RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000075017.4

Vpreb1-201, Transcript of Immunoglobulin iota chain, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Vpreb1, Length 766 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Prex2Q3LAC4 1598 aa27.25■■□□□ 1.95
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Dhx57Q6P5D3 1388 aaKnown RBP27.24■■□□□ 1.95
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Naip2Q9QUK4 1447 aa27.24■■□□□ 1.95
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Ncoa3O09000 1398 aa27.2■■□□□ 1.94
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Eea1Q8BL66 1411 aa27.19■■□□□ 1.94
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Synj2Q9D2G5 1434 aa27.19■■□□□ 1.94
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Mug1P28665 1476 aa27.13■■□□□ 1.93
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Hecw2Q6I6G8 1578 aa27.11■■□□□ 1.93
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Erich3F6QRE9 1637 aa27.11■■□□□ 1.93
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Lmo7E9PYF4 1699 aaKnown RBP27.11■■□□□ 1.93
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Lemd3Q9WU40 921 aa27.09■■□□□ 1.93
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Abca9Q8K449 1623 aa27.08■■□□□ 1.93
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Brwd3A2AHJ4 1799 aa27.08■■□□□ 1.93
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Pcf11G3X9Z4 1553 aa27.07■■□□□ 1.92
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Ncapd3Q6ZQK0 1506 aa27.06■■□□□ 1.92
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Fam208aQ69ZR9 1610 aaKnown RBP27.03■■□□□ 1.92
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Arhgap5P97393 1501 aa27.01■■□□□ 1.91
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Safb2Q80YR5 991 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.91
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 CntlnA2AM05 1397 aa27■■□□□ 1.91
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 MyclP10166 368 aa27■■□□□ 1.91
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Lmod2Q3UHZ5 550 aa27■■□□□ 1.91
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Kif14L0N7N1 1674 aaKnown RBP27■■□□□ 1.91
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Kiaa1551Q5DTW7 1521 aa27■■□□□ 1.91
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 OvosQ3UU35 1456 aa27■■□□□ 1.91
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Kiaa0556Q8C753 1610 aa26.99■■□□□ 1.91
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Qser1A2BIE1 1698 aa26.94■■□□□ 1.9
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Cdc42bpaQ3UU96 1719 aa26.93■■□□□ 1.9
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Ercc6l2Q9JIM3 1537 aa26.92■■□□□ 1.9
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 NpatQ8BMA5 1420 aa26.9■■□□□ 1.9
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Atp10aO54827 1508 aa26.9■■□□□ 1.9
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Camsap2Q8C1B1 1461 aa26.89■■□□□ 1.9
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Yeats2Q3TUF7 1407 aa26.88■■□□□ 1.89
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Ptch1Q61115 1434 aa26.88■■□□□ 1.89
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 PtprmP28828 1452 aa26.86■■□□□ 1.89
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Neurl4Q5NCX5 1563 aa26.81■■□□□ 1.88
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Adamtsl3G3UXC7 1706 aa26.8■■□□□ 1.88
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Gm1043A0A140LJC2 1431 aa26.8■■□□□ 1.88
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Tdrd9Q14BI7 1383 aa26.79■■□□□ 1.88
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 NexmifQ5DTT1 1515 aa26.79■■□□□ 1.88
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Trappc8E9PWG2 1437 aa26.77■■□□□ 1.88
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Kidins220E9Q9B7 1793 aa26.76■■□□□ 1.87
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Dip2cE9PWR4 1557 aa26.75■■□□□ 1.87
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Kdm5cP41230 1554 aa26.74■■□□□ 1.87
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Zmym4A2A791 1549 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 RereQ80TZ9 1558 aa26.72■■□□□ 1.87
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Sart1Q9Z315 806 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Cfap74Q3UY96 1578 aa26.7■■□□□ 1.86
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Naip1Q9QWK5 1403 aa26.67■■□□□ 1.86
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Tiam1Q60610 1591 aa26.67■■□□□ 1.86
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Abcc3B2RX12 1523 aa26.66■■□□□ 1.86
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Peg3Q3URU2 1571 aa26.66■■□□□ 1.86
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Caskin1Q6P9K8 1431 aa26.65■■□□□ 1.86
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Cdk11bP24788 784 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Cul9Q80TT8 1865 aa26.64■■□□□ 1.85
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Ahdc1Q6PAL7 1594 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Dennd4bQ3U1Y4 1499 aa26.61■■□□□ 1.85
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Gm32742A0A1B0GT42 1604 aa26.61■■□□□ 1.85
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Supt6hQ62383 1726 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Cfap65Q3V0B4 1847 aa26.58■■□□□ 1.84
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Ccnb3Q810T2 1396 aa26.58■■□□□ 1.84
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Adcy10Q8C0T9 1614 aa26.57■■□□□ 1.84
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Afap1Q80YS6 731 aa26.56■■□□□ 1.84
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Pdcd11Q6NS46 1862 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 SphkapQ6NSW3 1687 aa26.52■■□□□ 1.84
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Talpid3E9PV87 1520 aa26.51■■□□□ 1.83
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Map3k5O35099 1380 aa26.48■■□□□ 1.83
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Fbxo41Q6NS60 873 aa26.48■■□□□ 1.83
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Arhgef40Q3UPH7 1517 aa26.48■■□□□ 1.83
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Hecw1Q8K4P8 1604 aa26.46■■□□□ 1.83
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Lmtk2Q3TYD6 1471 aa26.45■■□□□ 1.82
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Myom2Q14BI5 1463 aa26.43■■□□□ 1.82
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Abca6Q8K441 1624 aa26.43■■□□□ 1.82
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Cdc42bpbQ7TT50 1713 aa26.41■■□□□ 1.82
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Cdc42bpgQ80UW5 1551 aa26.41■■□□□ 1.82
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Rrp7aQ9D1C9 280 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.82
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 4930407I10RikD3Z5T8 1512 aa26.37■■□□□ 1.81
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Rsph4aQ8BYM7 716 aa26.36■■□□□ 1.81
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Nos1Q9Z0J4 1429 aa26.36■■□□□ 1.81
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Gli2Q0VGT2 1544 aa26.35■■□□□ 1.81
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Prdm16A2A935 1275 aa26.33■■□□□ 1.81
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Trpm1Q2TV84 1622 aa26.32■■□□□ 1.8
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Naip6Q9JIB6 1403 aa26.32■■□□□ 1.8
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Pip4k2bQ80XI4 416 aa26.32■■□□□ 1.8
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Trpm2Q91YD4 1506 aa26.32■■□□□ 1.8
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Fhod3Q76LL6 1578 aa26.32■■□□□ 1.8
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Gm13697A2AK42 830 aa26.3■■□□□ 1.8
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Kif3bQ61771 747 aa26.3■■□□□ 1.8
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Mtus2Q3UHD3 1353 aa26.26■■□□□ 1.79
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Znf518aB2RRF6 1478 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Dip2bQ3UH60 1574 aa26.24■■□□□ 1.79
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Dip2aQ8BWT5 1523 aa26.24■■□□□ 1.79
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Topaz1E5FYH1 1653 aa26.21■■□□□ 1.79
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 CltcQ68FD5 1675 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Scn4aQ9ER60 1841 aa26.21■■□□□ 1.79
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Fmn2Q9JL04 1578 aa26.18■■□□□ 1.78
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Bcl9Q9D219 1425 aa26.16■■□□□ 1.78
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 GphnQ8BUV3 769 aaKnown RBP26.15■■□□□ 1.78
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Abcc5Q9R1X5 1436 aa26.14■■□□□ 1.78
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Plekhh2Q8C115 1491 aa26.14■■□□□ 1.78
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Zbtb7cQ8VCZ7 619 aa26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 61 ms