.53
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Pkd2O35245 966 aa18.37■□□□□ 0.53
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Rprd2Q6NXI6 1469 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Kif21bQ9QXL1 1668 aa18.37■□□□□ 0.53
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Mast1Q9R1L5 1570 aa18.37■□□□□ 0.53
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Abca8bQ8K440 1620 aa18.37■□□□□ 0.53
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Gm32742A0A1B0GT42 1604 aa18.35■□□□□ 0.53
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Atp10dQ8K2X1 1416 aa18.35■□□□□ 0.53
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Rnps1-201ENSMUST00000088512 Trpm2Q91YD4 1506 aa18.33■□□□□ 0.53
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Hecw1Q8K4P8 1604 aa18.33■□□□□ 0.53
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Rnps1-201ENSMUST00000088512 Ythdc2B2RR83 1445 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.52
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Zfp644E9QA22 1323 aa18.32■□□□□ 0.52
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Prdm16A2A935 1275 aa18.32■□□□□ 0.52
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Usp47Q8BY87 1376 aa18.32■□□□□ 0.52
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Abcc3B2RX12 1523 aa18.3■□□□□ 0.52
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Pprc1Q6NZN1 1644 aa18.29■□□□□ 0.52
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Lrrc9Q8CDN9 1456 aa18.29■□□□□ 0.52
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Sart1Q9Z315 806 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Pabpn1Q8CCS6 302 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Hdac5Q9Z2V6 1113 aa18.27■□□□□ 0.51
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Map4P27546 1125 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Nop58Q6DFW4 536 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Gapvd1Q6PAR5 1458 aa18.25■□□□□ 0.51
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Ttll5Q8CHB8 1328 aa18.25■□□□□ 0.51
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Trappc8E9PWG2 1437 aa18.25■□□□□ 0.51
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Rrp7aQ9D1C9 280 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
Rnps1-201ENSMUST00000088512 AI481877A2ALV5 1481 aa18.24■□□□□ 0.51
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Trak1Q6PD31 939 aa18.22■□□□□ 0.51
Rnps1-201ENSMUST00000088512 PtprgQ05909 1442 aa18.21■□□□□ 0.51
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Ssh2Q5SW75 1423 aa18.2■□□□□ 0.5
Rnps1-201ENSMUST00000088512 PtprtQ99M80 1454 aa18.18■□□□□ 0.5
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Supt6hQ62383 1726 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Ppargc1bQ8VHJ7 1014 aa18.17■□□□□ 0.5
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Rnps1-201ENSMUST00000088512 Cdc42bpbQ7TT50 1713 aa18.14■□□□□ 0.49
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Rock1P70335 1354 aa18.14■□□□□ 0.49
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Dhx9O70133 1380 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Kidins220E9Q9B7 1793 aa18.12■□□□□ 0.49
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Cwc22Q8C5N3 908 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Cep170Q6A065 1588 aa18.11■□□□□ 0.49
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Zfyve16Q80U44 1528 aa18.11■□□□□ 0.49
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Neurod1Q60867 357 aa18.11■□□□□ 0.49
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Znf608Q56A10 1511 aa18.11■□□□□ 0.49
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Lemd3Q9WU40 921 aa18.09■□□□□ 0.49
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Cd109Q8R422 1442 aa18.09■□□□□ 0.49
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Stra8P70278 393 aa18.09■□□□□ 0.49
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Ppip5k1A2ARP1 1436 aa18.09■□□□□ 0.49
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Ifnlr1Q8CGK5 535 aa18.08■□□□□ 0.48
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Nsd2Q8BVE8 1365 aa18.08■□□□□ 0.48
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Rnps1-201ENSMUST00000088512 Abca17E9PX95 1733 aa18.05■□□□□ 0.48
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