RNA–Protein interactions for RNA: YPR094W

RDS3, Transcript of Component of the SF3b subcomplex of the U2 snRNP, yeastyeast

Gene RDS3, Length 324 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RDS3YPR094W SMY1P32364 656 aaKnown RBP0.14□□□□□ -2.39
RDS3YPR094W GLC7P32598 312 aaKnown RBP0.14□□□□□ -2.39
RDS3YPR094W UTR4P32626 227 aa0.14□□□□□ -2.39
RDS3YPR094W PRY2P36110 329 aa0.14□□□□□ -2.39
RDS3YPR094W DTR1P38125 572 aa0.14□□□□□ -2.39
RDS3YPR094W YPT35P38815 214 aaKnown RBP0.14□□□□□ -2.39
RDS3YPR094W YER186CP40101 306 aa0.14□□□□□ -2.39
RDS3YPR094W SEC24P40482 926 aaKnown RBP0.14□□□□□ -2.39
RDS3YPR094W COG1P53079 417 aa0.14□□□□□ -2.39
RDS3YPR094W DSD1P53095 428 aa0.14□□□□□ -2.39
RDS3YPR094W CWC25P53854 179 aaKnown RBP0.14□□□□□ -2.39
RDS3YPR094W IBD2P53892 351 aa0.14□□□□□ -2.39
RDS3YPR094W TEP1P53916 434 aa0.14□□□□□ -2.39
RDS3YPR094W TY2A-DR2Q03483 438 aa0.14□□□□□ -2.39
RDS3YPR094W HER2Q03557 464 aa0.14□□□□□ -2.39
RDS3YPR094W YDL057WQ07379 328 aa0.14□□□□□ -2.39
RDS3YPR094W TEN1Q07921 160 aa0.14□□□□□ -2.39
RDS3YPR094W TY2A-BQ12260 438 aa0.14□□□□□ -2.39
RDS3YPR094W TY2A-OR2Q12293 438 aa0.14□□□□□ -2.39
RDS3YPR094W RKM5Q12367 367 aa0.14□□□□□ -2.39
RDS3YPR094W TY2A-DR1Q12392 438 aa0.14□□□□□ -2.39
RDS3YPR094W AHC1Q12433 566 aa0.14□□□□□ -2.39
RDS3YPR094W TY2A-OR1Q12439 438 aa0.14□□□□□ -2.39
RDS3YPR094W TMA17Q12513 150 aa0.14□□□□□ -2.39
RDS3YPR094W TY2A-DR3Q99303 438 aa0.14□□□□□ -2.39
RDS3YPR094W PSK1P31374 1356 aa0.14□□□□□ -2.39
RDS3YPR094W TY1B-AO13527 1196 aaKnown RBP0.13□□□□□ -2.39
RDS3YPR094W PIF1P07271 859 aa0.13□□□□□ -2.39
RDS3YPR094W NCP1P16603 691 aaKnown RBP0.13□□□□□ -2.39
RDS3YPR094W SPO7P18410 259 aa0.13□□□□□ -2.39
RDS3YPR094W EXO70P19658 623 aa0.13□□□□□ -2.39
RDS3YPR094W KGD1P20967 1014 aaKnown RBP0.13□□□□□ -2.39
RDS3YPR094W ERG8P24521 451 aa0.13□□□□□ -2.39
RDS3YPR094W BUD5P25300 642 aaPredicted RBP0.13□□□□□ -2.39
RDS3YPR094W CDC15P27636 974 aa0.13□□□□□ -2.39
RDS3YPR094W SYN8P31377 255 aa0.13□□□□□ -2.39
RDS3YPR094W NPL6P32832 435 aa0.13□□□□□ -2.39
RDS3YPR094W FRE2P36033 711 aa0.13□□□□□ -2.39
RDS3YPR094W YKL023WP36103 277 aaKnown RBP0.13□□□□□ -2.39
RDS3YPR094W DIA4P38705 446 aaPredicted RBP0.13□□□□□ -2.39
RDS3YPR094W UME6P39001 836 aa0.13□□□□□ -2.39
RDS3YPR094W PSD1P39006 500 aa0.13□□□□□ -2.39
RDS3YPR094W AIM10P39965 576 aaKnown RBP0.13□□□□□ -2.39
RDS3YPR094W BUR6P40096 142 aa0.13□□□□□ -2.39
RDS3YPR094W PUG1P40100 303 aa0.13□□□□□ -2.39
RDS3YPR094W PFK26P40433 827 aaKnown RBP0.13□□□□□ -2.39
RDS3YPR094W IME4P41833 600 aa0.13□□□□□ -2.39
RDS3YPR094W PGU1P47180 361 aa0.13□□□□□ -2.39
RDS3YPR094W PEX14P53112 341 aa0.13□□□□□ -2.39
RDS3YPR094W POP6P53218 158 aa0.13□□□□□ -2.39
RDS3YPR094W CRH1P53301 507 aa0.13□□□□□ -2.39
RDS3YPR094W HXT11P54862 567 aa0.13□□□□□ -2.39
RDS3YPR094W MRPS16Q02608 121 aa0.13□□□□□ -2.39
RDS3YPR094W MSC1Q03104 513 aa0.13□□□□□ -2.39
RDS3YPR094W ECM7Q06200 448 aa0.13□□□□□ -2.39
RDS3YPR094W YPR195CQ06594 109 aa0.13□□□□□ -2.39
RDS3YPR094W BRE1Q07457 700 aaKnown RBP0.13□□□□□ -2.39
RDS3YPR094W IRC25Q07951 179 aa0.13□□□□□ -2.39
RDS3YPR094W YOR365CQ08844 703 aa0.13□□□□□ -2.39
RDS3YPR094W COX17Q12287 69 aa0.13□□□□□ -2.39
RDS3YPR094W VCX1Q99385 411 aa0.13□□□□□ -2.39
RDS3YPR094W YTA7P40340 1379 aa0.13□□□□□ -2.39
RDS3YPR094W TRP1P00912 224 aa0.12□□□□□ -2.39
RDS3YPR094W SAM1P10659 382 aaKnown RBP0.12□□□□□ -2.39
RDS3YPR094W SAM2P19358 384 aaKnown RBP0.12□□□□□ -2.39
RDS3YPR094W OLE1P21147 510 aaKnown RBP0.12□□□□□ -2.39
RDS3YPR094W CLB4P24871 460 aa0.12□□□□□ -2.39
RDS3YPR094W CSE2P33308 149 aa0.12□□□□□ -2.39
RDS3YPR094W YKL100CP34248 587 aa0.12□□□□□ -2.39
RDS3YPR094W MIG3P39943 394 aa0.12□□□□□ -2.39
RDS3YPR094W DFG10P40526 253 aa0.12□□□□□ -2.39
RDS3YPR094W RPS7BP48164 190 aaKnown RBP0.12□□□□□ -2.39
RDS3YPR094W RPN14P53196 417 aa0.12□□□□□ -2.39
RDS3YPR094W PCP1P53259 346 aa0.12□□□□□ -2.39
RDS3YPR094W GPI1P53306 609 aa0.12□□□□□ -2.39
RDS3YPR094W MKC7P53379 596 aa0.12□□□□□ -2.39
RDS3YPR094W HIM1Q06674 414 aa0.12□□□□□ -2.39
RDS3YPR094W PSK2Q08217 1101 aa0.12□□□□□ -2.39
RDS3YPR094W HRT1Q08273 121 aa0.12□□□□□ -2.39
RDS3YPR094W LEU9Q12166 604 aaKnown RBP0.12□□□□□ -2.39
RDS3YPR094W RAX2Q12465 1220 aa0.12□□□□□ -2.39
RDS3YPR094W YBR085C-AO43137 85 aa0.11□□□□□ -2.39
RDS3YPR094W CBP6P07253 162 aaPredicted RBP0.11□□□□□ -2.39
RDS3YPR094W GLK1P17709 500 aaKnown RBP0.11□□□□□ -2.39
RDS3YPR094W TPS2P31688 896 aaKnown RBP0.11□□□□□ -2.39
RDS3YPR094W CYS4P32582 507 aaKnown RBP0.11□□□□□ -2.39
RDS3YPR094W SPT10P35208 640 aa0.11□□□□□ -2.39
RDS3YPR094W RPL32P38061 130 aaKnown RBP0.11□□□□□ -2.39
RDS3YPR094W YBR137WP38276 179 aa0.11□□□□□ -2.39
RDS3YPR094W YHR210CP38893 341 aa0.11□□□□□ -2.39
RDS3YPR094W REG1Q00816 1014 aa0.11□□□□□ -2.39
RDS3YPR094W INA17Q02888 182 aa0.11□□□□□ -2.39
RDS3YPR094W RBS1Q05672 457 aaKnown RBP0.11□□□□□ -2.39
RDS3YPR094W PIN3Q06449 215 aa0.11□□□□□ -2.39
RDS3YPR094W DNL4Q08387 944 aaPredicted RBP0.11□□□□□ -2.39
RDS3YPR094W YPL199CQ08954 240 aa0.11□□□□□ -2.39
RDS3YPR094W SLF1Q12034 447 aaKnown RBP0.11□□□□□ -2.39
RDS3YPR094W ERG27Q12452 347 aaKnown RBP0.11□□□□□ -2.39
RDS3YPR094W RRD2Q12461 358 aa0.11□□□□□ -2.39
RDS3YPR094W COX4P04037 155 aa0.1□□□□□ -2.39
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